MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 26632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007432	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787564
2	NC_007432	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787564
3	NC_007432	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76787564
4	NC_007432	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787564
5	NC_007432	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787564
6	NC_007432	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787564
7	NC_007432	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787564
8	NC_007432	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787564
9	NC_007432	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787564
10	NC_007432	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787564
11	NC_007432	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76787564
12	NC_007432	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787564
13	NC_007432	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787564
14	NC_007432	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787564
15	NC_007432	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787013
16	NC_007432	TTA	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787013
17	NC_007432	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787013
18	NC_007432	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787013
19	NC_007432	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787013
20	NC_007432	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787013
21	NC_007432	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787013
22	NC_007432	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787013
23	NC_007432	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787013
24	NC_007432	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787013
25	NC_007432	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787013
26	NC_007432	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787013
27	NC_007432	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76787013
28	NC_007432	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787013
29	NC_007432	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787923
30	NC_007432	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787923
31	NC_007432	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787923
32	NC_007432	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787923
33	NC_007432	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76787923
34	NC_007432	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787923
35	NC_007432	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787923
36	NC_007432	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787923
37	NC_007432	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787923
38	NC_007432	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787923
39	NC_007432	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787923
40	NC_007432	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788139
41	NC_007432	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788139
42	NC_007432	CAG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788043
43	NC_007432	GCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788043
44	NC_007432	TGA	3	9	4793	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
45	NC_007432	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
46	NC_007432	GTT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788043
47	NC_007432	AAC	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788043
48	NC_007432	TGA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
49	NC_007432	TGA	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
50	NC_007432	AGT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
51	NC_007432	GAA	3	9	5217	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
52	NC_007432	TGA	3	9	5237	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
53	NC_007432	ATC	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788043
54	NC_007432	CTG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788043
55	NC_007432	GCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788043
56	NC_007432	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788043
57	NC_007432	ATG	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
58	NC_007432	AAG	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
59	NC_007432	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788043
60	NC_007432	TAG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788043
61	NC_007432	TTG	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787164
62	NC_007432	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787164
63	NC_007432	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787164
64	NC_007432	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787164
65	NC_007432	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787164
66	NC_007432	GAT	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787164
67	NC_007432	CTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787164
68	NC_007432	TAT	2	6	6025	6030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787164
69	NC_007432	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787164
70	NC_007432	ATG	2	6	6135	6140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787164
71	NC_007432	TAT	2	6	6188	6193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787164
72	NC_007432	ATT	2	6	6258	6263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
73	NC_007432	GTG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788164
74	NC_007432	TGA	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
75	NC_007432	GCA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788164
76	NC_007432	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788164
77	NC_007432	CAG	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788164
78	NC_007432	ATT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
79	NC_007432	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788164
80	NC_007432	TGA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
81	NC_007432	ACA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788164
82	NC_007432	CTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76788164
83	NC_007432	TCA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788164
84	NC_007432	TTG	2	6	7393	7398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
85	NC_007432	TTG	2	6	7559	7564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
86	NC_007432	TGT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
87	NC_007432	ATG	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
88	NC_007432	AGA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788164
89	NC_007432	TGA	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
90	NC_007432	TTG	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
91	NC_007432	ATA	2	6	8036	8041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788164
92	NC_007432	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
93	NC_007432	CAA	2	6	8246	8251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76788164
94	NC_007432	CAG	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788164
95	NC_007432	ATT	3	9	8392	8400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
96	NC_007432	TGT	2	6	8427	8432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
97	NC_007432	TGA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
98	NC_007432	TAT	2	6	8679	8684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
99	NC_007432	AGG	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788164
100	NC_007432	AAT	2	6	8883	8888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788164
101	NC_007432	TTG	2	6	8927	8932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
102	NC_007432	GTG	2	6	9134	9139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788164
103	NC_007432	CCA	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76788164
104	NC_007432	CAG	2	6	9302	9307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788164
105	NC_007432	TAG	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788164
106	NC_007432	ATT	2	6	9566	9571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
107	NC_007432	GTT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788164
108	NC_007432	ATT	2	6	9670	9675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788164
109	NC_007432	GAA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788164
110	NC_007432	AGA	2	6	9732	9737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788164
111	NC_007432	CGT	2	6	10074	10079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76786971
112	NC_007432	AAG	2	6	10090	10095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76786971
113	NC_007432	TCA	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76786971
114	NC_007432	TAA	2	6	10187	10192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76786971
115	NC_007432	TTG	2	6	10194	10199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76786971
116	NC_007432	ATT	2	6	10263	10268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786971
117	NC_007432	TGT	2	6	10305	10310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788554
118	NC_007432	GAG	2	6	10366	10371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788554
119	NC_007432	CGT	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788554
120	NC_007432	AAG	2	6	10484	10489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788554
121	NC_007432	TAT	2	6	10603	10608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788554
122	NC_007432	AAT	2	6	10658	10663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788554
123	NC_007432	AAT	2	6	10668	10673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76786916
124	NC_007432	AGA	2	6	10721	10726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76786916
125	NC_007432	GAA	2	6	10801	10806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76786907
126	NC_007432	CTT	2	6	10816	10821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76786907
127	NC_007432	GAG	2	6	10865	10870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76786907
128	NC_007432	AGC	2	6	11151	11156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76786907
129	NC_007432	ATT	2	6	11172	11177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786907
130	NC_007432	CTT	2	6	11187	11192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76786907
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132	NC_007432	TAG	2	6	11271	11276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76786907
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