MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305

Total Repeats: 1050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007350	TAAGTT	2	12	7720	7731	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661315
2	NC_007350	GTAATG	2	12	9382	9393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
3	NC_007350	TGGATT	2	12	11268	11279	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73661317
4	NC_007350	TTTGAA	2	12	13325	13336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661318
5	NC_007350	TTGGTT	2	12	13908	13919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661318
6	NC_007350	TAACGA	2	12	15497	15508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73661320
7	NC_007350	GCTTTG	2	12	17136	17147	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73661322
8	NC_007350	ATGAAA	2	12	18273	18284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661323
9	NC_007350	AGAAAT	2	12	18394	18405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661323
10	NC_007350	AATGAA	2	12	18407	18418	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661323
11	NC_007350	TAAAGG	2	12	19992	20003	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661324
12	NC_007350	TGAAAT	2	12	21732	21743	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661325
13	NC_007350	AAGGTA	2	12	22188	22199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661326
14	NC_007350	TGAATT	2	12	28582	28593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661330
15	NC_007350	AATGAA	2	12	29819	29830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661331
16	NC_007350	GAACGC	2	12	29933	29944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661331
17	NC_007350	CACGTA	2	12	30477	30488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661331
18	NC_007350	AATTCA	2	12	37344	37355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73661337
19	NC_007350	TATCTA	2	12	38123	38134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73661338
20	NC_007350	TATTGA	2	12	40267	40278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661341
21	NC_007350	TGTTCT	2	12	40413	40424	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73661341
22	NC_007350	ATAACC	2	12	43854	43865	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	73661345
23	NC_007350	ACACCT	2	12	46352	46363	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	73661347
24	NC_007350	TAATTC	2	12	48069	48080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73661348
25	NC_007350	CAGAGG	2	12	49147	49158	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73661349
26	NC_007350	AAATCA	2	12	50547	50558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73661350
27	NC_007350	GAATTA	2	12	54249	54260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661352
28	NC_007350	CAAACA	2	12	59357	59368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661357
29	NC_007350	TGAACC	2	12	62757	62768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661362
30	NC_007350	TAATGA	2	12	68004	68015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661365
31	NC_007350	AATATA	2	12	68483	68494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661365
32	NC_007350	TGAAAA	2	12	68521	68532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661366
33	NC_007350	TCAAAT	2	12	69235	69246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73661367
34	NC_007350	ATTAAT	2	12	73408	73419	50 %	50 %	0 %	0 %	73661372
35	NC_007350	ATTAAA	2	12	77268	77279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661375
36	NC_007350	ATTAAA	2	12	80372	80383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661377
37	NC_007350	GTATTA	2	12	83073	83084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661381
38	NC_007350	AAAGAA	2	12	86694	86705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73661383
39	NC_007350	AGAAAT	2	12	86714	86725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661383
40	NC_007350	CTGATT	2	12	87130	87141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661383
41	NC_007350	AAGTTC	2	12	98782	98793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661391
42	NC_007350	ATTAGG	2	12	104530	104541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661396
43	NC_007350	ATGAAT	2	12	105221	105232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661397
44	NC_007350	AAAGAT	2	12	105689	105700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661397
45	NC_007350	CAATCG	2	12	115501	115512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661407
46	NC_007350	TATAGC	2	12	118819	118830	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661412
47	NC_007350	ATTTGG	2	12	119137	119148	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73661413
48	NC_007350	TTTGAC	2	12	123780	123791	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661415
49	NC_007350	TAAACA	2	12	126846	126857	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73661417
50	NC_007350	GAAAGC	2	12	129648	129659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661419
51	NC_007350	TTAACT	2	12	136047	136058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73661426
52	NC_007350	TCAAGT	2	12	137600	137611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661427
53	NC_007350	GGCATC	2	12	141714	141725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73661432
54	NC_007350	TCTGAA	2	12	143768	143779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661434
55	NC_007350	ATTAGA	2	12	144485	144496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661435
56	NC_007350	GATAAA	2	12	152260	152271	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661444
57	NC_007350	GCAGCT	2	12	153409	153420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73661444
58	NC_007350	GAGCGA	2	12	154053	154064	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73661444
59	NC_007350	AAGTGA	2	12	154665	154676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
60	NC_007350	AGTGAA	2	12	154738	154749	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
61	NC_007350	AAGCGA	2	12	155403	155414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
62	NC_007350	TGAATC	2	12	155604	155615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661444
63	NC_007350	AGTGAA	2	12	155764	155775	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
64	NC_007350	AAGTGA	2	12	155853	155864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
65	NC_007350	AAGTGA	2	12	155871	155882	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
66	NC_007350	GAGTCA	2	12	155929	155940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73661444
67	NC_007350	AGTGAG	2	12	155944	155955	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
68	NC_007350	GAGTCA	2	12	155983	155994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73661444
69	NC_007350	AGTGAG	2	12	155998	156009	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
70	NC_007350	AAGCGA	2	12	156123	156134	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
71	NC_007350	AAGTGA	2	12	156195	156206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
72	NC_007350	GAGTCA	2	12	156235	156246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73661444
73	NC_007350	AGTGAG	2	12	156250	156261	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
74	NC_007350	GAGCGA	2	12	156411	156422	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73661444
75	NC_007350	AGTGAG	2	12	156628	156639	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
76	NC_007350	AGTGAG	2	12	156682	156693	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
77	NC_007350	AAGTGA	2	12	156789	156800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
78	NC_007350	AAGTGA	2	12	156825	156836	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
79	NC_007350	AAGTGA	2	12	156987	156998	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
80	NC_007350	AAGCGA	2	12	157131	157142	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
81	NC_007350	AAGCGA	2	12	157203	157214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
82	NC_007350	AAGCGA	2	12	157275	157286	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
83	NC_007350	AAGCGA	2	12	157347	157358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
84	NC_007350	AAGTGA	2	12	157401	157412	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
85	NC_007350	CGAATC	2	12	157422	157433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661444
86	NC_007350	TGAATC	2	12	157440	157451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661444
87	NC_007350	AAGCGA	2	12	157653	157664	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73661444
88	NC_007350	AAGTGA	2	12	157725	157736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661444
89	NC_007350	AGTGAG	2	12	157852	157863	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
90	NC_007350	AGTGAG	2	12	157870	157881	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661444
91	NC_007350	AATTTA	2	12	160305	160316	50 %	50 %	0 %	0 %	73661447
92	NC_007350	GATTGC	2	12	164424	164435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73661451
93	NC_007350	AAAGAT	2	12	166282	166293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661453
94	NC_007350	AAAGCA	2	12	166639	166650	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73661453
95	NC_007350	GGTGTA	2	12	168072	168083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	73661455
96	NC_007350	ATGTGT	2	12	172083	172094	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73661459
97	NC_007350	TTTGGA	2	12	172696	172707	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73661460
98	NC_007350	TTTATT	2	12	172941	172952	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	73661460
99	NC_007350	CTAATA	2	12	173706	173717	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73661461
100	NC_007350	GAATTA	2	12	178417	178428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661465
101	NC_007350	GAAATT	2	12	181054	181065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661468
102	NC_007350	ACAGAT	2	12	182063	182074	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73661469
103	NC_007350	GCAGGT	2	12	182647	182658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73661470
104	NC_007350	AAAAGG	2	12	186130	186141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661474
105	NC_007350	AATTGA	2	12	188731	188742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661476
106	NC_007350	AATCAA	2	12	190693	190704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73661478
107	NC_007350	AATTTT	2	12	190995	191006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661478
108	NC_007350	AGTAAT	2	12	192308	192319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661480
109	NC_007350	AAATGA	2	12	192915	192926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661481
110	NC_007350	TACTTG	2	12	195572	195583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661483
111	NC_007350	TTTCTT	2	12	198495	198506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	73661486
112	NC_007350	TAATAT	2	12	200633	200644	50 %	50 %	0 %	0 %	73661488
113	NC_007350	TATCGT	2	12	206472	206483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661491
114	NC_007350	TTTAGA	2	12	206776	206787	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661491
115	NC_007350	AACGTG	2	12	209541	209552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73661494
116	NC_007350	TGAGAG	2	12	210135	210146	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73661494
117	NC_007350	GGATGG	2	12	215495	215506	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	73661498
118	NC_007350	TACCAA	2	12	217221	217232	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	73661499
119	NC_007350	CATCTA	2	12	228919	228930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661510
120	NC_007350	TATGAT	2	12	229547	229558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661512
121	NC_007350	TTACTG	2	12	229668	229679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661512
122	NC_007350	TTAATT	2	12	230571	230582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661512
123	NC_007350	ATTTTT	2	12	232208	232219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	73661513
124	NC_007350	ATAAAG	2	12	232950	232961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661513
125	NC_007350	TAAATG	2	12	233887	233898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661514
126	NC_007350	TGAATT	2	12	240816	240827	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661521
127	NC_007350	TTAAAT	2	12	241189	241200	50 %	50 %	0 %	0 %	73661521
128	NC_007350	AGACAC	2	12	241896	241907	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	73661521
129	NC_007350	TTTGAT	2	12	242264	242275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73661522
130	NC_007350	AATCAA	2	12	242445	242456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73661522
131	NC_007350	CACTAT	2	12	242830	242841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661522
132	NC_007350	TTAACT	2	12	247828	247839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73661528
133	NC_007350	TTAGCT	2	12	249156	249167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661529
134	NC_007350	TCATTA	2	12	249528	249539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73661529
135	NC_007350	AGCATA	2	12	250938	250949	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73661530
136	NC_007350	AAGTAA	2	12	250992	251003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661530
137	NC_007350	ATCAGC	2	12	254103	254114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661533
138	NC_007350	TGGTTT	2	12	261019	261030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661540
139	NC_007350	TAATCA	2	12	265813	265824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73661544
140	NC_007350	CCAATG	2	12	267626	267637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661546
141	NC_007350	GACAAC	2	12	268306	268317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	73661546
142	NC_007350	AAAAGC	2	12	270934	270945	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73661549
143	NC_007350	TCAGGT	2	12	273342	273353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73661553
144	NC_007350	CTAATA	2	12	275821	275832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73661555
145	NC_007350	TGTATA	2	12	276709	276720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661556
146	NC_007350	TAAAAA	2	12	277325	277336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73661557
147	NC_007350	GGTACG	2	12	278435	278446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73661558
148	NC_007350	TATGCC	2	12	284508	284519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73661563
149	NC_007350	AGATAA	2	12	285371	285382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661564
150	NC_007350	ATCGTA	2	12	286565	286576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661566
151	NC_007350	TCATTT	2	12	289230	289241	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73661570
152	NC_007350	GAAAAA	2	12	294255	294266	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73661576
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156	NC_007350	ATATAA	2	12	309862	309873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661593
157	NC_007350	CAGCGT	2	12	311597	311608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73661595
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230	NC_007350	TGCTGA	2	12	534318	534329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73661811
231	NC_007350	GGTAAT	2	12	547636	547647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661825
232	NC_007350	GATAAA	2	12	553031	553042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661830
233	NC_007350	TCAGGT	2	12	555108	555119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73661831
234	NC_007350	CATGGC	2	12	557922	557933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73661834
235	NC_007350	GGTGAC	2	12	558744	558755	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73661835
236	NC_007350	AACGCA	2	12	562155	562166	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	73661839
237	NC_007350	CAAAAG	2	12	562463	562474	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73661839
238	NC_007350	TACCAA	2	12	563677	563688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	73661841
239	NC_007350	TGCTAA	2	12	564254	564265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661841
240	NC_007350	ATTCAG	2	12	566986	566997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661844
241	NC_007350	ACAATG	2	12	567172	567183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73661844
242	NC_007350	CAGTTA	2	12	570221	570232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661846
243	NC_007350	GTTATT	2	12	570793	570804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73661846
244	NC_007350	TCAGTT	2	12	572070	572081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661847
245	NC_007350	AAGGTA	2	12	574205	574216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73661848
246	NC_007350	ATCTGG	2	12	578010	578021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73661852
247	NC_007350	TAAAAG	2	12	578183	578194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73661852
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251	NC_007350	TGCTTA	2	12	584608	584619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73661858
252	NC_007350	ATGTAA	2	12	584691	584702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661858
253	NC_007350	AATGAC	2	12	584927	584938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73661859
254	NC_007350	CTTTTT	2	12	587463	587474	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	73661860
255	NC_007350	AATTTA	2	12	590079	590090	50 %	50 %	0 %	0 %	73661864
256	NC_007350	GTCGAT	2	12	591071	591082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73661865
257	NC_007350	TTAGAT	2	12	594519	594530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73661868
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260	NC_007350	CCAATG	2	12	599639	599650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73661872
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262	NC_007350	ACTTAA	2	12	605099	605110	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73661877
263	NC_007350	ATTTTA	2	12	608888	608899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661880
264	NC_007350	TTGAAA	2	12	612068	612079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73661882
265	NC_007350	CATTGA	2	12	612130	612141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73661882
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345	NC_007350	TTTCTG	2	12	798191	798202	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73662075
346	NC_007350	TTGTAG	2	12	803489	803500	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73662081
347	NC_007350	TACTTT	2	12	805192	805203	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73662083
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