MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 3563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007385	TGG	2	6	70548	70553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314912
1002	NC_007385	GTC	2	6	70565	70570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314912
1003	NC_007385	CGT	3	9	70580	70588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314912
1004	NC_007385	GTG	2	6	70733	70738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314913
1005	NC_007385	TC	3	6	70769	70774	0 %	50 %	0 %	50 %	74314913
1006	NC_007385	GGCT	2	8	70892	70899	0 %	25 %	50 %	25 %	74314913
1007	NC_007385	GCA	2	6	70913	70918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314913
1008	NC_007385	TGC	2	6	70963	70968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314913
1009	NC_007385	TAT	2	6	71006	71011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314913
1010	NC_007385	GCA	2	6	71050	71055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314913
1011	NC_007385	GCG	2	6	71086	71091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314913
1012	NC_007385	CAA	2	6	71135	71140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314913
1013	NC_007385	GCT	2	6	71365	71370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314914
1014	NC_007385	TG	3	6	71454	71459	0 %	50 %	50 %	0 %	74314914
1015	NC_007385	GAT	2	6	71489	71494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314914
1016	NC_007385	TCA	2	6	71585	71590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314914
1017	NC_007385	A	6	6	71610	71615	100 %	0 %	0 %	0 %	74314914
1018	NC_007385	ACA	2	6	71621	71626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314915
1019	NC_007385	GCAG	2	8	71667	71674	25 %	0 %	50 %	25 %	74314915
1020	NC_007385	CTG	2	6	71685	71690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314915
1021	NC_007385	CTG	2	6	71695	71700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314915
1022	NC_007385	GCG	2	6	71713	71718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314915
1023	NC_007385	GCC	2	6	71722	71727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314915
1024	NC_007385	ACG	2	6	71733	71738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314915
1025	NC_007385	GCTG	2	8	71762	71769	0 %	25 %	50 %	25 %	74314915
1026	NC_007385	GTG	2	6	71798	71803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314915
1027	NC_007385	TGG	2	6	71851	71856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314915
1028	NC_007385	GCGA	2	8	72130	72137	25 %	0 %	50 %	25 %	161986603
1029	NC_007385	TGC	2	6	72200	72205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1030	NC_007385	CT	3	6	72267	72272	0 %	50 %	0 %	50 %	161986603
1031	NC_007385	CCG	2	6	72301	72306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986603
1032	NC_007385	TTC	2	6	72309	72314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986603
1033	NC_007385	CCACT	2	10	72386	72395	20 %	20 %	0 %	60 %	161986603
1034	NC_007385	GAC	2	6	72399	72404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1035	NC_007385	GCG	2	6	72422	72427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986603
1036	NC_007385	GCC	2	6	72473	72478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986603
1037	NC_007385	CAGTG	2	10	72492	72501	20 %	20 %	40 %	20 %	161986603
1038	NC_007385	CAG	2	6	72513	72518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1039	NC_007385	TC	4	8	72542	72549	0 %	50 %	0 %	50 %	161986603
1040	NC_007385	CAG	2	6	72558	72563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1041	NC_007385	CTTT	2	8	72597	72604	0 %	75 %	0 %	25 %	161986603
1042	NC_007385	CAG	2	6	72646	72651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1043	NC_007385	AGC	2	6	72747	72752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1044	NC_007385	CGA	2	6	72762	72767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1045	NC_007385	ATC	2	6	72824	72829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986603
1046	NC_007385	GAC	2	6	72835	72840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986603
1047	NC_007385	GCG	2	6	72842	72847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986603
1048	NC_007385	CCAT	2	8	72849	72856	25 %	25 %	0 %	50 %	161986603
1049	NC_007385	T	6	6	72971	72976	0 %	100 %	0 %	0 %	74314917
1050	NC_007385	CTT	2	6	72996	73001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314917
1051	NC_007385	GAG	2	6	73003	73008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314917
1052	NC_007385	GGC	2	6	73066	73071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314917
1053	NC_007385	AAC	2	6	73090	73095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314917
1054	NC_007385	CGG	2	6	73104	73109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314917
1055	NC_007385	CAG	2	6	73113	73118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314917
1056	NC_007385	CTTC	2	8	73124	73131	0 %	50 %	0 %	50 %	74314917
1057	NC_007385	CTGG	2	8	73159	73166	0 %	25 %	50 %	25 %	74314917
1058	NC_007385	CTG	2	6	73222	73227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314917
1059	NC_007385	TG	3	6	73247	73252	0 %	50 %	50 %	0 %	74314917
1060	NC_007385	ATCA	2	8	73285	73292	50 %	25 %	0 %	25 %	74314917
1061	NC_007385	CAT	2	6	73578	73583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314918
1062	NC_007385	CGT	2	6	73603	73608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314918
1063	NC_007385	GTA	2	6	73665	73670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314918
1064	NC_007385	GCG	2	6	73696	73701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314918
1065	NC_007385	AAC	2	6	73714	73719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314918
1066	NC_007385	TTA	2	6	73735	73740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314918
1067	NC_007385	AGC	2	6	73812	73817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314918
1068	NC_007385	GAG	2	6	73860	73865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314918
1069	NC_007385	TGA	2	6	73982	73987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314918
1070	NC_007385	TAC	2	6	74010	74015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314918
1071	NC_007385	ACG	3	9	74038	74046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314918
1072	NC_007385	CTG	2	6	74075	74080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314918
1073	NC_007385	CTT	2	6	74130	74135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314918
1074	NC_007385	AGCGA	2	10	74143	74152	40 %	0 %	40 %	20 %	74314918
1075	NC_007385	CCG	2	6	74192	74197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314918
1076	NC_007385	ATC	3	9	74298	74306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314918
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1080	NC_007385	GCTG	2	8	74536	74543	0 %	25 %	50 %	25 %	74314918
1081	NC_007385	CAA	2	6	74546	74551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314918
1082	NC_007385	CAG	2	6	74553	74558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314918
1083	NC_007385	TGT	2	6	74569	74574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314918
1084	NC_007385	GTTT	2	8	74600	74607	0 %	75 %	25 %	0 %	74314918
1085	NC_007385	TCG	2	6	74608	74613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314918
1086	NC_007385	T	6	6	75014	75019	0 %	100 %	0 %	0 %	74314919
1087	NC_007385	CTG	2	6	75044	75049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314919
1088	NC_007385	CAGC	2	8	75119	75126	25 %	0 %	25 %	50 %	74314919
1089	NC_007385	ACCTT	2	10	75237	75246	20 %	40 %	0 %	40 %	74314919
1090	NC_007385	GA	3	6	75280	75285	50 %	0 %	50 %	0 %	74314919
1091	NC_007385	ACA	2	6	75385	75390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314919
1092	NC_007385	CG	3	6	75394	75399	0 %	0 %	50 %	50 %	74314919
1093	NC_007385	CAC	2	6	75403	75408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314919
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1095	NC_007385	ACA	2	6	75481	75486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314919
1096	NC_007385	GTC	2	6	75568	75573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314919
1097	NC_007385	CGAAC	2	10	75586	75595	40 %	0 %	20 %	40 %	74314919
1098	NC_007385	GCTCCT	2	12	75601	75612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	74314919
1099	NC_007385	GA	4	8	75621	75628	50 %	0 %	50 %	0 %	74314919
1100	NC_007385	GAAT	2	8	75631	75638	50 %	25 %	25 %	0 %	74314919
1101	NC_007385	GCGA	2	8	75686	75693	25 %	0 %	50 %	25 %	74314919
1102	NC_007385	CAG	2	6	75778	75783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314919
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1105	NC_007385	CAT	2	6	76226	76231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314920
1106	NC_007385	GGA	2	6	76361	76366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314920
1107	NC_007385	AAC	2	6	77294	77299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314921
1108	NC_007385	GTTAT	2	10	77335	77344	20 %	60 %	20 %	0 %	74314921
1109	NC_007385	AT	3	6	77379	77384	50 %	50 %	0 %	0 %	74314921
1110	NC_007385	TCA	2	6	77391	77396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314921
1111	NC_007385	GTT	2	6	77438	77443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314921
1112	NC_007385	T	6	6	77442	77447	0 %	100 %	0 %	0 %	74314921
1113	NC_007385	TGC	2	6	77499	77504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314921
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1115	NC_007385	ATA	2	6	77651	77656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314921
1116	NC_007385	CTT	2	6	77707	77712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314921
1117	NC_007385	GAA	2	6	77734	77739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314921
1118	NC_007385	T	6	6	77747	77752	0 %	100 %	0 %	0 %	74314921
1119	NC_007385	TTTA	2	8	77767	77774	25 %	75 %	0 %	0 %	74314921
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1122	NC_007385	ATT	2	6	77957	77962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314921
1123	NC_007385	AAG	3	9	77991	77999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314921
1124	NC_007385	TC	3	6	79064	79069	0 %	50 %	0 %	50 %	74314922
1125	NC_007385	TGTTT	2	10	79075	79084	0 %	80 %	20 %	0 %	74314922
1126	NC_007385	TGTT	2	8	79113	79120	0 %	75 %	25 %	0 %	74314922
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