MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeC

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007171	AGT	2	6	556	561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535051
2	NC_007171	TAA	2	6	637	642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
3	NC_007171	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535051
4	NC_007171	GAA	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535051
5	NC_007171	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535051
6	NC_007171	AAT	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
7	NC_007171	AAT	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
8	NC_007171	AGA	3	9	1333	1341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535051
9	NC_007171	AAC	3	9	1359	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535051
10	NC_007171	ACA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535051
11	NC_007171	TAA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535052
12	NC_007171	CAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535052
13	NC_007171	CCT	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	68535053
14	NC_007171	TTA	2	6	1993	1998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
15	NC_007171	TAT	3	9	2037	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
16	NC_007171	ATA	2	6	2070	2075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
17	NC_007171	AAT	2	6	2083	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
18	NC_007171	AAC	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535054
19	NC_007171	CAA	2	6	2225	2230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535054
20	NC_007171	ATA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
21	NC_007171	ATT	2	6	2263	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
22	NC_007171	ATA	2	6	2294	2299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
23	NC_007171	TAC	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535054
24	NC_007171	ATA	2	6	2417	2422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
25	NC_007171	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
26	NC_007171	TAA	3	9	2621	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
27	NC_007171	ATA	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
28	NC_007171	ATA	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
29	NC_007171	TAC	3	9	2696	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535054
30	NC_007171	AAT	2	6	2845	2850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
31	NC_007171	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
32	NC_007171	CTT	3	9	3168	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
33	NC_007171	TCA	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
34	NC_007171	CTT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
35	NC_007171	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
36	NC_007171	CTT	2	6	3252	3257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
37	NC_007171	ATC	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
38	NC_007171	TAA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535055
39	NC_007171	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535055
40	NC_007171	ACT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
41	NC_007171	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68535055
42	NC_007171	TTC	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
43	NC_007171	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535055
44	NC_007171	TCT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
45	NC_007171	TTG	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535055
46	NC_007171	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535056
47	NC_007171	GAA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535056
48	NC_007171	TCT	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535056
49	NC_007171	TAA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535056
50	NC_007171	ATA	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535056
51	NC_007171	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535056
52	NC_007171	GTT	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535056
53	NC_007171	TGA	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535056
54	NC_007171	GCA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535056
55	NC_007171	AAC	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535057
56	NC_007171	ACT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535057
57	NC_007171	ATA	2	6	4794	4799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535057
58	NC_007171	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
59	NC_007171	TGA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535057
60	NC_007171	AGA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
61	NC_007171	TAA	2	6	5053	5058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535057
62	NC_007171	GAC	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535057
63	NC_007171	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
64	NC_007171	ATT	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
65	NC_007171	TGC	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68535057
66	NC_007171	CAT	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535057
67	NC_007171	TTA	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
68	NC_007171	GAA	2	6	5606	5611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
69	NC_007171	TGA	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535058
70	NC_007171	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535059
71	NC_007171	GAT	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535059
72	NC_007171	CAA	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535059
73	NC_007171	CGA	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535060
74	NC_007171	GAA	2	6	6529	6534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535060
75	NC_007171	AGT	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535060
76	NC_007171	ATT	2	6	6631	6636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535060
77	NC_007171	ATC	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535060
78	NC_007171	AAC	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535060
79	NC_007171	AGA	2	6	7164	7169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535060
80	NC_007171	ACA	2	6	7194	7199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535060
81	NC_007171	TGA	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535060
82	NC_007171	TTG	2	6	7364	7369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535060
83	NC_007171	ATT	2	6	7429	7434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535060
84	NC_007171	TTA	2	6	7497	7502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535061
85	NC_007171	TAA	2	6	7531	7536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535061
86	NC_007171	CAA	2	6	7571	7576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535061
87	NC_007171	AGA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535061
88	NC_007171	ATC	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535061
89	NC_007171	ATG	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535061
90	NC_007171	TGA	2	6	7678	7683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535061
91	NC_007171	ACA	2	6	7831	7836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535061
92	NC_007171	ATT	2	6	7924	7929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535061

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.