MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 39665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007181	ATA	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605889
502	NC_007181	TTA	2	6	24530	24535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
503	NC_007181	CAT	2	6	24618	24623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605890
504	NC_007181	AAT	2	6	24641	24646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605890
505	NC_007181	TTTA	2	8	24682	24689	25 %	75 %	0 %	0 %	70605890
506	NC_007181	TC	3	6	24740	24745	0 %	50 %	0 %	50 %	70605890
507	NC_007181	TC	4	8	24776	24783	0 %	50 %	0 %	50 %	70605890
508	NC_007181	AT	3	6	24816	24821	50 %	50 %	0 %	0 %	70605890
509	NC_007181	GA	3	6	24846	24851	50 %	0 %	50 %	0 %	70605890
510	NC_007181	AGA	2	6	24865	24870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605890
511	NC_007181	A	6	6	24933	24938	100 %	0 %	0 %	0 %	70605890
512	NC_007181	TAG	2	6	24982	24987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605890
513	NC_007181	GGA	2	6	25034	25039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605890
514	NC_007181	ATT	2	6	25052	25057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
515	NC_007181	ATA	2	6	25157	25162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605890
516	NC_007181	CTC	2	6	25231	25236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605890
517	NC_007181	GAT	2	6	25243	25248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605890
518	NC_007181	TCC	2	6	25280	25285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70605890
519	NC_007181	TTA	2	6	25292	25297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
520	NC_007181	T	8	8	25304	25311	0 %	100 %	0 %	0 %	70605890
521	NC_007181	TTA	2	6	25437	25442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
522	NC_007181	ATT	2	6	25483	25488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
523	NC_007181	ATT	2	6	25559	25564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605890
524	NC_007181	T	6	6	25613	25618	0 %	100 %	0 %	0 %	70605891
525	NC_007181	CAAAT	2	10	25619	25628	60 %	20 %	0 %	20 %	70605891
526	NC_007181	TAGAA	2	10	25671	25680	60 %	20 %	20 %	0 %	70605891
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529	NC_007181	TTA	2	6	25971	25976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
530	NC_007181	CAT	2	6	26014	26019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605891
531	NC_007181	TCCT	2	8	26050	26057	0 %	50 %	0 %	50 %	70605891
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533	NC_007181	TAT	2	6	26092	26097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
534	NC_007181	TAT	2	6	26151	26156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
535	NC_007181	T	6	6	26180	26185	0 %	100 %	0 %	0 %	70605891
536	NC_007181	ATA	2	6	26272	26277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605891
537	NC_007181	TA	3	6	26287	26292	50 %	50 %	0 %	0 %	70605891
538	NC_007181	GCA	2	6	26303	26308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70605891
539	NC_007181	CTT	2	6	26332	26337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605891
540	NC_007181	ATT	2	6	26372	26377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605891
541	NC_007181	GATT	2	8	26388	26395	25 %	50 %	25 %	0 %	70605891
542	NC_007181	TTG	2	6	26475	26480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70605891
543	NC_007181	A	6	6	26508	26513	100 %	0 %	0 %	0 %	70605892
544	NC_007181	AAGT	2	8	26610	26617	50 %	25 %	25 %	0 %	70605892
545	NC_007181	TCA	2	6	26644	26649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605892
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547	NC_007181	CTAA	2	8	26939	26946	50 %	25 %	0 %	25 %	70605892
548	NC_007181	TCA	2	6	26949	26954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605892
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551	NC_007181	TAA	2	6	27070	27075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605893
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554	NC_007181	TAG	2	6	27150	27155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70605893
555	NC_007181	ATA	2	6	27174	27179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605893
556	NC_007181	ATA	2	6	27324	27329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605893
557	NC_007181	TTTCAA	2	12	27357	27368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	70605893
558	NC_007181	GTAG	2	8	27400	27407	25 %	25 %	50 %	0 %	70605893
559	NC_007181	ACT	2	6	27472	27477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605893
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561	NC_007181	TTA	2	6	27545	27550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605893
562	NC_007181	AAC	2	6	27562	27567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70605893
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579	NC_007181	TAT	2	6	28653	28658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605895
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584	NC_007181	TAT	2	6	29034	29039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70605896
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598	NC_007181	GA	4	8	29767	29774	50 %	0 %	50 %	0 %	70605897
599	NC_007181	ACAGT	2	10	29807	29816	40 %	20 %	20 %	20 %	70605897
600	NC_007181	GAG	2	6	30016	30021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70605897
601	NC_007181	ATA	2	6	30143	30148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605898
602	NC_007181	AGTT	2	8	30183	30190	25 %	50 %	25 %	0 %	70605898
603	NC_007181	ATA	2	6	30194	30199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70605898
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611	NC_007181	TCA	2	6	30586	30591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605899
612	NC_007181	GAA	2	6	30597	30602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70605899
613	NC_007181	CTA	2	6	30629	30634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605899
614	NC_007181	T	6	6	30659	30664	0 %	100 %	0 %	0 %	70605899
615	NC_007181	TCT	2	6	30678	30683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70605899
616	NC_007181	TCTT	2	8	30703	30710	0 %	75 %	0 %	25 %	70605899
617	NC_007181	ATCT	2	8	30732	30739	25 %	50 %	0 %	25 %	70605899
618	NC_007181	CAG	2	6	30740	30745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70605899
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621	NC_007181	TA	3	6	30822	30827	50 %	50 %	0 %	0 %	70605899
622	NC_007181	CT	3	6	30828	30833	0 %	50 %	0 %	50 %	70605899
623	NC_007181	ATC	2	6	30840	30845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605899
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625	NC_007181	ATC	2	6	30861	30866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70605899
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