MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007513	TGC	2	6	309517	309522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183880
6002	NC_007513	GTT	2	6	309524	309529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183880
6003	NC_007513	GCG	2	6	309657	309662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183880
6004	NC_007513	CAA	2	6	309671	309676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183880
6005	NC_007513	TC	3	6	310002	310007	0 %	50 %	0 %	50 %	78183880
6006	NC_007513	ACG	2	6	310054	310059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183880
6007	NC_007513	TGG	2	6	310085	310090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183880
6008	NC_007513	GAAAG	2	10	310094	310103	60 %	0 %	40 %	0 %	78183880
6009	NC_007513	GC	3	6	310138	310143	0 %	0 %	50 %	50 %	78183880
6010	NC_007513	TTG	2	6	310164	310169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183880
6011	NC_007513	GTG	2	6	310222	310227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183880
6012	NC_007513	TGA	2	6	310415	310420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183880
6013	NC_007513	ATT	2	6	310425	310430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183880
6014	NC_007513	TGG	2	6	310475	310480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183880
6015	NC_007513	ACT	2	6	310542	310547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183880
6016	NC_007513	CAG	2	6	310557	310562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183880
6017	NC_007513	ACG	2	6	310578	310583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183880
6018	NC_007513	TGGC	2	8	310603	310610	0 %	25 %	50 %	25 %	78183880
6019	NC_007513	GTC	2	6	310712	310717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183880
6020	NC_007513	GTC	2	6	310799	310804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183881
6021	NC_007513	GCT	2	6	310845	310850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183881
6022	NC_007513	CGC	2	6	310900	310905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183881
6023	NC_007513	CAA	2	6	310984	310989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183881
6024	NC_007513	CA	3	6	311042	311047	50 %	0 %	0 %	50 %	78183881
6025	NC_007513	TCGCG	2	10	311163	311172	0 %	20 %	40 %	40 %	78183881
6026	NC_007513	TGA	2	6	311186	311191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183881
6027	NC_007513	GCG	2	6	311263	311268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183881
6028	NC_007513	TTC	2	6	311303	311308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183881
6029	NC_007513	AAG	2	6	311354	311359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183881
6030	NC_007513	TGAA	2	8	311408	311415	50 %	25 %	25 %	0 %	78183881
6031	NC_007513	ACG	2	6	311576	311581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183881
6032	NC_007513	ACC	2	6	311840	311845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183882
6033	NC_007513	GGGAGC	2	12	311890	311901	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78183882
6034	NC_007513	ACG	2	6	311908	311913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183882
6035	NC_007513	CCA	2	6	311921	311926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183882
6036	NC_007513	TGC	2	6	311961	311966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183882
6037	NC_007513	GTC	2	6	312019	312024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183882
6038	NC_007513	TTC	2	6	312130	312135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183882
6039	NC_007513	TCG	2	6	312288	312293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6040	NC_007513	GCTC	2	8	312315	312322	0 %	25 %	25 %	50 %	78183883
6041	NC_007513	TGGT	2	8	312352	312359	0 %	50 %	50 %	0 %	78183883
6042	NC_007513	TGG	2	6	312409	312414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183883
6043	NC_007513	AAC	2	6	312420	312425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183883
6044	NC_007513	CGT	2	6	312643	312648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6045	NC_007513	TGA	2	6	312652	312657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183883
6046	NC_007513	TGT	2	6	312743	312748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183883
6047	NC_007513	AGG	2	6	312780	312785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183883
6048	NC_007513	TGA	2	6	312873	312878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183883
6049	NC_007513	GGA	2	6	312946	312951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183883
6050	NC_007513	GTC	2	6	312962	312967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6051	NC_007513	GC	3	6	312990	312995	0 %	0 %	50 %	50 %	78183883
6052	NC_007513	GGAGTG	2	12	313057	313068	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	78183883
6053	NC_007513	GTC	2	6	313103	313108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6054	NC_007513	CCT	2	6	313123	313128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183883
6055	NC_007513	TC	3	6	313176	313181	0 %	50 %	0 %	50 %	78183883
6056	NC_007513	CAC	2	6	313193	313198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183883
6057	NC_007513	CAC	2	6	313256	313261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183883
6058	NC_007513	CCA	2	6	313321	313326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183883
6059	NC_007513	CAG	2	6	313388	313393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6060	NC_007513	TCG	2	6	313407	313412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6061	NC_007513	AGC	2	6	313415	313420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183883
6062	NC_007513	CTG	2	6	313546	313551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109150040
6063	NC_007513	TGG	2	6	313594	313599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109150040
6064	NC_007513	GCCG	2	8	313665	313672	0 %	0 %	50 %	50 %	109150040
6065	NC_007513	GGT	2	6	313697	313702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109150040
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6069	NC_007513	CAG	2	6	314002	314007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183884
6070	NC_007513	CAC	2	6	314022	314027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183884
6071	NC_007513	CGA	2	6	314093	314098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183884
6072	NC_007513	GTT	2	6	314112	314117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183884
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6077	NC_007513	CTGG	2	8	314261	314268	0 %	25 %	50 %	25 %	78183884
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6095	NC_007513	CCA	2	6	315624	315629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183887
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6105	NC_007513	AGC	2	6	316310	316315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183887
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6108	NC_007513	GCGAT	2	10	316518	316527	20 %	20 %	40 %	20 %	78183888
6109	NC_007513	GCA	2	6	316584	316589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183888
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6112	NC_007513	CAG	2	6	316733	316738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183888
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6117	NC_007513	CGG	2	6	316966	316971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183888
6118	NC_007513	CA	3	6	316985	316990	50 %	0 %	0 %	50 %	78183888
6119	NC_007513	ACG	2	6	316994	316999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183888
6120	NC_007513	CGA	2	6	317038	317043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183888
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6122	NC_007513	GCAG	2	8	317114	317121	25 %	0 %	50 %	25 %	78183888
6123	NC_007513	GCTC	2	8	317262	317269	0 %	25 %	25 %	50 %	78183888
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6131	NC_007513	TGC	2	6	317595	317600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183889
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6493	NC_007513	TGG	2	6	335956	335961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183904
6494	NC_007513	GCC	2	6	335967	335972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183904
6495	NC_007513	GCC	2	6	336000	336005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183904
6496	NC_007513	ACTG	2	8	336090	336097	25 %	25 %	25 %	25 %	78183904
6497	NC_007513	GCA	2	6	336201	336206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183904
6498	NC_007513	CTG	2	6	336207	336212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183904
6499	NC_007513	CGA	2	6	336245	336250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183904
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