MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_007384	GCTG	2	8	86938	86945	0 %	25 %	50 %	25 %	74310688
1503	NC_007384	GTT	2	6	86976	86981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310688
1504	NC_007384	CTG	2	6	87033	87038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310688
1505	NC_007384	GTG	2	6	87051	87056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310688
1506	NC_007384	TGGC	2	8	87071	87078	0 %	25 %	50 %	25 %	74310688
1507	NC_007384	GCA	2	6	87167	87172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310688
1508	NC_007384	GTT	2	6	87425	87430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310689
1509	NC_007384	CGT	3	9	87452	87460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310689
1510	NC_007384	TCA	2	6	87494	87499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310689
1511	NC_007384	GGC	2	6	87506	87511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310689
1512	NC_007384	TC	3	6	87542	87547	0 %	50 %	0 %	50 %	74310689
1513	NC_007384	GCA	2	6	87653	87658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310689
1514	NC_007384	GTT	2	6	87663	87668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310689
1515	NC_007384	AGA	2	6	87683	87688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310689
1516	NC_007384	CAC	2	6	87711	87716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310689
1517	NC_007384	GAG	2	6	87760	87765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310689
1518	NC_007384	GC	3	6	87890	87895	0 %	0 %	50 %	50 %	74310689
1519	NC_007384	GAT	2	6	87936	87941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310689
1520	NC_007384	GGC	2	6	87960	87965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310689
1521	NC_007384	ACC	2	6	87976	87981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310689
1522	NC_007384	TG	3	6	87987	87992	0 %	50 %	50 %	0 %	74310689
1523	NC_007384	CAG	3	9	88062	88070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310690
1524	NC_007384	TGCG	2	8	88097	88104	0 %	25 %	50 %	25 %	74310690
1525	NC_007384	CGC	2	6	88107	88112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310690
1526	NC_007384	GGC	2	6	88119	88124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310690
1527	NC_007384	TGG	2	6	88143	88148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310690
1528	NC_007384	GTT	2	6	88180	88185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310690
1529	NC_007384	AGC	2	6	88203	88208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310690
1530	NC_007384	CTTCCG	2	12	88257	88268	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	74310690
1531	NC_007384	ACC	2	6	88298	88303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310690
1532	NC_007384	CG	3	6	88354	88359	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
1533	NC_007384	CG	3	6	88474	88479	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
1534	NC_007384	CCTGG	2	10	88536	88545	0 %	20 %	40 %	40 %	74310690
1535	NC_007384	TCT	2	6	88577	88582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310690
1536	NC_007384	TCG	2	6	88619	88624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310690
1537	NC_007384	CGT	2	6	88653	88658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310690
1538	NC_007384	GGT	2	6	88708	88713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310690
1539	NC_007384	CGC	2	6	88809	88814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310690
1540	NC_007384	CCA	2	6	88821	88826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310690
1541	NC_007384	GCC	2	6	88837	88842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310690
1542	NC_007384	GTGG	2	8	89023	89030	0 %	25 %	75 %	0 %	74310690
1543	NC_007384	CGC	2	6	89043	89048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310690
1544	NC_007384	GC	3	6	89185	89190	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
1545	NC_007384	CAC	2	6	89196	89201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310690
1546	NC_007384	GC	3	6	89288	89293	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
1547	NC_007384	AT	3	6	89345	89350	50 %	50 %	0 %	0 %	74310690
1548	NC_007384	AAT	2	6	89396	89401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310690
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1550	NC_007384	CTT	2	6	89522	89527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986599
1551	NC_007384	CAT	2	6	89567	89572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986599
1552	NC_007384	GCA	3	9	89591	89599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986599
1553	NC_007384	GCC	2	6	89664	89669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986599
1554	NC_007384	CAGA	2	8	89756	89763	50 %	0 %	25 %	25 %	161986599
1555	NC_007384	CAG	2	6	89787	89792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986599
1556	NC_007384	TGG	2	6	89828	89833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986599
1557	NC_007384	GCA	2	6	89921	89926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986599
1558	NC_007384	GCC	2	6	90090	90095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986599
1559	NC_007384	CGCA	2	8	90106	90113	25 %	0 %	25 %	50 %	161986599
1560	NC_007384	AAT	2	6	90205	90210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986599
1561	NC_007384	GCA	2	6	90230	90235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986599
1562	NC_007384	GC	3	6	90236	90241	0 %	0 %	50 %	50 %	161986599
1563	NC_007384	CTGGT	2	10	90255	90264	0 %	40 %	40 %	20 %	161986599
1564	NC_007384	GCC	2	6	90285	90290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986599
1565	NC_007384	GGC	2	6	90343	90348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986599
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1571	NC_007384	GGA	2	6	90626	90631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310692
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1573	NC_007384	GACCG	2	10	90803	90812	20 %	0 %	40 %	40 %	74310692
1574	NC_007384	GGC	2	6	90821	90826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310692
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1588	NC_007384	CTGG	2	8	91277	91284	0 %	25 %	50 %	25 %	74310692
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1597	NC_007384	CAT	2	6	91684	91689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310692
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1599	NC_007384	TGC	2	6	91750	91755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310692
1600	NC_007384	TGG	2	6	91762	91767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310692
1601	NC_007384	GCC	2	6	91836	91841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310692
1602	NC_007384	GGCG	2	8	91900	91907	0 %	0 %	75 %	25 %	74310692
1603	NC_007384	TTTC	2	8	92008	92015	0 %	75 %	0 %	25 %	74310692
1604	NC_007384	AAT	2	6	92069	92074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310692
1605	NC_007384	AGA	2	6	92218	92223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310693
1606	NC_007384	TAG	4	12	92230	92241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310693
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1609	NC_007384	TTA	2	6	93003	93008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986598
1610	NC_007384	ATGTT	2	10	93352	93361	20 %	60 %	20 %	0 %	161986598
1611	NC_007384	ATT	2	6	93467	93472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986598
1612	NC_007384	ATC	2	6	93505	93510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986598
1613	NC_007384	CAA	2	6	93511	93516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986598
1614	NC_007384	ATG	2	6	93538	93543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986598
1615	NC_007384	AAC	2	6	93553	93558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986598
1616	NC_007384	GCG	2	6	93561	93566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986598
1617	NC_007384	AAGC	2	8	93621	93628	50 %	0 %	25 %	25 %	161986598
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1621	NC_007384	TC	3	6	93791	93796	0 %	50 %	0 %	50 %	161986598
1622	NC_007384	TGGA	2	8	93834	93841	25 %	25 %	50 %	0 %	161986598
1623	NC_007384	TGT	2	6	94197	94202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310695
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1625	NC_007384	TGCAT	2	10	94294	94303	20 %	40 %	20 %	20 %	74310695
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1754	NC_007384	CAGC	2	8	102769	102776	25 %	0 %	25 %	50 %	74310704
1755	NC_007384	GCT	2	6	102883	102888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310704
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1758	NC_007384	TCC	2	6	103061	103066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310704
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1766	NC_007384	GCTG	2	8	103251	103258	0 %	25 %	50 %	25 %	74310704
1767	NC_007384	CGA	2	6	103365	103370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310704
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1865	NC_007384	TGC	2	6	108086	108091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310708
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1996	NC_007384	GCG	4	12	114703	114714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310714
1997	NC_007384	TTC	2	6	114762	114767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310714
1998	NC_007384	GGCGCT	2	12	114852	114863	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74310714
1999	NC_007384	TGA	2	6	114890	114895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310714
2000	NC_007384	TGCG	2	8	114910	114917	0 %	25 %	50 %	25 %	74310714

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