MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 9076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006905	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	62178572
2	NC_006905	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	62178572
3	NC_006905	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	62178573
4	NC_006905	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	62178574
5	NC_006905	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	62178574
6	NC_006905	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	62178574
7	NC_006905	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	62178574
8	NC_006905	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	62178574
9	NC_006905	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	62178576
10	NC_006905	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	62178576
11	NC_006905	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	62178576
12	NC_006905	TGAT	2	8	7816	7823	25 %	50 %	25 %	0 %	162139625
13	NC_006905	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	162139625
14	NC_006905	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	162139625
15	NC_006905	TCCG	2	8	9279	9286	0 %	25 %	25 %	50 %	62178578
16	NC_006905	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	62178579
17	NC_006905	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	62178580
18	NC_006905	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	62178581
19	NC_006905	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	62178581
20	NC_006905	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	62178581
21	NC_006905	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	62178582
22	NC_006905	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	62178582
23	NC_006905	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	62178582
24	NC_006905	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	62178582
25	NC_006905	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	62178582
26	NC_006905	GCGT	2	8	12931	12938	0 %	25 %	50 %	25 %	62178582
27	NC_006905	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	62178582
28	NC_006905	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	62178583
29	NC_006905	TCAG	2	8	15244	15251	25 %	25 %	25 %	25 %	62178584
30	NC_006905	TTTG	2	8	15534	15541	0 %	75 %	25 %	0 %	62178584
31	NC_006905	CGAA	2	8	15749	15756	50 %	0 %	25 %	25 %	62178584
32	NC_006905	ATTG	2	8	15761	15768	25 %	50 %	25 %	0 %	62178584
33	NC_006905	ATTA	2	8	16429	16436	50 %	50 %	0 %	0 %	62178585
34	NC_006905	ATAA	2	8	16521	16528	75 %	25 %	0 %	0 %	62178586
35	NC_006905	CCAA	2	8	21284	21291	50 %	0 %	0 %	50 %	62178588
36	NC_006905	GACG	2	8	21630	21637	25 %	0 %	50 %	25 %	62178588
37	NC_006905	TGGC	2	8	22283	22290	0 %	25 %	50 %	25 %	62178588
38	NC_006905	TGGC	2	8	22389	22396	0 %	25 %	50 %	25 %	62178588
39	NC_006905	CGCC	2	8	22655	22662	0 %	0 %	25 %	75 %	62178588
40	NC_006905	CTGG	2	8	23001	23008	0 %	25 %	50 %	25 %	62178588
41	NC_006905	TTTA	2	8	23499	23506	25 %	75 %	0 %	0 %	62178589
42	NC_006905	CTGA	2	8	23852	23859	25 %	25 %	25 %	25 %	62178589
43	NC_006905	TCTG	2	8	23956	23963	0 %	50 %	25 %	25 %	62178589
44	NC_006905	TGAA	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	62178590
45	NC_006905	CCAG	2	8	24738	24745	25 %	0 %	25 %	50 %	62178590
46	NC_006905	ACCG	2	8	25415	25422	25 %	0 %	25 %	50 %	62178591
47	NC_006905	AAAT	2	8	25475	25482	75 %	25 %	0 %	0 %	62178591
48	NC_006905	ATTA	2	8	28525	28532	50 %	50 %	0 %	0 %	62178592
49	NC_006905	ATGA	2	8	29972	29979	50 %	25 %	25 %	0 %	62178593
50	NC_006905	TGCT	2	8	30542	30549	0 %	50 %	25 %	25 %	62178595
51	NC_006905	TATC	2	8	30598	30605	25 %	50 %	0 %	25 %	62178595
52	NC_006905	GTAA	2	8	30635	30642	50 %	25 %	25 %	0 %	62178595
53	NC_006905	TTCG	2	8	30897	30904	0 %	50 %	25 %	25 %	62178595
54	NC_006905	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	62178596
55	NC_006905	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	62178597
56	NC_006905	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	62178597
57	NC_006905	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	62178598
58	NC_006905	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	62178598
59	NC_006905	CTTA	2	8	34944	34951	25 %	50 %	0 %	25 %	62178601
60	NC_006905	AATC	2	8	35350	35357	50 %	25 %	0 %	25 %	62178601
61	NC_006905	TAGA	2	8	35489	35496	50 %	25 %	25 %	0 %	62178601
62	NC_006905	TAAA	2	8	35671	35678	75 %	25 %	0 %	0 %	62178601
63	NC_006905	ACCG	2	8	37322	37329	25 %	0 %	25 %	50 %	62178602
64	NC_006905	TGAT	2	8	37606	37613	25 %	50 %	25 %	0 %	62178602
65	NC_006905	TGGT	2	8	37651	37658	0 %	50 %	50 %	0 %	62178602
66	NC_006905	AATG	2	8	38129	38136	50 %	25 %	25 %	0 %	62178602
67	NC_006905	CCTG	2	8	38708	38715	0 %	25 %	25 %	50 %	62178603
68	NC_006905	TGCC	2	8	39294	39301	0 %	25 %	25 %	50 %	62178603
69	NC_006905	GACG	2	8	39331	39338	25 %	0 %	50 %	25 %	62178603
70	NC_006905	ATTA	2	8	39638	39645	50 %	50 %	0 %	0 %	62178603
71	NC_006905	AATC	2	8	39734	39741	50 %	25 %	0 %	25 %	62178603
72	NC_006905	GAAA	2	8	41161	41168	75 %	0 %	25 %	0 %	62178604
73	NC_006905	GCTG	2	8	41367	41374	0 %	25 %	50 %	25 %	62178604
74	NC_006905	CACG	2	8	42065	42072	25 %	0 %	25 %	50 %	62178605
75	NC_006905	CAGC	2	8	42092	42099	25 %	0 %	25 %	50 %	62178605
76	NC_006905	CTGC	2	8	42229	42236	0 %	25 %	25 %	50 %	62178605
77	NC_006905	CATG	2	8	42797	42804	25 %	25 %	25 %	25 %	62178606
78	NC_006905	AGTA	2	8	43592	43599	50 %	25 %	25 %	0 %	62178606
79	NC_006905	CCAG	2	8	43649	43656	25 %	0 %	25 %	50 %	62178606
80	NC_006905	TTGA	2	8	44430	44437	25 %	50 %	25 %	0 %	62178606
81	NC_006905	CATA	2	8	47143	47150	50 %	25 %	0 %	25 %	62178609
82	NC_006905	TCAG	2	8	47154	47161	25 %	25 %	25 %	25 %	62178609
83	NC_006905	TGGC	2	8	47868	47875	0 %	25 %	50 %	25 %	62178609
84	NC_006905	GTTC	2	8	50285	50292	0 %	50 %	25 %	25 %	62178610
85	NC_006905	AGCC	2	8	51695	51702	25 %	0 %	25 %	50 %	62178612
86	NC_006905	AAAG	2	8	51774	51781	75 %	0 %	25 %	0 %	62178612
87	NC_006905	ATGG	2	8	51907	51914	25 %	25 %	50 %	0 %	62178612
88	NC_006905	TGAT	2	8	52579	52586	25 %	50 %	25 %	0 %	62178613
89	NC_006905	TGGA	2	8	53248	53255	25 %	25 %	50 %	0 %	62178614
90	NC_006905	GATT	2	8	53646	53653	25 %	50 %	25 %	0 %	62178614
91	NC_006905	GATC	2	8	54015	54022	25 %	25 %	25 %	25 %	62178614
92	NC_006905	CTGG	2	8	55140	55147	0 %	25 %	50 %	25 %	62178615
93	NC_006905	GTGG	2	8	55305	55312	0 %	25 %	75 %	0 %	62178615
94	NC_006905	CTGC	2	8	55515	55522	0 %	25 %	25 %	50 %	62178616
95	NC_006905	ACCA	2	8	56151	56158	50 %	0 %	0 %	50 %	62178617
96	NC_006905	GTGG	2	8	56186	56193	0 %	25 %	75 %	0 %	62178617
97	NC_006905	CATT	2	8	56376	56383	25 %	50 %	0 %	25 %	62178617
98	NC_006905	TCAA	2	8	57417	57424	50 %	25 %	0 %	25 %	62178617
99	NC_006905	CGCC	2	8	57831	57838	0 %	0 %	25 %	75 %	62178618
100	NC_006905	GCCA	2	8	59003	59010	25 %	0 %	25 %	50 %	62178618
101	NC_006905	GCTG	2	8	59391	59398	0 %	25 %	50 %	25 %	62178619
102	NC_006905	CCAG	2	8	60423	60430	25 %	0 %	25 %	50 %	62178619
103	NC_006905	TTCA	2	8	61141	61148	25 %	50 %	0 %	25 %	62178620
104	NC_006905	GAAG	2	8	61893	61900	50 %	0 %	50 %	0 %	62178621
105	NC_006905	CAGA	2	8	62066	62073	50 %	0 %	25 %	25 %	62178621
106	NC_006905	TTTC	2	8	62339	62346	0 %	75 %	0 %	25 %	62178621
107	NC_006905	AGTC	2	8	62498	62505	25 %	25 %	25 %	25 %	62178621
108	NC_006905	TAAT	2	8	62540	62547	50 %	50 %	0 %	0 %	62178621
109	NC_006905	ATTT	2	8	62926	62933	25 %	75 %	0 %	0 %	62178622
110	NC_006905	GTCG	2	8	62958	62965	0 %	25 %	50 %	25 %	62178622
111	NC_006905	GCAG	2	8	63243	63250	25 %	0 %	50 %	25 %	62178622
112	NC_006905	ACCG	2	8	63469	63476	25 %	0 %	25 %	50 %	62178622
113	NC_006905	GATC	2	8	63615	63622	25 %	25 %	25 %	25 %	62178622
114	NC_006905	GGCA	2	8	63989	63996	25 %	0 %	50 %	25 %	62178623
115	NC_006905	TCCA	2	8	64031	64038	25 %	25 %	0 %	50 %	62178623
116	NC_006905	GCAG	2	8	64202	64209	25 %	0 %	50 %	25 %	62178623
117	NC_006905	GAAG	2	8	64867	64874	50 %	0 %	50 %	0 %	62178624
118	NC_006905	AAGG	2	8	65124	65131	50 %	0 %	50 %	0 %	62178624
119	NC_006905	CTGA	2	8	65733	65740	25 %	25 %	25 %	25 %	62178625
120	NC_006905	CAAT	2	8	66167	66174	50 %	25 %	0 %	25 %	62178625
121	NC_006905	ATGG	2	8	66931	66938	25 %	25 %	50 %	0 %	62178626
122	NC_006905	GTTG	2	8	67256	67263	0 %	50 %	50 %	0 %	62178627
123	NC_006905	ATGG	2	8	67388	67395	25 %	25 %	50 %	0 %	62178627
124	NC_006905	CGGG	2	8	68906	68913	0 %	0 %	75 %	25 %	62178628
125	NC_006905	TCCT	2	8	70093	70100	0 %	50 %	0 %	50 %	62178630
126	NC_006905	CTTA	2	8	70121	70128	25 %	50 %	0 %	25 %	62178630
127	NC_006905	GACC	2	8	71290	71297	25 %	0 %	25 %	50 %	62178631
128	NC_006905	TCCT	2	8	71632	71639	0 %	50 %	0 %	50 %	62178631
129	NC_006905	CCAA	2	8	71723	71730	50 %	0 %	0 %	50 %	62178631
130	NC_006905	TCGG	2	8	72263	72270	0 %	25 %	50 %	25 %	62178631
131	NC_006905	CGCA	2	8	72290	72297	25 %	0 %	25 %	50 %	62178631
132	NC_006905	CTGG	2	8	72638	72645	0 %	25 %	50 %	25 %	62178631
133	NC_006905	CCGT	2	8	72788	72795	0 %	25 %	25 %	50 %	62178631
134	NC_006905	GGCG	2	8	73477	73484	0 %	0 %	75 %	25 %	62178631
135	NC_006905	TTGT	2	8	74790	74797	0 %	75 %	25 %	0 %	62178632
136	NC_006905	GAAA	2	8	74912	74919	75 %	0 %	25 %	0 %	62178632
137	NC_006905	CGTC	2	8	75123	75130	0 %	25 %	25 %	50 %	62178633
138	NC_006905	CGGT	2	8	75145	75152	0 %	25 %	50 %	25 %	62178633
139	NC_006905	GCCT	2	8	75532	75539	0 %	25 %	25 %	50 %	62178633
140	NC_006905	CAGC	2	8	76401	76408	25 %	0 %	25 %	50 %	62178634
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