MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3003	NC_007384	ATGA	2	8	173788	173795	50 %	25 %	25 %	0 %	161986591
3004	NC_007384	TCG	2	6	173819	173824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3005	NC_007384	AAT	2	6	173830	173835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986591
3006	NC_007384	TGC	2	6	173870	173875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3007	NC_007384	ATG	2	6	173908	173913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986591
3008	NC_007384	CGT	2	6	173931	173936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3009	NC_007384	TAA	2	6	173981	173986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986591
3010	NC_007384	CGT	2	6	174030	174035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3011	NC_007384	TCT	2	6	174143	174148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986591
3012	NC_007384	CCAG	2	8	174156	174163	25 %	0 %	25 %	50 %	161986591
3013	NC_007384	GCG	2	6	174203	174208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986591
3014	NC_007384	AG	3	6	174212	174217	50 %	0 %	50 %	0 %	161986591
3015	NC_007384	TG	3	6	174266	174271	0 %	50 %	50 %	0 %	161986591
3016	NC_007384	AGCC	2	8	174348	174355	25 %	0 %	25 %	50 %	74310766
3017	NC_007384	CAGC	2	8	174375	174382	25 %	0 %	25 %	50 %	74310766
3018	NC_007384	GC	3	6	174415	174420	0 %	0 %	50 %	50 %	74310766
3019	NC_007384	T	6	6	174487	174492	0 %	100 %	0 %	0 %	74310766
3020	NC_007384	TCT	2	6	174498	174503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310766
3021	NC_007384	CTT	2	6	174561	174566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310766
3022	NC_007384	GCT	2	6	174602	174607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310766
3023	NC_007384	ACG	2	6	174676	174681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310766
3024	NC_007384	TTCA	2	8	174700	174707	25 %	50 %	0 %	25 %	74310766
3025	NC_007384	CTT	2	6	174792	174797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310766
3026	NC_007384	TAC	2	6	174977	174982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310767
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3030	NC_007384	GC	3	6	175108	175113	0 %	0 %	50 %	50 %	74310767
3031	NC_007384	GCA	2	6	175140	175145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310767
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3033	NC_007384	GTTC	2	8	175248	175255	0 %	50 %	25 %	25 %	74310767
3034	NC_007384	AAAT	2	8	175449	175456	75 %	25 %	0 %	0 %	74310767
3035	NC_007384	AGTT	2	8	175474	175481	25 %	50 %	25 %	0 %	74310767
3036	NC_007384	GT	3	6	175487	175492	0 %	50 %	50 %	0 %	74310767
3037	NC_007384	A	6	6	175625	175630	100 %	0 %	0 %	0 %	74310767
3038	NC_007384	CG	3	6	175654	175659	0 %	0 %	50 %	50 %	74310767
3039	NC_007384	GA	3	6	175671	175676	50 %	0 %	50 %	0 %	74310767
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3041	NC_007384	GAG	2	6	175756	175761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310768
3042	NC_007384	GGC	2	6	175807	175812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310768
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3045	NC_007384	ACCAC	2	10	175961	175970	40 %	0 %	0 %	60 %	74310768
3046	NC_007384	TCA	2	6	175996	176001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310768
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3053	NC_007384	TGC	2	6	176319	176324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
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3055	NC_007384	CGC	2	6	176360	176365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310769
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3058	NC_007384	CTG	2	6	176458	176463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
3059	NC_007384	CGT	2	6	176470	176475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
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3062	NC_007384	TGCG	2	8	176552	176559	0 %	25 %	50 %	25 %	74310769
3063	NC_007384	AGT	2	6	176592	176597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310769
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3068	NC_007384	TGA	2	6	176742	176747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310769
3069	NC_007384	CTG	2	6	176755	176760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
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3105	NC_007384	G	6	6	178536	178541	0 %	0 %	100 %	0 %	74310769
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3107	NC_007384	CGACG	2	10	178703	178712	20 %	0 %	40 %	40 %	74310769
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3490	NC_007384	TCG	2	6	199947	199952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986589
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