MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 3563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007385	TCCT	2	8	35833	35840	0 %	50 %	0 %	50 %	74314877
502	NC_007385	GCGG	2	8	35845	35852	0 %	0 %	75 %	25 %	74314877
503	NC_007385	TGCC	2	8	35988	35995	0 %	25 %	25 %	50 %	74314877
504	NC_007385	A	6	6	36006	36011	100 %	0 %	0 %	0 %	74314877
505	NC_007385	GCT	2	6	36126	36131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314877
506	NC_007385	CTG	2	6	36163	36168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314877
507	NC_007385	GCC	2	6	36172	36177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314877
508	NC_007385	TCT	2	6	36203	36208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314877
509	NC_007385	CGT	2	6	36229	36234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314877
510	NC_007385	ACG	2	6	36418	36423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314877
511	NC_007385	GGA	2	6	36457	36462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314877
512	NC_007385	A	7	7	36487	36493	100 %	0 %	0 %	0 %	74314877
513	NC_007385	CGGC	2	8	36494	36501	0 %	0 %	50 %	50 %	74314877
514	NC_007385	GGA	2	6	36503	36508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314877
515	NC_007385	GC	3	6	36514	36519	0 %	0 %	50 %	50 %	74314877
516	NC_007385	GAA	2	6	36537	36542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314877
517	NC_007385	GCC	2	6	36543	36548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314877
518	NC_007385	T	6	6	36694	36699	0 %	100 %	0 %	0 %	74314877
519	NC_007385	GT	3	6	36736	36741	0 %	50 %	50 %	0 %	74314877
520	NC_007385	GA	3	6	36743	36748	50 %	0 %	50 %	0 %	74314877
521	NC_007385	GGAT	2	8	36776	36783	25 %	25 %	50 %	0 %	74314877
522	NC_007385	TG	3	6	36863	36868	0 %	50 %	50 %	0 %	74314877
523	NC_007385	CCG	2	6	36885	36890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314877
524	NC_007385	GAA	2	6	36921	36926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314877
525	NC_007385	CG	3	6	36930	36935	0 %	0 %	50 %	50 %	74314877
526	NC_007385	CTG	2	6	36946	36951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314877
527	NC_007385	T	6	6	37230	37235	0 %	100 %	0 %	0 %	74314878
528	NC_007385	ATA	2	6	37269	37274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314878
529	NC_007385	CAT	2	6	37331	37336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314878
530	NC_007385	TGC	2	6	37368	37373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314878
531	NC_007385	ATG	2	6	37374	37379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314878
532	NC_007385	AAG	2	6	37392	37397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314878
533	NC_007385	TTG	2	6	37401	37406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314878
534	NC_007385	TCT	2	6	37493	37498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314878
535	NC_007385	T	7	7	37504	37510	0 %	100 %	0 %	0 %	74314878
536	NC_007385	CAA	2	6	37511	37516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314878
537	NC_007385	AGA	2	6	37545	37550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314878
538	NC_007385	TATCGA	2	12	37554	37565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	74314878
539	NC_007385	TA	3	6	37568	37573	50 %	50 %	0 %	0 %	74314878
540	NC_007385	TCA	2	6	37582	37587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314878
541	NC_007385	TCTT	2	8	37622	37629	0 %	75 %	0 %	25 %	74314878
542	NC_007385	CCT	3	9	37676	37684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314878
543	NC_007385	AG	3	6	37686	37691	50 %	0 %	50 %	0 %	74314878
544	NC_007385	T	7	7	37700	37706	0 %	100 %	0 %	0 %	74314878
545	NC_007385	ATT	2	6	37762	37767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314878
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547	NC_007385	TAA	3	9	37779	37787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314878
548	NC_007385	T	7	7	37833	37839	0 %	100 %	0 %	0 %	74314878
549	NC_007385	ATA	2	6	37951	37956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314878
550	NC_007385	CAT	2	6	38007	38012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314878
551	NC_007385	AAC	2	6	38514	38519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314879
552	NC_007385	TCG	2	6	38720	38725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314879
553	NC_007385	A	6	6	38778	38783	100 %	0 %	0 %	0 %	74314879
554	NC_007385	CTG	2	6	38857	38862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314879
555	NC_007385	GGGCAT	2	12	38908	38919	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74314879
556	NC_007385	GAT	2	6	38928	38933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314879
557	NC_007385	TCT	2	6	38966	38971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314879
558	NC_007385	CGT	2	6	39084	39089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314879
559	NC_007385	AGA	2	6	39095	39100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314879
560	NC_007385	GGCA	2	8	39103	39110	25 %	0 %	50 %	25 %	74314879
561	NC_007385	AGG	2	6	39139	39144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314879
562	NC_007385	GTA	2	6	39171	39176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314879
563	NC_007385	TTA	2	6	39208	39213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314879
564	NC_007385	GCA	2	6	39334	39339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314879
565	NC_007385	A	6	6	39430	39435	100 %	0 %	0 %	0 %	74314879
566	NC_007385	CCCCG	2	10	39450	39459	0 %	0 %	20 %	80 %	74314879
567	NC_007385	TTG	2	6	39547	39552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314879
568	NC_007385	TGTC	2	8	39604	39611	0 %	50 %	25 %	25 %	74314879
569	NC_007385	CAA	2	6	39615	39620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314879
570	NC_007385	A	6	6	39637	39642	100 %	0 %	0 %	0 %	74314879
571	NC_007385	AG	3	6	40123	40128	50 %	0 %	50 %	0 %	74314880
572	NC_007385	ACG	2	6	40147	40152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314880
573	NC_007385	CAGT	2	8	40154	40161	25 %	25 %	25 %	25 %	74314880
574	NC_007385	GAAG	2	8	40206	40213	50 %	0 %	50 %	0 %	74314880
575	NC_007385	TC	3	6	40314	40319	0 %	50 %	0 %	50 %	74314880
576	NC_007385	ATC	2	6	40589	40594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314881
577	NC_007385	TAT	3	9	40614	40622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314881
578	NC_007385	TAC	2	6	40633	40638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314881
579	NC_007385	A	6	6	40661	40666	100 %	0 %	0 %	0 %	74314881
580	NC_007385	TA	3	6	40672	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	74314881
581	NC_007385	CTG	2	6	40692	40697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314881
582	NC_007385	TTG	2	6	40770	40775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314881
583	NC_007385	CAT	2	6	41214	41219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314882
584	NC_007385	CGT	2	6	41239	41244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314882
585	NC_007385	GTA	2	6	41301	41306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314882
586	NC_007385	GCG	2	6	41332	41337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314882
587	NC_007385	AAC	2	6	41350	41355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314882
588	NC_007385	TTA	2	6	41371	41376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314882
589	NC_007385	AGC	2	6	41448	41453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314882
590	NC_007385	GAG	2	6	41496	41501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314882
591	NC_007385	AGCGA	2	10	41789	41798	40 %	0 %	40 %	20 %	74314883
592	NC_007385	CCG	2	6	41838	41843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314883
593	NC_007385	ATC	3	9	41944	41952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314883
594	NC_007385	GCGT	2	8	42003	42010	0 %	25 %	50 %	25 %	74314883
595	NC_007385	ATG	2	6	42044	42049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314883
596	NC_007385	GCG	2	6	42100	42105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314883
597	NC_007385	GCTG	2	8	42182	42189	0 %	25 %	50 %	25 %	74314883
598	NC_007385	CAA	2	6	42192	42197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314883
599	NC_007385	CAG	2	6	42199	42204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314883
600	NC_007385	TGT	2	6	42215	42220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314883
601	NC_007385	GTTT	2	8	42246	42253	0 %	75 %	25 %	0 %	74314883
602	NC_007385	TCG	2	6	42254	42259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314883
603	NC_007385	GGC	2	6	42308	42313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314883
604	NC_007385	CA	3	6	42377	42382	50 %	0 %	0 %	50 %	74314884
605	NC_007385	AAT	2	6	42448	42453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314884
606	NC_007385	CCT	2	6	42497	42502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74314884
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608	NC_007385	GTG	3	9	42636	42644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314884
609	NC_007385	TCCT	2	8	42698	42705	0 %	50 %	0 %	50 %	74314885
610	NC_007385	GCGG	2	8	42710	42717	0 %	0 %	75 %	25 %	74314885
611	NC_007385	TGCC	2	8	42853	42860	0 %	25 %	25 %	50 %	74314885
612	NC_007385	A	6	6	42871	42876	100 %	0 %	0 %	0 %	74314885
613	NC_007385	GCT	2	6	42991	42996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314885
614	NC_007385	CTG	2	6	43028	43033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314885
615	NC_007385	GCC	2	6	43037	43042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314885
616	NC_007385	TCT	2	6	43068	43073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314885
617	NC_007385	CGT	2	6	43094	43099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314885
618	NC_007385	ACG	2	6	43283	43288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314885
619	NC_007385	GGA	2	6	43322	43327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314885
620	NC_007385	A	7	7	43352	43358	100 %	0 %	0 %	0 %	74314885
621	NC_007385	CGGC	2	8	43359	43366	0 %	0 %	50 %	50 %	74314885
622	NC_007385	GGA	2	6	43368	43373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314885
623	NC_007385	GC	3	6	43379	43384	0 %	0 %	50 %	50 %	74314885
624	NC_007385	GAA	2	6	43402	43407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314885
625	NC_007385	GCC	2	6	43408	43413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314885
626	NC_007385	T	6	6	43559	43564	0 %	100 %	0 %	0 %	74314885
627	NC_007385	GT	3	6	43601	43606	0 %	50 %	50 %	0 %	74314885
628	NC_007385	GA	3	6	43608	43613	50 %	0 %	50 %	0 %	74314885
629	NC_007385	GGAT	2	8	43641	43648	25 %	25 %	50 %	0 %	74314885
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