MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 39665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007181	ATG	2	6	237756	237761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606120
4502	NC_007181	GAT	2	6	237784	237789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606120
4503	NC_007181	ATT	2	6	237896	237901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606120
4504	NC_007181	AGA	2	6	237914	237919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606120
4505	NC_007181	CTA	2	6	237941	237946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606120
4506	NC_007181	TAG	2	6	237961	237966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606120
4507	NC_007181	CT	4	8	237972	237979	0 %	50 %	0 %	50 %	70606120
4508	NC_007181	AGG	2	6	238005	238010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606120
4509	NC_007181	CAA	2	6	238040	238045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606120
4510	NC_007181	AATT	2	8	238053	238060	50 %	50 %	0 %	0 %	70606120
4511	NC_007181	ATAA	2	8	238115	238122	75 %	25 %	0 %	0 %	70606120
4512	NC_007181	AGA	2	6	238123	238128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606120
4513	NC_007181	GAA	2	6	238142	238147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606120
4514	NC_007181	TAA	2	6	238230	238235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606120
4515	NC_007181	TCC	2	6	238246	238251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606120
4516	NC_007181	GAG	2	6	238291	238296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606120
4517	NC_007181	TAA	2	6	238414	238419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606120
4518	NC_007181	GTA	2	6	238424	238429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606120
4519	NC_007181	TGC	2	6	238438	238443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606120
4520	NC_007181	GAG	2	6	238514	238519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606120
4521	NC_007181	GTT	2	6	238556	238561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606120
4522	NC_007181	CCT	2	6	238571	238576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606120
4523	NC_007181	ACTT	2	8	238598	238605	25 %	50 %	0 %	25 %	70606120
4524	NC_007181	TAG	2	6	238623	238628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606120
4525	NC_007181	GA	3	6	238659	238664	50 %	0 %	50 %	0 %	70606120
4526	NC_007181	TTG	2	6	238734	238739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606120
4527	NC_007181	AAG	2	6	238774	238779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606120
4528	NC_007181	AC	3	6	238823	238828	50 %	0 %	0 %	50 %	70606120
4529	NC_007181	GAAA	2	8	238853	238860	75 %	0 %	25 %	0 %	70606120
4530	NC_007181	AAT	2	6	238897	238902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606120
4531	NC_007181	AATAAA	2	12	238943	238954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	70606120
4532	NC_007181	TTC	2	6	239095	239100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606120
4533	NC_007181	GTT	2	6	239108	239113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606120
4534	NC_007181	CTGG	2	8	239135	239142	0 %	25 %	50 %	25 %	70606120
4535	NC_007181	GTG	2	6	239165	239170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606120
4536	NC_007181	AT	3	6	239171	239176	50 %	50 %	0 %	0 %	70606120
4537	NC_007181	TGT	2	6	239182	239187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606120
4538	NC_007181	GGA	2	6	239189	239194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606120
4539	NC_007181	AGTA	2	8	239200	239207	50 %	25 %	25 %	0 %	70606120
4540	NC_007181	GTT	2	6	239209	239214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606120
4541	NC_007181	AGG	2	6	239229	239234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606120
4542	NC_007181	AT	3	6	239241	239246	50 %	50 %	0 %	0 %	70606120
4543	NC_007181	TAA	2	6	239317	239322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606120
4544	NC_007181	CAA	2	6	239323	239328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606120
4545	NC_007181	AGA	2	6	239339	239344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606120
4546	NC_007181	TGA	2	6	239358	239363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606120
4547	NC_007181	TAGTT	2	10	239424	239433	20 %	60 %	20 %	0 %	70606120
4548	NC_007181	ATG	2	6	239462	239467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606121
4549	NC_007181	TGT	2	6	239496	239501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606121
4550	NC_007181	TC	3	6	239528	239533	0 %	50 %	0 %	50 %	70606121
4551	NC_007181	TGG	2	6	239542	239547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606121
4552	NC_007181	CAA	2	6	239625	239630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606121
4553	NC_007181	AGATA	2	10	239668	239677	60 %	20 %	20 %	0 %	70606121
4554	NC_007181	CAA	2	6	239712	239717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606121
4555	NC_007181	GGA	2	6	239773	239778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606121
4556	NC_007181	CTAAAG	2	12	239835	239846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	70606121
4557	NC_007181	GTT	2	6	239887	239892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606121
4558	NC_007181	CTA	2	6	239908	239913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606121
4559	NC_007181	GGT	2	6	239955	239960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606121
4560	NC_007181	GA	3	6	239967	239972	50 %	0 %	50 %	0 %	70606121
4561	NC_007181	TCT	2	6	240004	240009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606121
4562	NC_007181	AGT	2	6	240122	240127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606121
4563	NC_007181	GTTA	2	8	240220	240227	25 %	50 %	25 %	0 %	70606121
4564	NC_007181	GAT	2	6	240289	240294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606121
4565	NC_007181	TGA	2	6	240328	240333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606122
4566	NC_007181	AC	3	6	240337	240342	50 %	0 %	0 %	50 %	70606122
4567	NC_007181	TAA	3	9	240355	240363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606122
4568	NC_007181	ATT	2	6	240392	240397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606122
4569	NC_007181	TAA	2	6	240529	240534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606122
4570	NC_007181	AAAT	2	8	240675	240682	75 %	25 %	0 %	0 %	70606122
4571	NC_007181	AG	3	6	240752	240757	50 %	0 %	50 %	0 %	70606123
4572	NC_007181	GAAG	2	8	240776	240783	50 %	0 %	50 %	0 %	70606123
4573	NC_007181	ATG	2	6	240814	240819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606123
4574	NC_007181	ATTT	2	8	240894	240901	25 %	75 %	0 %	0 %	70606123
4575	NC_007181	CTG	2	6	240935	240940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606123
4576	NC_007181	TATT	2	8	241004	241011	25 %	75 %	0 %	0 %	70606123
4577	NC_007181	TTA	2	6	241132	241137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606123
4578	NC_007181	TTA	2	6	241155	241160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606123
4579	NC_007181	AAT	2	6	241187	241192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606123
4580	NC_007181	TAGT	2	8	241197	241204	25 %	50 %	25 %	0 %	70606124
4581	NC_007181	TAC	2	6	241205	241210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606124
4582	NC_007181	TAA	3	9	241239	241247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606124
4583	NC_007181	TGG	2	6	241261	241266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606124
4584	NC_007181	ATT	2	6	241355	241360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606124
4585	NC_007181	TCC	2	6	241370	241375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606124
4586	NC_007181	AT	3	6	241472	241477	50 %	50 %	0 %	0 %	70606124
4587	NC_007181	CCATTA	2	12	241502	241513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606124
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4589	NC_007181	TTC	2	6	241583	241588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606124
4590	NC_007181	ATT	2	6	241650	241655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606125
4591	NC_007181	CTA	2	6	241713	241718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606125
4592	NC_007181	AAT	2	6	241719	241724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606125
4593	NC_007181	TGC	2	6	241726	241731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606125
4594	NC_007181	ATA	3	9	241765	241773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606125
4595	NC_007181	TA	4	8	241772	241779	50 %	50 %	0 %	0 %	70606125
4596	NC_007181	AAG	2	6	241820	241825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606125
4597	NC_007181	GCT	2	6	241856	241861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606125
4598	NC_007181	T	6	6	241936	241941	0 %	100 %	0 %	0 %	70606125
4599	NC_007181	ACCA	2	8	241944	241951	50 %	0 %	0 %	50 %	70606125
4600	NC_007181	ATCT	2	8	241956	241963	25 %	50 %	0 %	25 %	70606125
4601	NC_007181	TAG	2	6	242036	242041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606125
4602	NC_007181	TAT	2	6	242044	242049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606125
4603	NC_007181	CTA	2	6	242055	242060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606125
4604	NC_007181	TAT	2	6	242080	242085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606125
4605	NC_007181	AGT	2	6	242118	242123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606125
4606	NC_007181	ATC	2	6	242180	242185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606125
4607	NC_007181	CATT	2	8	242217	242224	25 %	50 %	0 %	25 %	70606125
4608	NC_007181	TTC	2	6	242449	242454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606126
4609	NC_007181	AAT	2	6	242464	242469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606126
4610	NC_007181	CAG	2	6	242549	242554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606126
4611	NC_007181	TTAT	2	8	242591	242598	25 %	75 %	0 %	0 %	70606126
4612	NC_007181	ATCC	2	8	242602	242609	25 %	25 %	0 %	50 %	70606126
4613	NC_007181	AGG	2	6	242637	242642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606126
4614	NC_007181	TTC	2	6	242734	242739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606126
4615	NC_007181	CT	3	6	242771	242776	0 %	50 %	0 %	50 %	70606126
4616	NC_007181	CCTC	2	8	242816	242823	0 %	25 %	0 %	75 %	70606126
4617	NC_007181	TCCA	2	8	242828	242835	25 %	25 %	0 %	50 %	70606126
4618	NC_007181	GAG	2	6	243116	243121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606127
4619	NC_007181	GGTT	2	8	243128	243135	0 %	50 %	50 %	0 %	70606127
4620	NC_007181	AAT	2	6	243242	243247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606127
4621	NC_007181	TGA	2	6	243304	243309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606127
4622	NC_007181	TGG	2	6	243331	243336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606127
4623	NC_007181	TTA	2	6	243337	243342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606127
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4625	NC_007181	CTT	2	6	243837	243842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606128
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