MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 78676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_007384	CGG	2	6	3434284	3434289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74313650
56003	NC_007384	TGA	2	6	3434297	3434302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74313650
56004	NC_007384	CTG	2	6	3434370	3434375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313650
56005	NC_007384	CGT	2	6	3434379	3434384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313650
56006	NC_007384	TCA	2	6	3434401	3434406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74313651
56007	NC_007384	CAT	2	6	3434458	3434463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74313651
56008	NC_007384	TGG	2	6	3434472	3434477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74313651
56009	NC_007384	GGT	2	6	3434497	3434502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74313651
56010	NC_007384	ATT	2	6	3434603	3434608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74313651
56011	NC_007384	GAT	2	6	3434641	3434646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74313651
56012	NC_007384	CCA	2	6	3434649	3434654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74313651
56013	NC_007384	GTG	2	6	3434657	3434662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74313651
56014	NC_007384	TGC	2	6	3434664	3434669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313651
56015	NC_007384	TGC	2	6	3434724	3434729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313651
56016	NC_007384	GAG	3	9	3434771	3434779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74313651
56017	NC_007384	ACG	2	6	3434807	3434812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74313652
56018	NC_007384	CAA	2	6	3434841	3434846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74313652
56019	NC_007384	GTC	2	6	3434866	3434871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313652
56020	NC_007384	TCG	2	6	3434903	3434908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313652
56021	NC_007384	TGC	2	6	3434917	3434922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313652
56022	NC_007384	AGC	2	6	3435061	3435066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74313652
56023	NC_007384	TC	3	6	3435184	3435189	0 %	50 %	0 %	50 %	74313653
56024	NC_007384	ACG	2	6	3435201	3435206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74313653
56025	NC_007384	A	7	7	3435227	3435233	100 %	0 %	0 %	0 %	74313653
56026	NC_007384	CAG	2	6	3435238	3435243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74313653
56027	NC_007384	ATG	2	6	3435266	3435271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74313653
56028	NC_007384	A	6	6	3435272	3435277	100 %	0 %	0 %	0 %	74313653
56029	NC_007384	AGA	2	6	3435280	3435285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74313653
56030	NC_007384	GC	3	6	3435302	3435307	0 %	0 %	50 %	50 %	74313653
56031	NC_007384	TTA	2	6	3435327	3435332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74313653
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56033	NC_007384	TGC	2	6	3435408	3435413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313653
56034	NC_007384	GGT	3	9	3435437	3435445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74313653
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56037	NC_007384	CTG	3	9	3435596	3435604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313653
56038	NC_007384	CTG	2	6	3435641	3435646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313653
56039	NC_007384	CGG	2	6	3435787	3435792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74313654
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56042	NC_007384	TGA	2	6	3436024	3436029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74313654
56043	NC_007384	ATC	2	6	3436184	3436189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74313654
56044	NC_007384	TAC	2	6	3436238	3436243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74313654
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56052	NC_007384	A	6	6	3437032	3437037	100 %	0 %	0 %	0 %	74313655
56053	NC_007384	GCG	2	6	3437062	3437067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74313655
56054	NC_007384	CAT	2	6	3437098	3437103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74313655
56055	NC_007384	GCT	2	6	3437122	3437127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74313655
56056	NC_007384	TGG	2	6	3437155	3437160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74313655
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56059	NC_007384	CAGTT	2	10	3437214	3437223	20 %	40 %	20 %	20 %	74313655
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56063	NC_007384	GGCT	2	8	3437288	3437295	0 %	25 %	50 %	25 %	74313655
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56070	NC_007384	ACCG	2	8	3437835	3437842	25 %	0 %	25 %	50 %	74313656
56071	NC_007384	T	6	6	3437865	3437870	0 %	100 %	0 %	0 %	74313656
56072	NC_007384	TGGC	2	8	3437882	3437889	0 %	25 %	50 %	25 %	74313656
56073	NC_007384	T	7	7	3437902	3437908	0 %	100 %	0 %	0 %	74313656
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56082	NC_007384	TCGCC	2	10	3439451	3439460	0 %	20 %	20 %	60 %	74313657
56083	NC_007384	CG	3	6	3439561	3439566	0 %	0 %	50 %	50 %	74313657
56084	NC_007384	CAT	2	6	3439606	3439611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74313657
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56087	NC_007384	GTT	2	6	3439725	3439730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74313657
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56089	NC_007384	A	6	6	3439754	3439759	100 %	0 %	0 %	0 %	74313658
56090	NC_007384	GCCA	2	8	3439773	3439780	25 %	0 %	25 %	50 %	74313658
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56101	NC_007384	GCCAT	2	10	3440342	3440351	20 %	20 %	20 %	40 %	74313659
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56107	NC_007384	GCC	2	6	3440571	3440576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74313659
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56109	NC_007384	CGC	2	6	3440757	3440762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74313659
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56113	NC_007384	ACACC	2	10	3440870	3440879	40 %	0 %	0 %	60 %	74313659
56114	NC_007384	CGA	2	6	3440918	3440923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74313659
56115	NC_007384	AC	3	6	3440929	3440934	50 %	0 %	0 %	50 %	74313659
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