MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007384	GCAG	2	8	59790	59797	25 %	0 %	50 %	25 %	74310668
1003	NC_007384	ACC	2	6	59806	59811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310668
1004	NC_007384	CAG	3	9	59813	59821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1005	NC_007384	TA	3	6	59837	59842	50 %	50 %	0 %	0 %	74310668
1006	NC_007384	TTC	2	6	59899	59904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310668
1007	NC_007384	AAG	2	6	60107	60112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310668
1008	NC_007384	CG	4	8	60147	60154	0 %	0 %	50 %	50 %	74310668
1009	NC_007384	GCG	2	6	60183	60188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310668
1010	NC_007384	TCG	2	6	60224	60229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1011	NC_007384	GCA	2	6	60234	60239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1012	NC_007384	AGC	2	6	60263	60268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1013	NC_007384	TCG	2	6	60269	60274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1014	NC_007384	CAG	2	6	60289	60294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1015	NC_007384	CAG	2	6	60346	60351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1016	NC_007384	CG	4	8	60435	60442	0 %	0 %	50 %	50 %	74310668
1017	NC_007384	GCA	2	6	60498	60503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310668
1018	NC_007384	AAC	2	6	60522	60527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310668
1019	NC_007384	AATG	2	8	60567	60574	50 %	25 %	25 %	0 %	74310669
1020	NC_007384	GCCATT	2	12	60772	60783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	74310669
1021	NC_007384	CAA	2	6	60805	60810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310669
1022	NC_007384	AACGT	2	10	60859	60868	40 %	20 %	20 %	20 %	74310669
1023	NC_007384	AC	3	6	60919	60924	50 %	0 %	0 %	50 %	74310669
1024	NC_007384	ATC	2	6	60938	60943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310669
1025	NC_007384	ACG	2	6	61101	61106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310670
1026	NC_007384	GTG	2	6	61123	61128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310670
1027	NC_007384	ACG	2	6	61192	61197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310670
1028	NC_007384	GTG	3	9	61214	61222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310670
1029	NC_007384	CGG	2	6	61233	61238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310670
1030	NC_007384	CAC	2	6	61332	61337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310670
1031	NC_007384	CTG	2	6	61497	61502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310670
1032	NC_007384	GCC	2	6	61549	61554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310670
1033	NC_007384	GCC	2	6	61618	61623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310670
1034	NC_007384	TGG	2	6	61747	61752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310670
1035	NC_007384	ATT	2	6	61758	61763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310670
1036	NC_007384	TAA	2	6	61807	61812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310671
1037	NC_007384	CGGCGT	2	12	61972	61983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74310671
1038	NC_007384	GGCA	2	8	62015	62022	25 %	0 %	50 %	25 %	74310671
1039	NC_007384	AAT	2	6	62072	62077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310671
1040	NC_007384	CGT	2	6	62258	62263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310671
1041	NC_007384	TTC	2	6	62282	62287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310671
1042	NC_007384	CAT	2	6	62297	62302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310671
1043	NC_007384	CAC	2	6	62303	62308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310671
1044	NC_007384	T	6	6	62309	62314	0 %	100 %	0 %	0 %	74310671
1045	NC_007384	CGT	2	6	62368	62373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310671
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1052	NC_007384	TGC	2	6	62806	62811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1053	NC_007384	TTC	2	6	62812	62817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310672
1054	NC_007384	TCA	2	6	62832	62837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310672
1055	NC_007384	CAG	2	6	62896	62901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1056	NC_007384	GA	3	6	63051	63056	50 %	0 %	50 %	0 %	74310672
1057	NC_007384	GCA	2	6	63071	63076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1058	NC_007384	GCA	2	6	63104	63109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1059	NC_007384	GTCA	2	8	63139	63146	25 %	25 %	25 %	25 %	74310672
1060	NC_007384	CAG	2	6	63163	63168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1061	NC_007384	CGC	2	6	63213	63218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310672
1062	NC_007384	CAA	2	6	63270	63275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310672
1063	NC_007384	TTC	2	6	63284	63289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310672
1064	NC_007384	GCC	2	6	63352	63357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310672
1065	NC_007384	CTG	2	6	63367	63372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1066	NC_007384	GC	4	8	63437	63444	0 %	0 %	50 %	50 %	74310672
1067	NC_007384	CGT	2	6	63531	63536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1068	NC_007384	CTG	2	6	63550	63555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310672
1069	NC_007384	CGA	2	6	63593	63598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310672
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1071	NC_007384	ATC	2	6	63629	63634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310672
1072	NC_007384	TGT	2	6	63714	63719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310672
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1110	NC_007384	ACG	2	6	65516	65521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310673
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