MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_006905	ACC	2	6	169712	169717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178719
3003	NC_006905	CAG	2	6	169726	169731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3004	NC_006905	AGC	2	6	169763	169768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3005	NC_006905	ACG	2	6	169784	169789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3006	NC_006905	CGC	2	6	169818	169823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178719
3007	NC_006905	CAG	2	6	169837	169842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3008	NC_006905	CTG	2	6	169861	169866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3009	NC_006905	GCG	2	6	169925	169930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178719
3010	NC_006905	CGG	2	6	170010	170015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178719
3011	NC_006905	GCA	2	6	170031	170036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3012	NC_006905	A	6	6	170067	170072	100 %	0 %	0 %	0 %	62178719
3013	NC_006905	GATA	2	8	170082	170089	50 %	25 %	25 %	0 %	62178719
3014	NC_006905	GCG	2	6	170138	170143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178719
3015	NC_006905	CCG	2	6	170165	170170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178719
3016	NC_006905	ATA	2	6	170180	170185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178719
3017	NC_006905	CAT	3	9	170191	170199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178719
3018	NC_006905	GCC	2	6	170230	170235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178719
3019	NC_006905	TAA	2	6	170334	170339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178719
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3021	NC_006905	AT	3	6	170459	170464	50 %	50 %	0 %	0 %	62178719
3022	NC_006905	AGT	2	6	170514	170519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178719
3023	NC_006905	GCC	2	6	170545	170550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178719
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3027	NC_006905	CGC	2	6	170730	170735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178719
3028	NC_006905	GCT	2	6	170781	170786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3029	NC_006905	TGC	2	6	170792	170797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178719
3030	NC_006905	CAT	2	6	170806	170811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178719
3031	NC_006905	CCAA	2	8	171394	171401	50 %	0 %	0 %	50 %	62178720
3032	NC_006905	AGC	3	9	171420	171428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178720
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3034	NC_006905	CGAAG	2	10	171547	171556	40 %	0 %	40 %	20 %	62178720
3035	NC_006905	TTG	2	6	171560	171565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178720
3036	NC_006905	TCG	2	6	171568	171573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178720
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3038	NC_006905	AGC	2	6	171599	171604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178720
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3040	NC_006905	TTA	2	6	171709	171714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178720
3041	NC_006905	GCA	2	6	171726	171731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178720
3042	NC_006905	GCG	2	6	171851	171856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178720
3043	NC_006905	TGC	2	6	171954	171959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178720
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3046	NC_006905	CGT	2	6	172094	172099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178720
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3050	NC_006905	GGC	2	6	172436	172441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178721
3051	NC_006905	CAT	2	6	172567	172572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178721
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3053	NC_006905	GC	3	6	172582	172587	0 %	0 %	50 %	50 %	62178721
3054	NC_006905	A	6	6	172592	172597	100 %	0 %	0 %	0 %	62178721
3055	NC_006905	GGC	2	6	172610	172615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178721
3056	NC_006905	ATG	2	6	172650	172655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178721
3057	NC_006905	TTC	2	6	172670	172675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178721
3058	NC_006905	GC	3	6	172679	172684	0 %	0 %	50 %	50 %	62178721
3059	NC_006905	GGC	2	6	172697	172702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178721
3060	NC_006905	TC	3	6	172728	172733	0 %	50 %	0 %	50 %	62178721
3061	NC_006905	CG	3	6	172748	172753	0 %	0 %	50 %	50 %	62178721
3062	NC_006905	GTC	2	6	172764	172769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178721
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3067	NC_006905	CTG	2	6	173201	173206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178721
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3088	NC_006905	TAC	2	6	173963	173968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178721
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3101	NC_006905	TAC	3	9	174356	174364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178721
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3103	NC_006905	CAG	2	6	174405	174410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178721
3104	NC_006905	GCT	2	6	174481	174486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178721
3105	NC_006905	CGTG	2	8	174511	174518	0 %	25 %	50 %	25 %	62178721
3106	NC_006905	CCT	2	6	174576	174581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178721
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3109	NC_006905	TGA	2	6	174672	174677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178721
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3111	NC_006905	GAC	2	6	174752	174757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178721
3112	NC_006905	TCA	2	6	174814	174819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178721
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3245	NC_006905	AAC	2	6	180396	180401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178726
3246	NC_006905	GGT	2	6	180407	180412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178726
3247	NC_006905	CTG	2	6	180461	180466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178726
3248	NC_006905	GGA	2	6	180471	180476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178726
3249	NC_006905	CGG	2	6	180491	180496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178726
3250	NC_006905	ACC	2	6	180555	180560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178726
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3253	NC_006905	GTC	2	6	180630	180635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178726
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3257	NC_006905	TGGC	2	8	180870	180877	0 %	25 %	50 %	25 %	62178726
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3266	NC_006905	GCT	2	6	181812	181817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178727
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3271	NC_006905	CTG	2	6	181974	181979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178727
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3274	NC_006905	CCG	2	6	182085	182090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178727
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3279	NC_006905	A	6	6	182289	182294	100 %	0 %	0 %	0 %	62178727
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3354	NC_006905	GGT	2	6	185778	185783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162139622
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3356	NC_006905	TGGA	2	8	185908	185915	25 %	25 %	50 %	0 %	162139622
3357	NC_006905	GAA	2	6	185920	185925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162139622
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3361	NC_006905	GGA	2	6	186021	186026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162139622
3362	NC_006905	GTC	2	6	186037	186042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162139622
3363	NC_006905	A	6	6	186319	186324	100 %	0 %	0 %	0 %	62178731
3364	NC_006905	CGG	2	6	186342	186347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178731
3365	NC_006905	ATG	2	6	186349	186354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178731
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3491	NC_006905	GAT	2	6	192992	192997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178738
3492	NC_006905	CGC	2	6	193043	193048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178738
3493	NC_006905	CTG	2	6	193052	193057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178738
3494	NC_006905	CGA	2	6	193175	193180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178738
3495	NC_006905	CCG	2	6	193213	193218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178738
3496	NC_006905	GATT	2	8	193226	193233	25 %	50 %	25 %	0 %	62178738
3497	NC_006905	CCG	3	9	193252	193260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178738
3498	NC_006905	GCT	2	6	193280	193285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178738
3499	NC_006905	CTAT	2	8	193297	193304	25 %	50 %	0 %	25 %	62178738
3500	NC_006905	GCA	2	6	193307	193312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178738

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