MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006905	GCG	2	6	218903	218908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178760
4002	NC_006905	CG	3	6	218914	218919	0 %	0 %	50 %	50 %	62178760
4003	NC_006905	GGC	2	6	219009	219014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178760
4004	NC_006905	GCA	2	6	219036	219041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4005	NC_006905	GTC	2	6	219043	219048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4006	NC_006905	GAC	2	6	219114	219119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4007	NC_006905	ACA	2	6	219122	219127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178760
4008	NC_006905	AAC	2	6	219193	219198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178760
4009	NC_006905	GCG	2	6	219224	219229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178760
4010	NC_006905	GACGCC	2	12	219264	219275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	62178760
4011	NC_006905	CGC	2	6	219287	219292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178760
4012	NC_006905	TGG	2	6	219302	219307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178760
4013	NC_006905	ACG	2	6	219323	219328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4014	NC_006905	GCG	2	6	219344	219349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178760
4015	NC_006905	GGAC	2	8	219371	219378	25 %	0 %	50 %	25 %	62178760
4016	NC_006905	CAG	2	6	219397	219402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4017	NC_006905	GAT	2	6	219408	219413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178760
4018	NC_006905	GCA	3	9	219414	219422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4019	NC_006905	CAG	2	6	219424	219429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4020	NC_006905	GTC	2	6	219453	219458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4021	NC_006905	GCA	2	6	219465	219470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4022	NC_006905	GCA	2	6	219477	219482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178760
4023	NC_006905	GCC	2	6	219486	219491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178760
4024	NC_006905	AGA	2	6	219495	219500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178760
4025	NC_006905	CGG	2	6	219540	219545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178760
4026	NC_006905	CTC	2	6	219874	219879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178761
4027	NC_006905	GTA	2	6	219899	219904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178761
4028	NC_006905	TGTC	2	8	219924	219931	0 %	50 %	25 %	25 %	62178761
4029	NC_006905	GGC	2	6	219940	219945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178761
4030	NC_006905	AGA	2	6	219958	219963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178761
4031	NC_006905	CGC	2	6	220027	220032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178761
4032	NC_006905	ACC	2	6	220049	220054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178761
4033	NC_006905	A	6	6	220074	220079	100 %	0 %	0 %	0 %	62178761
4034	NC_006905	GGT	2	6	220096	220101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178761
4035	NC_006905	AGATGC	2	12	220113	220124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62178761
4036	NC_006905	CAGT	2	8	220133	220140	25 %	25 %	25 %	25 %	62178761
4037	NC_006905	AAG	2	6	220143	220148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178761
4038	NC_006905	GTTGA	2	10	220328	220337	20 %	40 %	40 %	0 %	62178761
4039	NC_006905	ACT	2	6	220412	220417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178761
4040	NC_006905	GAAA	2	8	220426	220433	75 %	0 %	25 %	0 %	62178761
4041	NC_006905	TTCAA	2	10	220434	220443	40 %	40 %	0 %	20 %	62178761
4042	NC_006905	GGAC	2	8	220449	220456	25 %	0 %	50 %	25 %	62178761
4043	NC_006905	CAA	2	6	220542	220547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178761
4044	NC_006905	AGC	2	6	220551	220556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178761
4045	NC_006905	TGA	2	6	220612	220617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178761
4046	NC_006905	GAAC	2	8	220651	220658	50 %	0 %	25 %	25 %	62178761
4047	NC_006905	CTA	2	6	220669	220674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178761
4048	NC_006905	GGCT	2	8	220676	220683	0 %	25 %	50 %	25 %	62178761
4049	NC_006905	TGG	2	6	220785	220790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178761
4050	NC_006905	A	6	6	220869	220874	100 %	0 %	0 %	0 %	62178761
4051	NC_006905	GCG	2	6	220895	220900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178761
4052	NC_006905	AGCG	2	8	220937	220944	25 %	0 %	50 %	25 %	62178761
4053	NC_006905	ATGCGT	2	12	221033	221044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	62178761
4054	NC_006905	GC	3	6	221070	221075	0 %	0 %	50 %	50 %	62178761
4055	NC_006905	ATC	2	6	221100	221105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178761
4056	NC_006905	CGG	2	6	221122	221127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178761
4057	NC_006905	AAAC	2	8	221156	221163	75 %	0 %	0 %	25 %	62178761
4058	NC_006905	GGAAT	2	10	221188	221197	40 %	20 %	40 %	0 %	62178761
4059	NC_006905	CGG	2	6	221215	221220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178761
4060	NC_006905	AAGC	2	8	221237	221244	50 %	0 %	25 %	25 %	62178761
4061	NC_006905	AT	3	6	221284	221289	50 %	50 %	0 %	0 %	62178761
4062	NC_006905	ACC	2	6	221301	221306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178761
4063	NC_006905	GTT	3	9	221489	221497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178761
4064	NC_006905	CCAA	2	8	221546	221553	50 %	0 %	0 %	50 %	62178761
4065	NC_006905	AGC	2	6	221614	221619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178761
4066	NC_006905	CGT	2	6	221730	221735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178761
4067	NC_006905	ACG	2	6	221757	221762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178761
4068	NC_006905	GCAGC	2	10	221847	221856	20 %	0 %	40 %	40 %	62178761
4069	NC_006905	GATG	2	8	221860	221867	25 %	25 %	50 %	0 %	62178761
4070	NC_006905	GTC	2	6	221870	221875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178761
4071	NC_006905	TAA	2	6	221929	221934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178761
4072	NC_006905	GCT	2	6	221961	221966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178761
4073	NC_006905	CATT	2	8	222097	222104	25 %	50 %	0 %	25 %	162139617
4074	NC_006905	ACC	2	6	222110	222115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162139617
4075	NC_006905	CT	3	6	222168	222173	0 %	50 %	0 %	50 %	162139617
4076	NC_006905	GCC	2	6	222255	222260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162139617
4077	NC_006905	AGC	2	6	222317	222322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139617
4078	NC_006905	CAA	2	6	222356	222361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162139617
4079	NC_006905	GGAA	2	8	222373	222380	50 %	0 %	50 %	0 %	162139617
4080	NC_006905	TGG	2	6	222396	222401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139617
4081	NC_006905	GC	3	6	222426	222431	0 %	0 %	50 %	50 %	162139617
4082	NC_006905	CGG	2	6	222529	222534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139617
4083	NC_006905	GC	3	6	222544	222549	0 %	0 %	50 %	50 %	162139617
4084	NC_006905	CTG	3	9	222587	222595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139617
4085	NC_006905	CAG	2	6	222665	222670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139617
4086	NC_006905	GGT	2	6	222682	222687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139617
4087	NC_006905	TGC	2	6	222693	222698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139617
4088	NC_006905	GGC	2	6	222712	222717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139617
4089	NC_006905	ATT	2	6	222729	222734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162139617
4090	NC_006905	CGG	2	6	222748	222753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139617
4091	NC_006905	CGG	2	6	222846	222851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162139617
4092	NC_006905	CGC	2	6	222904	222909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4093	NC_006905	TTA	2	6	222913	222918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178763
4094	NC_006905	CGC	2	6	222935	222940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4095	NC_006905	CCG	2	6	222984	222989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4096	NC_006905	GCT	3	9	223020	223028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178763
4097	NC_006905	TGGCG	2	10	223050	223059	0 %	20 %	60 %	20 %	62178763
4098	NC_006905	CCG	2	6	223093	223098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4099	NC_006905	TGAT	2	8	223112	223119	25 %	50 %	25 %	0 %	62178763
4100	NC_006905	CTG	2	6	223150	223155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178763
4101	NC_006905	CGT	2	6	223169	223174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178763
4102	NC_006905	TGGTC	2	10	223178	223187	0 %	40 %	40 %	20 %	62178763
4103	NC_006905	CGCT	2	8	223285	223292	0 %	25 %	25 %	50 %	62178763
4104	NC_006905	GCCA	2	8	223366	223373	25 %	0 %	25 %	50 %	62178763
4105	NC_006905	CCG	2	6	223389	223394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4106	NC_006905	G	6	6	223396	223401	0 %	0 %	100 %	0 %	62178763
4107	NC_006905	TGA	2	6	223412	223417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178763
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4109	NC_006905	CGG	2	6	223538	223543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178763
4110	NC_006905	ATCG	2	8	223549	223556	25 %	25 %	25 %	25 %	62178763
4111	NC_006905	AAG	2	6	223571	223576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178763
4112	NC_006905	CGC	2	6	223634	223639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4113	NC_006905	CCG	2	6	223688	223693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178763
4114	NC_006905	GGA	2	6	223756	223761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178763
4115	NC_006905	GGC	2	6	223794	223799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178764
4116	NC_006905	GCC	2	6	223858	223863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178764
4117	NC_006905	TGTT	2	8	223888	223895	0 %	75 %	25 %	0 %	62178764
4118	NC_006905	CTG	2	6	223901	223906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
4119	NC_006905	CAGT	2	8	223943	223950	25 %	25 %	25 %	25 %	62178764
4120	NC_006905	CAT	2	6	223982	223987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178764
4121	NC_006905	GAT	2	6	223994	223999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178764
4122	NC_006905	CTG	2	6	224013	224018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
4123	NC_006905	GCT	2	6	224036	224041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
4124	NC_006905	GC	3	6	224134	224139	0 %	0 %	50 %	50 %	62178764
4125	NC_006905	GC	3	6	224179	224184	0 %	0 %	50 %	50 %	62178764
4126	NC_006905	GCC	2	6	224199	224204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178764
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4128	NC_006905	GC	3	6	224227	224232	0 %	0 %	50 %	50 %	62178764
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4135	NC_006905	CTG	2	6	224577	224582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
4136	NC_006905	GCT	2	6	224627	224632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
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4140	NC_006905	GC	3	6	224785	224790	0 %	0 %	50 %	50 %	62178764
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4144	NC_006905	GGC	2	6	224861	224866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178764
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4154	NC_006905	CTGC	2	8	225192	225199	0 %	25 %	25 %	50 %	62178764
4155	NC_006905	GCG	3	9	225213	225221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178764
4156	NC_006905	CTG	2	6	225225	225230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
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4160	NC_006905	TGC	2	6	225316	225321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178764
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4230	NC_006905	ATG	2	6	230085	230090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178767
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4237	NC_006905	T	6	6	230494	230499	0 %	100 %	0 %	0 %	62178767
4238	NC_006905	CCGC	2	8	230501	230508	0 %	0 %	25 %	75 %	62178767
4239	NC_006905	GCA	2	6	230531	230536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178767
4240	NC_006905	TAC	2	6	230604	230609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178767
4241	NC_006905	GTG	2	6	230610	230615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178767
4242	NC_006905	CCAG	2	8	230649	230656	25 %	0 %	25 %	50 %	62178767
4243	NC_006905	GC	3	6	230761	230766	0 %	0 %	50 %	50 %	62178767
4244	NC_006905	ACA	2	6	230794	230799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178767
4245	NC_006905	GCCGC	2	10	230976	230985	0 %	0 %	40 %	60 %	62178768
4246	NC_006905	CGG	2	6	230999	231004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178768
4247	NC_006905	GAC	2	6	231029	231034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178768
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4356	NC_006905	AACC	2	8	236567	236574	50 %	0 %	0 %	50 %	62178774
4357	NC_006905	CTTC	2	8	236605	236612	0 %	50 %	0 %	50 %	62178774
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4494	NC_006905	GTC	2	6	243509	243514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178781
4495	NC_006905	CTT	2	6	243613	243618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178781
4496	NC_006905	CCA	2	6	243643	243648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178781
4497	NC_006905	CTT	2	6	243745	243750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178781
4498	NC_006905	CGAT	2	8	243765	243772	25 %	25 %	25 %	25 %	62178781
4499	NC_006905	CATA	2	8	243811	243818	50 %	25 %	0 %	25 %	62178781
4500	NC_006905	GTG	2	6	244097	244102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178782

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