MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 39665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007181	AAT	2	6	265277	265282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606149
5002	NC_007181	GAA	2	6	265350	265355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606149
5003	NC_007181	A	6	6	265383	265388	100 %	0 %	0 %	0 %	70606149
5004	NC_007181	GA	3	6	265592	265597	50 %	0 %	50 %	0 %	70606150
5005	NC_007181	GTA	2	6	265668	265673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606150
5006	NC_007181	TTATTG	2	12	265699	265710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	70606150
5007	NC_007181	CTT	2	6	265736	265741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606150
5008	NC_007181	A	6	6	265758	265763	100 %	0 %	0 %	0 %	70606150
5009	NC_007181	TAA	2	6	265799	265804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606150
5010	NC_007181	TGAT	2	8	265809	265816	25 %	50 %	25 %	0 %	70606150
5011	NC_007181	AGA	2	6	265919	265924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606151
5012	NC_007181	GAT	2	6	265957	265962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606151
5013	NC_007181	CCA	2	6	266021	266026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606151
5014	NC_007181	AG	3	6	266045	266050	50 %	0 %	50 %	0 %	70606151
5015	NC_007181	GTT	2	6	266183	266188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606151
5016	NC_007181	TGT	2	6	266398	266403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606151
5017	NC_007181	GA	3	6	266479	266484	50 %	0 %	50 %	0 %	70606151
5018	NC_007181	GAG	2	6	266489	266494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606151
5019	NC_007181	A	7	7	266497	266503	100 %	0 %	0 %	0 %	70606151
5020	NC_007181	CA	3	6	266536	266541	50 %	0 %	0 %	50 %	70606151
5021	NC_007181	AGA	2	6	266578	266583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606151
5022	NC_007181	AGG	2	6	266597	266602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606151
5023	NC_007181	AG	4	8	266628	266635	50 %	0 %	50 %	0 %	70606151
5024	NC_007181	G	6	6	266640	266645	0 %	0 %	100 %	0 %	70606151
5025	NC_007181	TGA	2	6	266656	266661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606151
5026	NC_007181	CACAG	2	10	266746	266755	40 %	0 %	20 %	40 %	70606152
5027	NC_007181	CGT	2	6	266769	266774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606152
5028	NC_007181	TAC	2	6	266815	266820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606152
5029	NC_007181	ACC	2	6	266959	266964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606152
5030	NC_007181	TCC	2	6	266974	266979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606152
5031	NC_007181	GAG	2	6	267013	267018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606152
5032	NC_007181	TCT	2	6	267071	267076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606152
5033	NC_007181	TGA	2	6	267266	267271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606153
5034	NC_007181	AGA	2	6	267279	267284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606153
5035	NC_007181	AAAC	2	8	267291	267298	75 %	0 %	0 %	25 %	70606153
5036	NC_007181	GAA	2	6	267303	267308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606153
5037	NC_007181	TA	3	6	267377	267382	50 %	50 %	0 %	0 %	70606153
5038	NC_007181	CAA	2	6	267393	267398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606153
5039	NC_007181	TCT	2	6	267414	267419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606153
5040	NC_007181	TGA	2	6	267485	267490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606153
5041	NC_007181	AG	3	6	267492	267497	50 %	0 %	50 %	0 %	70606153
5042	NC_007181	ATA	2	6	267519	267524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606153
5043	NC_007181	GAG	2	6	267525	267530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606153
5044	NC_007181	TAG	2	6	267545	267550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606153
5045	NC_007181	TGA	2	6	267832	267837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606154
5046	NC_007181	TAA	2	6	267891	267896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606154
5047	NC_007181	CCA	2	6	267899	267904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606154
5048	NC_007181	AGG	2	6	267921	267926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5049	NC_007181	TGA	2	6	268027	268032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606154
5050	NC_007181	TAA	2	6	268041	268046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606154
5051	NC_007181	AGG	2	6	268117	268122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5052	NC_007181	AGA	2	6	268145	268150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606154
5053	NC_007181	AG	3	6	268226	268231	50 %	0 %	50 %	0 %	70606154
5054	NC_007181	AAG	2	6	268234	268239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606154
5055	NC_007181	ACA	2	6	268271	268276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606154
5056	NC_007181	GAG	2	6	268283	268288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5057	NC_007181	CT	4	8	268364	268371	0 %	50 %	0 %	50 %	70606154
5058	NC_007181	CAA	2	6	268431	268436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606154
5059	NC_007181	CAC	2	6	268482	268487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606154
5060	NC_007181	AAGA	2	8	268520	268527	75 %	0 %	25 %	0 %	70606154
5061	NC_007181	AT	3	6	268562	268567	50 %	50 %	0 %	0 %	70606154
5062	NC_007181	AGG	2	6	268578	268583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5063	NC_007181	AGG	2	6	268712	268717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5064	NC_007181	AGT	2	6	268750	268755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606154
5065	NC_007181	GA	3	6	268764	268769	50 %	0 %	50 %	0 %	70606154
5066	NC_007181	AAG	2	6	268892	268897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606154
5067	NC_007181	TTC	2	6	268916	268921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606154
5068	NC_007181	GCT	2	6	268934	268939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606154
5069	NC_007181	GATT	2	8	268980	268987	25 %	50 %	25 %	0 %	70606154
5070	NC_007181	TGA	2	6	269011	269016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606154
5071	NC_007181	GGA	2	6	269051	269056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5072	NC_007181	GT	3	6	269075	269080	0 %	50 %	50 %	0 %	70606154
5073	NC_007181	TAA	2	6	269163	269168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606154
5074	NC_007181	AGG	2	6	269169	269174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606154
5075	NC_007181	AGA	2	6	269179	269184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606154
5076	NC_007181	AT	3	6	269235	269240	50 %	50 %	0 %	0 %	70606154
5077	NC_007181	TGTAGG	2	12	269260	269271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	70606154
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5080	NC_007181	GT	3	6	269343	269348	0 %	50 %	50 %	0 %	70606154
5081	NC_007181	ACT	2	6	269408	269413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606154
5082	NC_007181	AGT	2	6	269548	269553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606154
5083	NC_007181	AT	3	6	269559	269564	50 %	50 %	0 %	0 %	70606154
5084	NC_007181	ATG	2	6	269582	269587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606154
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5089	NC_007181	GCT	3	9	269663	269671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606155
5090	NC_007181	GCA	2	6	269678	269683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606155
5091	NC_007181	AGG	2	6	269686	269691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606155
5092	NC_007181	A	6	6	269734	269739	100 %	0 %	0 %	0 %	70606155
5093	NC_007181	GAT	2	6	269752	269757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606155
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5095	NC_007181	GA	3	6	269807	269812	50 %	0 %	50 %	0 %	70606155
5096	NC_007181	AT	3	6	269874	269879	50 %	50 %	0 %	0 %	70606155
5097	NC_007181	TAA	2	6	269889	269894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606155
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5099	NC_007181	ATGG	2	8	269920	269927	25 %	25 %	50 %	0 %	70606155
5100	NC_007181	CAA	2	6	269930	269935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606155
5101	NC_007181	AGT	2	6	270010	270015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606155
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5104	NC_007181	TAA	2	6	270309	270314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606155
5105	NC_007181	AGA	3	9	270315	270323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606155
5106	NC_007181	TC	3	6	270324	270329	0 %	50 %	0 %	50 %	70606155
5107	NC_007181	AG	3	6	270355	270360	50 %	0 %	50 %	0 %	70606155
5108	NC_007181	TTAA	2	8	270491	270498	50 %	50 %	0 %	0 %	70606155
5109	NC_007181	GAA	2	6	270590	270595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606155
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5111	NC_007181	TTCA	2	8	270708	270715	25 %	50 %	0 %	25 %	70606155
5112	NC_007181	TTCCCT	2	12	270727	270738	0 %	50 %	0 %	50 %	70606155
5113	NC_007181	TTA	2	6	270759	270764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606155
5114	NC_007181	TA	3	6	270818	270823	50 %	50 %	0 %	0 %	70606156
5115	NC_007181	AG	3	6	270836	270841	50 %	0 %	50 %	0 %	70606156
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5119	NC_007181	TAG	2	6	270971	270976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606156
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5123	NC_007181	CTTA	2	8	271345	271352	25 %	50 %	0 %	25 %	70606157
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5125	NC_007181	AT	3	6	271471	271476	50 %	50 %	0 %	0 %	70606157
5126	NC_007181	TTA	2	6	271479	271484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606157
5127	NC_007181	AGC	2	6	271507	271512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606157
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5129	NC_007181	CTC	2	6	271553	271558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606157
5130	NC_007181	ATA	2	6	271577	271582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606157
5131	NC_007181	TAA	2	6	271665	271670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606157
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5142	NC_007181	TCC	2	6	272276	272281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606158
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5145	NC_007181	CT	3	6	272324	272329	0 %	50 %	0 %	50 %	70606159
5146	NC_007181	TGTA	2	8	272349	272356	25 %	50 %	25 %	0 %	70606159
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5237	NC_007181	CTA	2	6	278415	278420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606164
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5490	NC_007181	TACA	2	8	291206	291213	50 %	25 %	0 %	25 %	70606180
5491	NC_007181	TA	3	6	291214	291219	50 %	50 %	0 %	0 %	70606180
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5499	NC_007181	TCC	2	6	291763	291768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606181
5500	NC_007181	TATC	2	8	291951	291958	25 %	50 %	0 %	25 %	70606181

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