MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 3563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007385	CAC	2	6	153814	153819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315013
2502	NC_007385	CAGTTG	2	12	153860	153871	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	74315013
2503	NC_007385	TCA	2	6	153894	153899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315013
2504	NC_007385	CAT	2	6	153910	153915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315013
2505	NC_007385	TGA	2	6	153942	153947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315013
2506	NC_007385	TCC	2	6	154029	154034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315013
2507	NC_007385	CTC	2	6	154130	154135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74315013
2508	NC_007385	GCG	2	6	154161	154166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315013
2509	NC_007385	GAAA	2	8	154260	154267	75 %	0 %	25 %	0 %	74315013
2510	NC_007385	AG	3	6	154309	154314	50 %	0 %	50 %	0 %	74315013
2511	NC_007385	CCA	2	6	154327	154332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315013
2512	NC_007385	CAG	2	6	154366	154371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315013
2513	NC_007385	T	6	6	154381	154386	0 %	100 %	0 %	0 %	74315013
2514	NC_007385	CCG	2	6	154414	154419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315013
2515	NC_007385	CAA	2	6	154423	154428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315013
2516	NC_007385	CTG	2	6	154460	154465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315013
2517	NC_007385	ATC	3	9	154466	154474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315013
2518	NC_007385	GTT	3	9	154570	154578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315013
2519	NC_007385	TCA	2	6	154590	154595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315013
2520	NC_007385	CAC	2	6	154598	154603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315013
2521	NC_007385	GAA	2	6	154612	154617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315013
2522	NC_007385	AT	3	6	154647	154652	50 %	50 %	0 %	0 %	74315013
2523	NC_007385	T	6	6	154802	154807	0 %	100 %	0 %	0 %	74315013
2524	NC_007385	CGT	2	6	154872	154877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315013
2525	NC_007385	A	6	6	154880	154885	100 %	0 %	0 %	0 %	74315013
2526	NC_007385	AAC	2	6	154917	154922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315013
2527	NC_007385	TAA	2	6	155239	155244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315014
2528	NC_007385	CCG	2	6	155380	155385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315014
2529	NC_007385	AT	3	6	155488	155493	50 %	50 %	0 %	0 %	74315014
2530	NC_007385	A	7	7	155495	155501	100 %	0 %	0 %	0 %	74315014
2531	NC_007385	CGG	2	6	155723	155728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315015
2532	NC_007385	CAT	2	6	155755	155760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315015
2533	NC_007385	CTG	2	6	155876	155881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315015
2534	NC_007385	CA	3	6	155944	155949	50 %	0 %	0 %	50 %	74315015
2535	NC_007385	CCA	2	6	156097	156102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74315015
2536	NC_007385	TAA	2	6	156265	156270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315015
2537	NC_007385	CGT	2	6	156329	156334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315015
2538	NC_007385	ATC	2	6	156381	156386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315015
2539	NC_007385	GCT	2	6	156392	156397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315015
2540	NC_007385	A	7	7	156399	156405	100 %	0 %	0 %	0 %	74315015
2541	NC_007385	ATC	2	6	156726	156731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315016
2542	NC_007385	GTCA	2	8	156734	156741	25 %	25 %	25 %	25 %	74315016
2543	NC_007385	AAATG	2	10	156786	156795	60 %	20 %	20 %	0 %	74315016
2544	NC_007385	AAC	2	6	156806	156811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315016
2545	NC_007385	TCA	2	6	156824	156829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315016
2546	NC_007385	T	7	7	156842	156848	0 %	100 %	0 %	0 %	74315016
2547	NC_007385	TGA	2	6	156892	156897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315016
2548	NC_007385	TTA	2	6	156932	156937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315016
2549	NC_007385	T	7	7	156963	156969	0 %	100 %	0 %	0 %	74315016
2550	NC_007385	TCTGG	2	10	157112	157121	0 %	40 %	40 %	20 %	74315016
2551	NC_007385	AGTTC	2	10	157167	157176	20 %	40 %	20 %	20 %	74315016
2552	NC_007385	GAA	2	6	157181	157186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315016
2553	NC_007385	TTG	2	6	157211	157216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315016
2554	NC_007385	GA	3	6	157222	157227	50 %	0 %	50 %	0 %	74315016
2555	NC_007385	GAAA	2	8	157234	157241	75 %	0 %	25 %	0 %	74315016
2556	NC_007385	TTA	2	6	157282	157287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315016
2557	NC_007385	GAA	2	6	157313	157318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315016
2558	NC_007385	TAT	2	6	157328	157333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315016
2559	NC_007385	TA	3	6	157335	157340	50 %	50 %	0 %	0 %	74315016
2560	NC_007385	AGAA	2	8	157345	157352	75 %	0 %	25 %	0 %	74315016
2561	NC_007385	GAAT	2	8	157353	157360	50 %	25 %	25 %	0 %	74315016
2562	NC_007385	GAA	2	6	157389	157394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315016
2563	NC_007385	GAC	2	6	157434	157439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315016
2564	NC_007385	T	6	6	157440	157445	0 %	100 %	0 %	0 %	74315016
2565	NC_007385	ACA	2	6	157451	157456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315016
2566	NC_007385	T	7	7	157460	157466	0 %	100 %	0 %	0 %	74315016
2567	NC_007385	GAT	2	6	157505	157510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315016
2568	NC_007385	TAA	2	6	157511	157516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315016
2569	NC_007385	ATC	2	6	157536	157541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315017
2570	NC_007385	GGT	2	6	157552	157557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315017
2571	NC_007385	GAA	2	6	157593	157598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315017
2572	NC_007385	TTG	2	6	157793	157798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315017
2573	NC_007385	T	6	6	157877	157882	0 %	100 %	0 %	0 %	74315017
2574	NC_007385	AGGA	2	8	157946	157953	50 %	0 %	50 %	0 %	74315017
2575	NC_007385	TGT	2	6	157971	157976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315017
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2577	NC_007385	TGGC	2	8	158047	158054	0 %	25 %	50 %	25 %	74315017
2578	NC_007385	GAC	2	6	158156	158161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315017
2579	NC_007385	GTTG	2	8	158168	158175	0 %	50 %	50 %	0 %	74315017
2580	NC_007385	GCAT	2	8	158237	158244	25 %	25 %	25 %	25 %	74315017
2581	NC_007385	GAT	2	6	158245	158250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315017
2582	NC_007385	GCC	2	6	158278	158283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315017
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2584	NC_007385	TGGTA	2	10	158337	158346	20 %	40 %	40 %	0 %	74315017
2585	NC_007385	TGG	2	6	158394	158399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74315017
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2588	NC_007385	TAA	2	6	158451	158456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315017
2589	NC_007385	T	7	7	158484	158490	0 %	100 %	0 %	0 %	74315017
2590	NC_007385	AGA	2	6	158541	158546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315017
2591	NC_007385	TAA	2	6	158559	158564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315017
2592	NC_007385	GTAA	2	8	158618	158625	50 %	25 %	25 %	0 %	74315018
2593	NC_007385	T	6	6	158658	158663	0 %	100 %	0 %	0 %	74315018
2594	NC_007385	ATT	2	6	158757	158762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315018
2595	NC_007385	G	6	6	158852	158857	0 %	0 %	100 %	0 %	74315018
2596	NC_007385	AT	3	6	158878	158883	50 %	50 %	0 %	0 %	74315018
2597	NC_007385	TGT	2	6	159042	159047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315018
2598	NC_007385	AC	3	6	159112	159117	50 %	0 %	0 %	50 %	74315018
2599	NC_007385	ATT	2	6	159215	159220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74315018
2600	NC_007385	TGA	2	6	159240	159245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315018
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2602	NC_007385	TTG	2	6	159336	159341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315018
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2604	NC_007385	A	6	6	159446	159451	100 %	0 %	0 %	0 %	74315018
2605	NC_007385	TTG	2	6	159479	159484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74315018
2606	NC_007385	A	6	6	159627	159632	100 %	0 %	0 %	0 %	74315019
2607	NC_007385	TTCA	2	8	159740	159747	25 %	50 %	0 %	25 %	74315019
2608	NC_007385	TGGG	2	8	159777	159784	0 %	25 %	75 %	0 %	74315019
2609	NC_007385	TCG	2	6	159803	159808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74315019
2610	NC_007385	CGA	2	6	159814	159819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74315019
2611	NC_007385	AAT	2	6	159866	159871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74315019
2612	NC_007385	TGA	2	6	159910	159915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315019
2613	NC_007385	A	6	6	160081	160086	100 %	0 %	0 %	0 %	74315019
2614	NC_007385	GCC	2	6	160089	160094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315019
2615	NC_007385	TCA	2	6	160100	160105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74315019
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2617	NC_007385	G	6	6	160158	160163	0 %	0 %	100 %	0 %	74315019
2618	NC_007385	GGA	2	6	160178	160183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74315019
2619	NC_007385	TCAG	2	8	160202	160209	25 %	25 %	25 %	25 %	74315019
2620	NC_007385	T	7	7	160280	160286	0 %	100 %	0 %	0 %	74315019
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2622	NC_007385	TGA	2	6	160324	160329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74315019
2623	NC_007385	TCAG	2	8	160333	160340	25 %	25 %	25 %	25 %	74315019
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2625	NC_007385	A	8	8	160375	160382	100 %	0 %	0 %	0 %	74315019
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2997	NC_007385	CAA	2	6	184808	184813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74315045
2998	NC_007385	GGC	2	6	184911	184916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74315045
2999	NC_007385	CGC	2	6	184928	184933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74315045
3000	NC_007385	AAG	2	6	185174	185179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74315046

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