MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 39665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007181	GAATT	2	10	153729	153738	40 %	40 %	20 %	0 %	70606031
3002	NC_007181	ACG	2	6	153747	153752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606031
3003	NC_007181	TAG	2	6	153759	153764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606031
3004	NC_007181	AGG	2	6	153865	153870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606031
3005	NC_007181	TA	3	6	153878	153883	50 %	50 %	0 %	0 %	70606031
3006	NC_007181	AG	3	6	153923	153928	50 %	0 %	50 %	0 %	70606031
3007	NC_007181	TATG	2	8	153934	153941	25 %	50 %	25 %	0 %	70606031
3008	NC_007181	ATT	2	6	154005	154010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606031
3009	NC_007181	TGA	2	6	154060	154065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606031
3010	NC_007181	AG	3	6	154098	154103	50 %	0 %	50 %	0 %	70606031
3011	NC_007181	TGA	2	6	154119	154124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606031
3012	NC_007181	GTT	2	6	154151	154156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606031
3013	NC_007181	AG	3	6	154180	154185	50 %	0 %	50 %	0 %	70606031
3014	NC_007181	TC	3	6	154194	154199	0 %	50 %	0 %	50 %	70606031
3015	NC_007181	AT	3	6	154217	154222	50 %	50 %	0 %	0 %	70606031
3016	NC_007181	GAA	2	6	154235	154240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606031
3017	NC_007181	GAA	2	6	154275	154280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606031
3018	NC_007181	GT	3	6	154390	154395	0 %	50 %	50 %	0 %	70606032
3019	NC_007181	TTC	2	6	154417	154422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606032
3020	NC_007181	TCC	3	9	154495	154503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606032
3021	NC_007181	GTAAA	2	10	154507	154516	60 %	20 %	20 %	0 %	70606032
3022	NC_007181	T	6	6	154543	154548	0 %	100 %	0 %	0 %	70606032
3023	NC_007181	TCT	2	6	154590	154595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606032
3024	NC_007181	AGT	2	6	154754	154759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606033
3025	NC_007181	TAA	2	6	154807	154812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606033
3026	NC_007181	TAA	3	9	154842	154850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606033
3027	NC_007181	ACC	2	6	154858	154863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606033
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3030	NC_007181	CTA	2	6	154929	154934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606033
3031	NC_007181	TAA	2	6	154975	154980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606033
3032	NC_007181	GAA	2	6	155027	155032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606033
3033	NC_007181	TAATG	2	10	155034	155043	40 %	40 %	20 %	0 %	70606033
3034	NC_007181	T	6	6	155106	155111	0 %	100 %	0 %	0 %	70606034
3035	NC_007181	GA	3	6	155252	155257	50 %	0 %	50 %	0 %	70606034
3036	NC_007181	TTTTC	2	10	155272	155281	0 %	80 %	0 %	20 %	70606034
3037	NC_007181	TCA	2	6	155296	155301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606034
3038	NC_007181	AG	3	6	155325	155330	50 %	0 %	50 %	0 %	70606034
3039	NC_007181	GAA	2	6	155412	155417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606034
3040	NC_007181	GAA	2	6	155421	155426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606034
3041	NC_007181	CTA	2	6	155454	155459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606034
3042	NC_007181	TA	3	6	155477	155482	50 %	50 %	0 %	0 %	70606034
3043	NC_007181	AT	3	6	155562	155567	50 %	50 %	0 %	0 %	70606034
3044	NC_007181	GAA	2	6	155614	155619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606034
3045	NC_007181	AG	3	6	155673	155678	50 %	0 %	50 %	0 %	70606034
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3047	NC_007181	TGA	2	6	155730	155735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606034
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3049	NC_007181	TGA	2	6	155796	155801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606034
3050	NC_007181	GCAAG	2	10	155832	155841	40 %	0 %	40 %	20 %	70606034
3051	NC_007181	TAAA	2	8	155843	155850	75 %	25 %	0 %	0 %	70606034
3052	NC_007181	TC	3	6	155879	155884	0 %	50 %	0 %	50 %	70606034
3053	NC_007181	TTA	2	6	155933	155938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606034
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3055	NC_007181	AAT	2	6	155991	155996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606034
3056	NC_007181	TATGA	2	10	156148	156157	40 %	40 %	20 %	0 %	70606034
3057	NC_007181	TCT	2	6	156192	156197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606034
3058	NC_007181	GTA	2	6	156232	156237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606034
3059	NC_007181	ATA	2	6	156347	156352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606034
3060	NC_007181	AGGAAA	2	12	156372	156383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606034
3061	NC_007181	CAC	2	6	156461	156466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606034
3062	NC_007181	TGA	2	6	156468	156473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606034
3063	NC_007181	GAG	2	6	156526	156531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606034
3064	NC_007181	GAA	2	6	156651	156656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606034
3065	NC_007181	AG	3	6	156758	156763	50 %	0 %	50 %	0 %	70606035
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3071	NC_007181	TGA	2	6	157103	157108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606035
3072	NC_007181	TAT	2	6	157110	157115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606035
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3078	NC_007181	TGA	2	6	157244	157249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606035
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3083	NC_007181	TA	3	6	157490	157495	50 %	50 %	0 %	0 %	70606035
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3091	NC_007181	TAGA	2	8	157988	157995	50 %	25 %	25 %	0 %	70606037
3092	NC_007181	ACCT	2	8	158018	158025	25 %	25 %	0 %	50 %	70606037
3093	NC_007181	AT	3	6	158098	158103	50 %	50 %	0 %	0 %	70606037
3094	NC_007181	CTG	2	6	158120	158125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606037
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3096	NC_007181	TGG	2	6	158145	158150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606037
3097	NC_007181	CTGG	2	8	158240	158247	0 %	25 %	50 %	25 %	70606037
3098	NC_007181	TAT	2	6	158257	158262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606037
3099	NC_007181	TAG	2	6	158345	158350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606037
3100	NC_007181	ACAAGA	2	12	158381	158392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	70606037
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3104	NC_007181	TAAG	2	8	158469	158476	50 %	25 %	25 %	0 %	70606037
3105	NC_007181	CTT	2	6	158583	158588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606038
3106	NC_007181	ACTCT	2	10	158621	158630	20 %	40 %	0 %	40 %	70606038
3107	NC_007181	AT	3	6	158655	158660	50 %	50 %	0 %	0 %	70606038
3108	NC_007181	GAG	2	6	158742	158747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606038
3109	NC_007181	TGA	2	6	158804	158809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606038
3110	NC_007181	AT	3	6	158832	158837	50 %	50 %	0 %	0 %	70606038
3111	NC_007181	ATT	2	6	158858	158863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606038
3112	NC_007181	ATC	2	6	158869	158874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606038
3113	NC_007181	GGA	2	6	158915	158920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606038
3114	NC_007181	TAA	2	6	158941	158946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606038
3115	NC_007181	AT	3	6	159018	159023	50 %	50 %	0 %	0 %	70606038
3116	NC_007181	A	6	6	159030	159035	100 %	0 %	0 %	0 %	70606038
3117	NC_007181	TTA	2	6	159039	159044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606038
3118	NC_007181	TTG	2	6	159090	159095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606038
3119	NC_007181	TGGA	2	8	159138	159145	25 %	25 %	50 %	0 %	70606038
3120	NC_007181	ATA	2	6	159277	159282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606038
3121	NC_007181	GAG	2	6	159360	159365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606038
3122	NC_007181	TGA	2	6	159373	159378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606038
3123	NC_007181	ATG	2	6	159379	159384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606038
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3125	NC_007181	TGA	2	6	159428	159433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606038
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3127	NC_007181	AAT	2	6	159524	159529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606038
3128	NC_007181	ATA	2	6	159576	159581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606038
3129	NC_007181	AAT	2	6	159967	159972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606039
3130	NC_007181	TAC	2	6	160068	160073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606039
3131	NC_007181	TAT	2	6	160092	160097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606039
3132	NC_007181	AAT	2	6	160271	160276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606039
3133	NC_007181	AGT	2	6	160335	160340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606040
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3158	NC_007181	TA	3	6	161524	161529	50 %	50 %	0 %	0 %	70606040
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3239	NC_007181	AT	3	6	166045	166050	50 %	50 %	0 %	0 %	70606046
3240	NC_007181	TCC	2	6	166061	166066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606046
3241	NC_007181	T	6	6	166081	166086	0 %	100 %	0 %	0 %	70606046
3242	NC_007181	TATTTT	2	12	166147	166158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	70606046
3243	NC_007181	AG	3	6	166172	166177	50 %	0 %	50 %	0 %	70606046
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3245	NC_007181	TGAT	2	8	166215	166222	25 %	50 %	25 %	0 %	70606046
3246	NC_007181	AT	3	6	166236	166241	50 %	50 %	0 %	0 %	70606046
3247	NC_007181	TTG	2	6	166378	166383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606047
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3249	NC_007181	TGTT	2	8	166452	166459	0 %	75 %	25 %	0 %	70606047
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3500	NC_007181	CCT	2	6	178501	178506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606058

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