MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007351	TTC	2	6	21299	21304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663780
502	NC_007351	TTG	2	6	21312	21317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663780
503	NC_007351	T	6	6	21332	21337	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
504	NC_007351	ATCTTT	2	12	21347	21358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73663780
505	NC_007351	CAG	2	6	21367	21372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663780
506	NC_007351	T	6	6	21378	21383	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
507	NC_007351	TTCT	2	8	21385	21392	0 %	75 %	0 %	25 %	73663780
508	NC_007351	AT	3	6	21398	21403	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
509	NC_007351	AAT	2	6	21414	21419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663780
510	NC_007351	T	9	9	21474	21482	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
511	NC_007351	T	7	7	21530	21536	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
512	NC_007351	AAAG	2	8	21558	21565	75 %	0 %	25 %	0 %	73663780
513	NC_007351	TTG	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663780
514	NC_007351	ATT	2	6	21632	21637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663780
515	NC_007351	TAG	2	6	21655	21660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663780
516	NC_007351	T	6	6	21697	21702	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
517	NC_007351	T	6	6	21706	21711	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
518	NC_007351	T	6	6	21720	21725	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
519	NC_007351	AT	3	6	21729	21734	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
520	NC_007351	T	7	7	21736	21742	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
521	NC_007351	ATA	2	6	21762	21767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663780
522	NC_007351	AAT	2	6	21801	21806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663780
523	NC_007351	ATGA	2	8	21867	21874	50 %	25 %	25 %	0 %	73663780
524	NC_007351	TTA	2	6	22045	22050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663780
525	NC_007351	GAA	2	6	22994	22999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663781
526	NC_007351	ACA	2	6	23040	23045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663781
527	NC_007351	ATT	2	6	23087	23092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663781
528	NC_007351	A	6	6	23125	23130	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
529	NC_007351	ATT	2	6	23170	23175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663781
530	NC_007351	AT	3	6	23180	23185	50 %	50 %	0 %	0 %	73663781
531	NC_007351	A	7	7	23242	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
532	NC_007351	ATTG	2	8	23251	23258	25 %	50 %	25 %	0 %	73663781
533	NC_007351	AGA	2	6	23272	23277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663781
534	NC_007351	AAT	2	6	23297	23302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663781
535	NC_007351	TAT	2	6	23336	23341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663781
536	NC_007351	TGA	2	6	23353	23358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663781
537	NC_007351	TAA	2	6	23401	23406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663781
538	NC_007351	TAT	2	6	23422	23427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663781
539	NC_007351	T	6	6	23478	23483	0 %	100 %	0 %	0 %	73663781
540	NC_007351	ATA	2	6	23496	23501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663781
541	NC_007351	A	6	6	23555	23560	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
542	NC_007351	TCC	2	6	23644	23649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663781
543	NC_007351	ACA	2	6	23664	23669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663781
544	NC_007351	A	6	6	23675	23680	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
545	NC_007351	A	6	6	23698	23703	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
546	NC_007351	A	6	6	23744	23749	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
547	NC_007351	ATGA	2	8	23810	23817	50 %	25 %	25 %	0 %	73663781
548	NC_007351	ATGA	2	8	23819	23826	50 %	25 %	25 %	0 %	73663781
549	NC_007351	AG	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	73663781
550	NC_007351	AGA	2	6	23845	23850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663781
551	NC_007351	GAA	2	6	23903	23908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663781
552	NC_007351	AAT	2	6	23963	23968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663781
553	NC_007351	CGTT	2	8	24020	24027	0 %	50 %	25 %	25 %	73663781
554	NC_007351	GAT	2	6	24068	24073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663781
555	NC_007351	ATT	2	6	24076	24081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663781
556	NC_007351	A	6	6	24116	24121	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
557	NC_007351	AGA	2	6	24178	24183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663781
558	NC_007351	A	6	6	24208	24213	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
559	NC_007351	TA	3	6	24345	24350	50 %	50 %	0 %	0 %	73663782
560	NC_007351	TTTTGT	2	12	24428	24439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73663782
561	NC_007351	GA	3	6	24480	24485	50 %	0 %	50 %	0 %	73663782
562	NC_007351	TAA	2	6	24494	24499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663782
563	NC_007351	ATA	2	6	24508	24513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663782
564	NC_007351	ATCA	2	8	24555	24562	50 %	25 %	0 %	25 %	73663782
565	NC_007351	GTT	2	6	24564	24569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663782
566	NC_007351	GAT	2	6	24621	24626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663782
567	NC_007351	ACTTA	2	10	24667	24676	40 %	40 %	0 %	20 %	73663782
568	NC_007351	AGC	2	6	24688	24693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663782
569	NC_007351	A	6	6	24695	24700	100 %	0 %	0 %	0 %	73663782
570	NC_007351	TGA	2	6	24725	24730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663782
571	NC_007351	ACA	2	6	24778	24783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663782
572	NC_007351	TAA	2	6	24788	24793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663782
573	NC_007351	GCT	2	6	24849	24854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663782
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575	NC_007351	ATT	2	6	24878	24883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663782
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578	NC_007351	CTTT	2	8	24981	24988	0 %	75 %	0 %	25 %	73663783
579	NC_007351	GTT	2	6	25007	25012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663783
580	NC_007351	AAT	2	6	25016	25021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663783
581	NC_007351	TACG	2	8	25057	25064	25 %	25 %	25 %	25 %	73663783
582	NC_007351	ATT	2	6	25069	25074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663783
583	NC_007351	TCAT	2	8	25167	25174	25 %	50 %	0 %	25 %	73663783
584	NC_007351	CTA	2	6	25947	25952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663784
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588	NC_007351	GAA	2	6	26076	26081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663784
589	NC_007351	A	6	6	26089	26094	100 %	0 %	0 %	0 %	73663784
590	NC_007351	TTA	2	6	26097	26102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663784
591	NC_007351	TGA	2	6	26115	26120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663784
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593	NC_007351	TTAAAC	2	12	26336	26347	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663784
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595	NC_007351	CAT	2	6	26547	26552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663784
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597	NC_007351	TA	3	6	26841	26846	50 %	50 %	0 %	0 %	73663785
598	NC_007351	CGA	2	6	26870	26875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663785
599	NC_007351	ACCA	2	8	26896	26903	50 %	0 %	0 %	50 %	73663785
600	NC_007351	CCT	2	6	26924	26929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663785
601	NC_007351	ATTTA	2	10	27043	27052	40 %	60 %	0 %	0 %	73663785
602	NC_007351	TATTTC	2	12	27061	27072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73663786
603	NC_007351	TTG	2	6	27142	27147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663786
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607	NC_007351	ATC	2	6	27238	27243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663786
608	NC_007351	TTA	2	6	27251	27256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663786
609	NC_007351	AATG	2	8	27446	27453	50 %	25 %	25 %	0 %	73663787
610	NC_007351	CAAG	2	8	27525	27532	50 %	0 %	25 %	25 %	73663787
611	NC_007351	TCT	2	6	27646	27651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663788
612	NC_007351	TTC	2	6	27688	27693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663788
613	NC_007351	AGT	2	6	27732	27737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663788
614	NC_007351	ATT	2	6	27746	27751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663788
615	NC_007351	T	7	7	27755	27761	0 %	100 %	0 %	0 %	73663788
616	NC_007351	AAT	2	6	27775	27780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663788
617	NC_007351	TAA	2	6	27812	27817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663788
618	NC_007351	TTG	2	6	27846	27851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663788
619	NC_007351	CATC	2	8	27925	27932	25 %	25 %	0 %	50 %	73663788
620	NC_007351	TGG	2	6	28046	28051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663788
621	NC_007351	ATC	2	6	28127	28132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663788
622	NC_007351	TAC	2	6	28153	28158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663788
623	NC_007351	GCA	2	6	28164	28169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663788
624	NC_007351	ATTA	2	8	28208	28215	50 %	50 %	0 %	0 %	73663788
625	NC_007351	GAT	2	6	28261	28266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663788
626	NC_007351	ATA	2	6	28273	28278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663788
627	NC_007351	TATT	2	8	28336	28343	25 %	75 %	0 %	0 %	73663788
628	NC_007351	TCA	2	6	28401	28406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663788
629	NC_007351	CAA	2	6	28438	28443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663788
630	NC_007351	TGCACC	2	12	28514	28525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73663788
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632	NC_007351	TGA	2	6	28578	28583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663788
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