MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_007384	GTG	2	6	114961	114966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310714
2003	NC_007384	GCA	2	6	114981	114986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2004	NC_007384	GTC	2	6	114990	114995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2005	NC_007384	GTC	2	6	115035	115040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2006	NC_007384	AAG	2	6	115065	115070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310714
2007	NC_007384	CT	3	6	115121	115126	0 %	50 %	0 %	50 %	74310714
2008	NC_007384	CTG	2	6	115149	115154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2009	NC_007384	CTG	2	6	115179	115184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2010	NC_007384	TGA	2	6	115261	115266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310714
2011	NC_007384	ATG	2	6	115317	115322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310714
2012	NC_007384	TGGCG	2	10	115328	115337	0 %	20 %	60 %	20 %	74310714
2013	NC_007384	GAA	2	6	115356	115361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310714
2014	NC_007384	GCT	2	6	115362	115367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2015	NC_007384	TCT	2	6	115380	115385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310714
2016	NC_007384	GCT	2	6	115388	115393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2017	NC_007384	GC	4	8	115414	115421	0 %	0 %	50 %	50 %	74310714
2018	NC_007384	CGG	2	6	115441	115446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310714
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2023	NC_007384	CAG	2	6	115665	115670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310714
2024	NC_007384	AAGC	2	8	115785	115792	50 %	0 %	25 %	25 %	74310714
2025	NC_007384	GAT	2	6	115899	115904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310715
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2042	NC_007384	AC	3	6	117250	117255	50 %	0 %	0 %	50 %	161986597
2043	NC_007384	GCC	2	6	117256	117261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986597
2044	NC_007384	TCTT	2	8	117323	117330	0 %	75 %	0 %	25 %	161986597
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2053	NC_007384	CTGC	2	8	117961	117968	0 %	25 %	25 %	50 %	74310717
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2368	NC_007384	CGT	2	6	135690	135695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310733
2369	NC_007384	GCA	2	6	135841	135846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310733
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2490	NC_007384	TCT	2	6	141588	141593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310736
2491	NC_007384	CTG	2	6	141716	141721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736
2492	NC_007384	TGAT	2	8	141750	141757	25 %	50 %	25 %	0 %	74310736
2493	NC_007384	GTGC	2	8	141761	141768	0 %	25 %	50 %	25 %	74310736
2494	NC_007384	TGG	2	6	141769	141774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310736
2495	NC_007384	ACC	2	6	141806	141811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310736
2496	NC_007384	ACC	2	6	141992	141997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310736
2497	NC_007384	TGA	2	6	142012	142017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310736
2498	NC_007384	CAC	2	6	142115	142120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310736
2499	NC_007384	GTG	3	9	142146	142154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310736
2500	NC_007384	TGC	3	9	142203	142211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310736

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