MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_006905	GGC	2	6	86766	86771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178644
1503	NC_006905	ATG	2	6	86892	86897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178644
1504	NC_006905	GCC	2	6	86936	86941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178644
1505	NC_006905	CTAT	2	8	87040	87047	25 %	50 %	0 %	25 %	62178644
1506	NC_006905	TCG	2	6	87064	87069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178644
1507	NC_006905	T	6	6	87129	87134	0 %	100 %	0 %	0 %	62178644
1508	NC_006905	ATG	2	6	87210	87215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178644
1509	NC_006905	GCT	2	6	87230	87235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178644
1510	NC_006905	CAT	2	6	87257	87262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178644
1511	NC_006905	GTG	2	6	87270	87275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178644
1512	NC_006905	CTT	2	6	87293	87298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178644
1513	NC_006905	CGG	2	6	87302	87307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178644
1514	NC_006905	TCA	2	6	87379	87384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178644
1515	NC_006905	TTA	2	6	87436	87441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178644
1516	NC_006905	TAA	2	6	87455	87460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178644
1517	NC_006905	GCA	2	6	87721	87726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178645
1518	NC_006905	CGC	2	6	87849	87854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178645
1519	NC_006905	GAGC	2	8	87900	87907	25 %	0 %	50 %	25 %	62178645
1520	NC_006905	TAAT	2	8	87912	87919	50 %	50 %	0 %	0 %	62178645
1521	NC_006905	GCC	2	6	88242	88247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178646
1522	NC_006905	CGC	2	6	88336	88341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178646
1523	NC_006905	TG	3	6	88365	88370	0 %	50 %	50 %	0 %	62178646
1524	NC_006905	TGG	2	6	88487	88492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178646
1525	NC_006905	CAGG	2	8	88598	88605	25 %	0 %	50 %	25 %	62178646
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1527	NC_006905	ATA	2	6	88909	88914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178647
1528	NC_006905	ATA	2	6	88917	88922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178647
1529	NC_006905	TGAA	2	8	89081	89088	50 %	25 %	25 %	0 %	62178647
1530	NC_006905	GCG	2	6	89107	89112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178647
1531	NC_006905	AAT	2	6	89115	89120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178647
1532	NC_006905	T	6	6	89124	89129	0 %	100 %	0 %	0 %	62178647
1533	NC_006905	ACTC	2	8	89354	89361	25 %	25 %	0 %	50 %	62178648
1534	NC_006905	GCC	2	6	89366	89371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178648
1535	NC_006905	ATT	2	6	89386	89391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178648
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1537	NC_006905	TGT	3	9	89474	89482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178648
1538	NC_006905	AAT	2	6	89491	89496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178648
1539	NC_006905	ATA	2	6	89533	89538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178648
1540	NC_006905	TAA	2	6	90035	90040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178649
1541	NC_006905	A	8	8	90039	90046	100 %	0 %	0 %	0 %	62178649
1542	NC_006905	AGA	2	6	90056	90061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178649
1543	NC_006905	GCC	2	6	90108	90113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178649
1544	NC_006905	TGA	2	6	90143	90148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178649
1545	NC_006905	ATA	2	6	90226	90231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178649
1546	NC_006905	GACC	2	8	90245	90252	25 %	0 %	25 %	50 %	62178649
1547	NC_006905	T	7	7	90260	90266	0 %	100 %	0 %	0 %	62178649
1548	NC_006905	TTTCC	2	10	90273	90282	0 %	60 %	0 %	40 %	62178649
1549	NC_006905	AG	3	6	90294	90299	50 %	0 %	50 %	0 %	62178649
1550	NC_006905	ATC	2	6	90331	90336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178649
1551	NC_006905	ATG	2	6	90477	90482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178649
1552	NC_006905	GGC	2	6	90675	90680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178649
1553	NC_006905	ACC	2	6	90696	90701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178649
1554	NC_006905	GTGGC	2	10	90842	90851	0 %	20 %	60 %	20 %	62178649
1555	NC_006905	GAT	2	6	90864	90869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178649
1556	NC_006905	GCC	2	6	90890	90895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178649
1557	NC_006905	ATCA	2	8	90952	90959	50 %	25 %	0 %	25 %	62178649
1558	NC_006905	CCG	2	6	90978	90983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178649
1559	NC_006905	GC	4	8	91005	91012	0 %	0 %	50 %	50 %	62178649
1560	NC_006905	TGA	2	6	91034	91039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178649
1561	NC_006905	TCG	2	6	91043	91048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178649
1562	NC_006905	ACT	2	6	91066	91071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178649
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1564	NC_006905	GAT	2	6	91250	91255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178649
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1568	NC_006905	A	6	6	91534	91539	100 %	0 %	0 %	0 %	62178649
1569	NC_006905	GAT	2	6	91607	91612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178649
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1572	NC_006905	TGC	2	6	91751	91756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178649
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1574	NC_006905	ATT	2	6	92482	92487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178650
1575	NC_006905	CAT	2	6	92506	92511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178650
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1579	NC_006905	CG	4	8	92633	92640	0 %	0 %	50 %	50 %	62178650
1580	NC_006905	GCA	2	6	92655	92660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178650
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1582	NC_006905	ATGG	2	8	92700	92707	25 %	25 %	50 %	0 %	62178650
1583	NC_006905	CTG	2	6	92770	92775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178650
1584	NC_006905	CGG	2	6	92790	92795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178650
1585	NC_006905	GCC	2	6	92892	92897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178650
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1589	NC_006905	TGGCA	2	10	92975	92984	20 %	20 %	40 %	20 %	62178650
1590	NC_006905	ATCT	2	8	93026	93033	25 %	50 %	0 %	25 %	62178651
1591	NC_006905	CGG	2	6	93039	93044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178651
1592	NC_006905	GACG	2	8	93142	93149	25 %	0 %	50 %	25 %	62178651
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1596	NC_006905	GGC	3	9	93257	93265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178651
1597	NC_006905	TGG	2	6	93276	93281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178651
1598	NC_006905	GCG	2	6	93285	93290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178651
1599	NC_006905	AATG	2	8	93394	93401	50 %	25 %	25 %	0 %	62178651
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1601	NC_006905	GAT	2	6	93487	93492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178651
1602	NC_006905	GCT	2	6	93496	93501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178651
1603	NC_006905	GCC	2	6	93503	93508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178651
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1605	NC_006905	CCA	2	6	93519	93524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178651
1606	NC_006905	TGG	2	6	93576	93581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178651
1607	NC_006905	GCGCT	2	10	93611	93620	0 %	20 %	40 %	40 %	62178651
1608	NC_006905	CG	3	6	93625	93630	0 %	0 %	50 %	50 %	62178651
1609	NC_006905	GGCG	2	8	93736	93743	0 %	0 %	75 %	25 %	62178651
1610	NC_006905	CTG	2	6	93746	93751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178651
1611	NC_006905	TGC	2	6	93807	93812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178651
1612	NC_006905	GATT	2	8	93844	93851	25 %	50 %	25 %	0 %	62178651
1613	NC_006905	TGG	2	6	93861	93866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178651
1614	NC_006905	CTG	2	6	93884	93889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178651
1615	NC_006905	TTG	2	6	93890	93895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178651
1616	NC_006905	TTA	2	6	93986	93991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178651
1617	NC_006905	AAGT	2	8	94000	94007	50 %	25 %	25 %	0 %	62178651
1618	NC_006905	GGCGC	2	10	94025	94034	0 %	0 %	60 %	40 %	62178651
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1622	NC_006905	CGA	2	6	94180	94185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178651
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1625	NC_006905	T	6	6	94329	94334	0 %	100 %	0 %	0 %	62178651
1626	NC_006905	GCGAC	2	10	94338	94347	20 %	0 %	40 %	40 %	62178651
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1628	NC_006905	GCCCGT	2	12	94478	94489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	62178651
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1754	NC_006905	TGA	2	6	102117	102122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178658
1755	NC_006905	GGC	2	6	102145	102150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178658
1756	NC_006905	TGA	2	6	102327	102332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178658
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1760	NC_006905	TGA	2	6	102682	102687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178659
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1789	NC_006905	GGGA	2	8	103893	103900	25 %	0 %	75 %	0 %	62178660
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