MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 3563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_007385	AGAA	2	8	94892	94899	75 %	0 %	25 %	0 %	74314939
1503	NC_007385	CAT	2	6	94960	94965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314939
1504	NC_007385	ATG	2	6	94970	94975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314939
1505	NC_007385	GTT	2	6	94978	94983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314940
1506	NC_007385	AAG	2	6	95041	95046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314940
1507	NC_007385	A	6	6	95077	95082	100 %	0 %	0 %	0 %	74314940
1508	NC_007385	ATT	2	6	95152	95157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314940
1509	NC_007385	AGA	2	6	95197	95202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314940
1510	NC_007385	TA	3	6	95215	95220	50 %	50 %	0 %	0 %	74314940
1511	NC_007385	ATG	2	6	95246	95251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314940
1512	NC_007385	ATT	2	6	95398	95403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314940
1513	NC_007385	AAT	2	6	95422	95427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314940
1514	NC_007385	TA	3	6	95428	95433	50 %	50 %	0 %	0 %	74314940
1515	NC_007385	AGT	2	6	95451	95456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314940
1516	NC_007385	A	6	6	95517	95522	100 %	0 %	0 %	0 %	74314940
1517	NC_007385	A	6	6	95527	95532	100 %	0 %	0 %	0 %	74314940
1518	NC_007385	AGA	2	6	95574	95579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314940
1519	NC_007385	AAAT	2	8	95613	95620	75 %	25 %	0 %	0 %	74314941
1520	NC_007385	GCAA	2	8	95621	95628	50 %	0 %	25 %	25 %	74314941
1521	NC_007385	GCA	2	6	95635	95640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314941
1522	NC_007385	GAA	2	6	95654	95659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314941
1523	NC_007385	GA	3	6	95675	95680	50 %	0 %	50 %	0 %	74314941
1524	NC_007385	ATC	2	6	95683	95688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314941
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1529	NC_007385	A	6	6	95832	95837	100 %	0 %	0 %	0 %	74314941
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1531	NC_007385	CAT	2	6	95901	95906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314941
1532	NC_007385	AT	3	6	95912	95917	50 %	50 %	0 %	0 %	74314941
1533	NC_007385	ATTA	2	8	95959	95966	50 %	50 %	0 %	0 %	74314941
1534	NC_007385	GA	3	6	95983	95988	50 %	0 %	50 %	0 %	74314941
1535	NC_007385	GAT	2	6	95993	95998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314941
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1545	NC_007385	ATTGT	2	10	96422	96431	20 %	60 %	20 %	0 %	74314942
1546	NC_007385	T	9	9	96561	96569	0 %	100 %	0 %	0 %	74314943
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1557	NC_007385	AAT	2	6	97065	97070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314943
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1559	NC_007385	A	7	7	97161	97167	100 %	0 %	0 %	0 %	74314943
1560	NC_007385	A	6	6	97174	97179	100 %	0 %	0 %	0 %	74314943
1561	NC_007385	CT	3	6	97199	97204	0 %	50 %	0 %	50 %	74314944
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1565	NC_007385	T	7	7	97311	97317	0 %	100 %	0 %	0 %	74314944
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1572	NC_007385	AT	3	6	97526	97531	50 %	50 %	0 %	0 %	74314944
1573	NC_007385	TA	3	6	97621	97626	50 %	50 %	0 %	0 %	74314944
1574	NC_007385	TCC	2	6	97632	97637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314944
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1587	NC_007385	TAA	2	6	98493	98498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314944
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1598	NC_007385	TGGCT	2	10	99000	99009	0 %	40 %	40 %	20 %	74314945
1599	NC_007385	TGA	2	6	99033	99038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314945
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1601	NC_007385	GAA	2	6	99133	99138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314945
1602	NC_007385	AGAC	2	8	99213	99220	50 %	0 %	25 %	25 %	74314945
1603	NC_007385	TGAA	2	8	99275	99282	50 %	25 %	25 %	0 %	74314945
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1610	NC_007385	CAA	2	6	99470	99475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314945
1611	NC_007385	TA	3	6	99484	99489	50 %	50 %	0 %	0 %	74314945
1612	NC_007385	AATT	2	8	99620	99627	50 %	50 %	0 %	0 %	74314945
1613	NC_007385	GAT	2	6	99636	99641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314945
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1616	NC_007385	TAT	2	6	99734	99739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314945
1617	NC_007385	AT	3	6	99738	99743	50 %	50 %	0 %	0 %	74314945
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2000	NC_007385	GGC	2	6	121498	121503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314972

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