MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 40228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007432	ATG	2	6	35441	35446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76786855
502	NC_007432	TAT	2	6	35481	35486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786855
503	NC_007432	CAA	2	6	35551	35556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76786855
504	NC_007432	TAA	3	9	35584	35592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76786855
505	NC_007432	TTAT	2	8	35723	35730	25 %	75 %	0 %	0 %	76788085
506	NC_007432	CTA	2	6	35801	35806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788085
507	NC_007432	AAT	2	6	35854	35859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76788085
508	NC_007432	TGGTG	2	10	35898	35907	0 %	40 %	60 %	0 %	76788085
509	NC_007432	A	6	6	35931	35936	100 %	0 %	0 %	0 %	76788085
510	NC_007432	A	6	6	35950	35955	100 %	0 %	0 %	0 %	76788085
511	NC_007432	ATT	2	6	35962	35967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788085
512	NC_007432	GGT	2	6	35976	35981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788085
513	NC_007432	CAG	2	6	35996	36001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788085
514	NC_007432	GAA	2	6	36028	36033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788085
515	NC_007432	TAC	2	6	36067	36072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788085
516	NC_007432	ATG	2	6	36077	36082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788085
517	NC_007432	ATG	2	6	36104	36109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788085
518	NC_007432	ATG	2	6	36137	36142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788085
519	NC_007432	GA	3	6	36164	36169	50 %	0 %	50 %	0 %	76788085
520	NC_007432	ATG	2	6	36257	36262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788085
521	NC_007432	ATC	2	6	36268	36273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788085
522	NC_007432	TGA	2	6	36279	36284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788085
523	NC_007432	ATG	2	6	36695	36700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787165
524	NC_007432	CTT	2	6	36816	36821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787165
525	NC_007432	AAG	2	6	36872	36877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787165
526	NC_007432	AGGTCA	2	12	36905	36916	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76787165
527	NC_007432	GCAGAA	2	12	36952	36963	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	76787165
528	NC_007432	TTC	2	6	37081	37086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787165
529	NC_007432	ATT	2	6	37172	37177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787165
530	NC_007432	AATC	2	8	37181	37188	50 %	25 %	0 %	25 %	76787165
531	NC_007432	ACTGAG	2	12	37201	37212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76787165
532	NC_007432	CA	3	6	37252	37257	50 %	0 %	0 %	50 %	76787165
533	NC_007432	GAA	2	6	37275	37280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787165
534	NC_007432	AT	3	6	37335	37340	50 %	50 %	0 %	0 %	76787165
535	NC_007432	TGA	2	6	37350	37355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787165
536	NC_007432	GTC	2	6	37430	37435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787165
537	NC_007432	CTC	2	6	37519	37524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76787165
538	NC_007432	TGG	2	6	37572	37577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
539	NC_007432	GCA	2	6	37579	37584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787165
540	NC_007432	GGT	2	6	37594	37599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
541	NC_007432	CAGGCG	2	12	37655	37666	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	76787165
542	NC_007432	GCG	2	6	37732	37737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76787165
543	NC_007432	TTC	2	6	37746	37751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787165
544	NC_007432	TGGT	2	8	37841	37848	0 %	50 %	50 %	0 %	76787165
545	NC_007432	GGT	2	6	37912	37917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
546	NC_007432	GGT	2	6	37939	37944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
547	NC_007432	GGT	2	6	38101	38106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
548	NC_007432	GTT	2	6	38233	38238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787165
549	NC_007432	ATC	2	6	38353	38358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787165
550	NC_007432	GTT	2	6	38404	38409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787165
551	NC_007432	GCAC	2	8	38449	38456	25 %	0 %	25 %	50 %	76787165
552	NC_007432	ACC	2	6	38573	38578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76787165
553	NC_007432	GGT	2	6	38584	38589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
554	NC_007432	GAC	2	6	38649	38654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787165
555	NC_007432	TGC	2	6	38718	38723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787165
556	NC_007432	CTT	2	6	38857	38862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787165
557	NC_007432	GGT	2	6	38905	38910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
558	NC_007432	ACC	2	6	38949	38954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76787165
559	NC_007432	GAC	2	6	38976	38981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787165
560	NC_007432	TC	4	8	39000	39007	0 %	50 %	0 %	50 %	76787165
561	NC_007432	CTA	2	6	39036	39041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787165
562	NC_007432	AGA	2	6	39063	39068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787165
563	NC_007432	CTG	2	6	39137	39142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787165
564	NC_007432	GGT	2	6	39160	39165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787165
565	NC_007432	CAG	2	6	39237	39242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787165
566	NC_007432	AGC	2	6	39375	39380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787165
567	NC_007432	GAA	2	6	39439	39444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787165
568	NC_007432	CTG	2	6	39449	39454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787165
569	NC_007432	TCA	2	6	39470	39475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787165
570	NC_007432	GCT	2	6	39613	39618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787165
571	NC_007432	ATC	2	6	39667	39672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787165
572	NC_007432	CAG	2	6	39692	39697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787165
573	NC_007432	ATC	2	6	39796	39801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787165
574	NC_007432	TCT	2	6	39840	39845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787165
575	NC_007432	CT	3	6	39887	39892	0 %	50 %	0 %	50 %	76787165
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581	NC_007432	AATC	2	8	40728	40735	50 %	25 %	0 %	25 %	76788351
582	NC_007432	CCT	2	6	40933	40938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76788351
583	NC_007432	TCG	2	6	40967	40972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788351
584	NC_007432	AAG	2	6	41005	41010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788351
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589	NC_007432	TGA	2	6	41249	41254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788351
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591	NC_007432	GCT	2	6	41424	41429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788351
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593	NC_007432	A	6	6	41477	41482	100 %	0 %	0 %	0 %	76788351
594	NC_007432	GTT	2	6	41586	41591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788351
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597	NC_007432	AATT	2	8	41743	41750	50 %	50 %	0 %	0 %	76788351
598	NC_007432	GT	3	6	41775	41780	0 %	50 %	50 %	0 %	76788351
599	NC_007432	ATT	2	6	41784	41789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788351
600	NC_007432	TC	3	6	41810	41815	0 %	50 %	0 %	50 %	76788351
601	NC_007432	TTGA	2	8	41826	41833	25 %	50 %	25 %	0 %	76788351
602	NC_007432	TGG	2	6	41864	41869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76788351
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605	NC_007432	A	6	6	41950	41955	100 %	0 %	0 %	0 %	76788351
606	NC_007432	A	7	7	42019	42025	100 %	0 %	0 %	0 %	76787420
607	NC_007432	A	7	7	42083	42089	100 %	0 %	0 %	0 %	76787420
608	NC_007432	TGG	2	6	42140	42145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787420
609	NC_007432	AG	3	6	42174	42179	50 %	0 %	50 %	0 %	76787420
610	NC_007432	TG	3	6	42277	42282	0 %	50 %	50 %	0 %	76787420
611	NC_007432	ATT	2	6	42291	42296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787420
612	NC_007432	GCA	2	6	42297	42302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76787420
613	NC_007432	TGG	2	6	42422	42427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787420
614	NC_007432	GTAT	2	8	42448	42455	25 %	50 %	25 %	0 %	76787420
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617	NC_007432	TTC	2	6	42547	42552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787420
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620	NC_007432	TTC	2	6	42670	42675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787420
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622	NC_007432	GAT	2	6	42795	42800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787420
623	NC_007432	GAA	2	6	42882	42887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787420
624	NC_007432	ATC	2	6	42996	43001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787420
625	NC_007432	GTG	2	6	43020	43025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787420
626	NC_007432	AGCAG	2	10	43252	43261	40 %	0 %	40 %	20 %	76788568
627	NC_007432	AGTT	2	8	43267	43274	25 %	50 %	25 %	0 %	76788568
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