MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_007384	CGG	2	6	142272	142277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310736
2503	NC_007384	TCTGG	2	10	142280	142289	0 %	40 %	40 %	20 %	74310736
2504	NC_007384	CTG	2	6	142430	142435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2505	NC_007384	GAA	2	6	142444	142449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310736
2506	NC_007384	TCT	2	6	142464	142469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310736
2507	NC_007384	ATC	2	6	142592	142597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310736
2508	NC_007384	CTG	2	6	142622	142627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2509	NC_007384	GAT	2	6	142633	142638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310736
2510	NC_007384	TCG	2	6	142657	142662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2511	NC_007384	CGT	2	6	142673	142678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2512	NC_007384	TGGC	2	8	142697	142704	0 %	25 %	50 %	25 %	74310736
2513	NC_007384	GCT	2	6	142714	142719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2514	NC_007384	GAC	2	6	142811	142816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2515	NC_007384	CGA	2	6	142852	142857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2516	NC_007384	TGC	2	6	142900	142905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2517	NC_007384	CTG	2	6	142913	142918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2518	NC_007384	CGC	2	6	142978	142983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310736
2519	NC_007384	GAA	2	6	142994	142999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310736
2520	NC_007384	CTA	2	6	143002	143007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310736
2521	NC_007384	GGT	2	6	143098	143103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310736
2522	NC_007384	GGC	2	6	143176	143181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310736
2523	NC_007384	GCG	2	6	143186	143191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310736
2524	NC_007384	TAA	2	6	143342	143347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310736
2525	NC_007384	GAAA	2	8	143614	143621	75 %	0 %	25 %	0 %	74310737
2526	NC_007384	TGA	2	6	143635	143640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310737
2527	NC_007384	AGC	2	6	143650	143655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310737
2528	NC_007384	GCAC	2	8	143656	143663	25 %	0 %	25 %	50 %	74310737
2529	NC_007384	GGGCA	2	10	143691	143700	20 %	0 %	60 %	20 %	74310737
2530	NC_007384	TGGA	2	8	143714	143721	25 %	25 %	50 %	0 %	74310737
2531	NC_007384	GAA	2	6	143777	143782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310737
2532	NC_007384	ACT	2	6	143790	143795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310737
2533	NC_007384	ACG	2	6	143796	143801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310737
2534	NC_007384	GCG	2	6	143820	143825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310737
2535	NC_007384	GGC	2	6	143848	143853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310737
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2538	NC_007384	TAA	2	6	143944	143949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310738
2539	NC_007384	TTTC	2	8	143960	143967	0 %	75 %	0 %	25 %	74310738
2540	NC_007384	CAGCG	2	10	143970	143979	20 %	0 %	40 %	40 %	74310738
2541	NC_007384	CCA	2	6	144104	144109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310738
2542	NC_007384	TGG	2	6	144250	144255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310738
2543	NC_007384	CGC	2	6	144290	144295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310738
2544	NC_007384	GGTA	2	8	144356	144363	25 %	25 %	50 %	0 %	74310738
2545	NC_007384	TTC	2	6	144459	144464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310738
2546	NC_007384	GGCG	2	8	144509	144516	0 %	0 %	75 %	25 %	74310738
2547	NC_007384	ATT	2	6	144681	144686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310738
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2550	NC_007384	TAA	2	6	144805	144810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310739
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2552	NC_007384	GA	3	6	144859	144864	50 %	0 %	50 %	0 %	74310739
2553	NC_007384	CGT	2	6	144875	144880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310739
2554	NC_007384	CCG	2	6	144910	144915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310739
2555	NC_007384	CGC	2	6	144930	144935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310739
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2557	NC_007384	CTG	2	6	144999	145004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310739
2558	NC_007384	CGA	2	6	145028	145033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310739
2559	NC_007384	CTGG	2	8	145146	145153	0 %	25 %	50 %	25 %	74310739
2560	NC_007384	TCG	2	6	145177	145182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310739
2561	NC_007384	TCG	2	6	145204	145209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310739
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2567	NC_007384	TCG	2	6	145417	145422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310739
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2569	NC_007384	TAC	2	6	145437	145442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310739
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2572	NC_007384	AATGCC	2	12	145767	145778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	74310740
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2585	NC_007384	ATT	2	6	146565	146570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310741
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2588	NC_007384	TCCA	2	8	146632	146639	25 %	25 %	0 %	50 %	74310741
2589	NC_007384	GGCTG	2	10	146681	146690	0 %	20 %	60 %	20 %	74310741
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2593	NC_007384	GATT	2	8	146798	146805	25 %	50 %	25 %	0 %	74310741
2594	NC_007384	TGA	2	6	146818	146823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
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2598	NC_007384	CGCT	2	8	146937	146944	0 %	25 %	25 %	50 %	74310741
2599	NC_007384	CCA	2	6	146953	146958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310741
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2604	NC_007384	GCCT	2	8	147220	147227	0 %	25 %	25 %	50 %	74310741
2605	NC_007384	ATG	2	6	147294	147299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
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2607	NC_007384	CGG	2	6	147407	147412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310741
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2610	NC_007384	ATG	2	6	147531	147536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
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2618	NC_007384	GC	3	6	147998	148003	0 %	0 %	50 %	50 %	74310742
2619	NC_007384	AGC	2	6	148021	148026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
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2622	NC_007384	GCG	2	6	148128	148133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310742
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2625	NC_007384	GCT	2	6	148317	148322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310742
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2627	NC_007384	GGC	2	6	148478	148483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310742
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2743	NC_007384	GC	3	6	154535	154540	0 %	0 %	50 %	50 %	74310748
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2990	NC_007384	GTG	2	6	172943	172948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986592
2991	NC_007384	GGC	2	6	173023	173028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986592
2992	NC_007384	GGCGT	2	10	173058	173067	0 %	20 %	60 %	20 %	161986592
2993	NC_007384	CGC	3	9	173119	173127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986592
2994	NC_007384	CCAG	2	8	173131	173138	25 %	0 %	25 %	50 %	161986592
2995	NC_007384	TTG	2	6	173154	173159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986592
2996	NC_007384	TGC	2	6	173214	173219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986592
2997	NC_007384	CGG	2	6	173433	173438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986591
2998	NC_007384	CTG	2	6	173457	173462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
2999	NC_007384	CTGC	2	8	173505	173512	0 %	25 %	25 %	50 %	161986591
3000	NC_007384	ATCAG	2	10	173696	173705	40 %	20 %	20 %	20 %	161986591

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