MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006905	CAT	2	6	61314	61319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178621
1002	NC_006905	CCG	2	6	61354	61359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178621
1003	NC_006905	GCC	2	6	61437	61442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178621
1004	NC_006905	GAT	2	6	61474	61479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178621
1005	NC_006905	GCG	2	6	61549	61554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178621
1006	NC_006905	ACG	2	6	61558	61563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178621
1007	NC_006905	GAT	2	6	61584	61589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178621
1008	NC_006905	GAA	2	6	61653	61658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178621
1009	NC_006905	GCA	2	6	61720	61725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178621
1010	NC_006905	AGT	2	6	61748	61753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178621
1011	NC_006905	T	7	7	61784	61790	0 %	100 %	0 %	0 %	62178621
1012	NC_006905	CAG	2	6	61806	61811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178621
1013	NC_006905	GGT	2	6	61818	61823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178621
1014	NC_006905	CCG	2	6	61841	61846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178621
1015	NC_006905	TCA	2	6	61876	61881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178621
1016	NC_006905	GAAG	2	8	61893	61900	50 %	0 %	50 %	0 %	62178621
1017	NC_006905	TTCACC	2	12	61914	61925	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	62178621
1018	NC_006905	T	6	6	61941	61946	0 %	100 %	0 %	0 %	62178621
1019	NC_006905	GAG	2	6	61959	61964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178621
1020	NC_006905	GGC	2	6	61965	61970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178621
1021	NC_006905	AAT	2	6	61974	61979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178621
1022	NC_006905	AATAGC	2	12	62004	62015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	62178621
1023	NC_006905	CAGA	2	8	62066	62073	50 %	0 %	25 %	25 %	62178621
1024	NC_006905	ACC	2	6	62094	62099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178621
1025	NC_006905	CAT	2	6	62124	62129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178621
1026	NC_006905	CAG	2	6	62223	62228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178621
1027	NC_006905	AGC	2	6	62239	62244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178621
1028	NC_006905	TTTC	2	8	62339	62346	0 %	75 %	0 %	25 %	62178621
1029	NC_006905	GCC	2	6	62406	62411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178621
1030	NC_006905	AT	3	6	62413	62418	50 %	50 %	0 %	0 %	62178621
1031	NC_006905	ACC	2	6	62487	62492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178621
1032	NC_006905	AGTC	2	8	62498	62505	25 %	25 %	25 %	25 %	62178621
1033	NC_006905	TAA	2	6	62532	62537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178621
1034	NC_006905	TAAT	2	8	62540	62547	50 %	50 %	0 %	0 %	62178621
1035	NC_006905	ATTT	2	8	62926	62933	25 %	75 %	0 %	0 %	62178622
1036	NC_006905	TCG	2	6	62949	62954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1037	NC_006905	GTCG	2	8	62958	62965	0 %	25 %	50 %	25 %	62178622
1038	NC_006905	GAT	2	6	63001	63006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178622
1039	NC_006905	CTG	2	6	63130	63135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1040	NC_006905	GCT	2	6	63141	63146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1041	NC_006905	GCT	2	6	63207	63212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1042	NC_006905	GCAG	2	8	63243	63250	25 %	0 %	50 %	25 %	62178622
1043	NC_006905	CAG	2	6	63276	63281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1044	NC_006905	GC	3	6	63292	63297	0 %	0 %	50 %	50 %	62178622
1045	NC_006905	TGG	2	6	63392	63397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178622
1046	NC_006905	AGA	2	6	63444	63449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178622
1047	NC_006905	T	7	7	63457	63463	0 %	100 %	0 %	0 %	62178622
1048	NC_006905	ACCG	2	8	63469	63476	25 %	0 %	25 %	50 %	62178622
1049	NC_006905	GAC	2	6	63598	63603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1050	NC_006905	GATC	2	8	63615	63622	25 %	25 %	25 %	25 %	62178622
1051	NC_006905	GTC	2	6	63772	63777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1052	NC_006905	GC	3	6	63866	63871	0 %	0 %	50 %	50 %	62178622
1053	NC_006905	CTG	2	6	63878	63883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178622
1054	NC_006905	GCC	2	6	63910	63915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178622
1055	NC_006905	AC	3	6	63918	63923	50 %	0 %	0 %	50 %	62178622
1056	NC_006905	GGCA	2	8	63989	63996	25 %	0 %	50 %	25 %	62178623
1057	NC_006905	TGA	2	6	64015	64020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178623
1058	NC_006905	TCCA	2	8	64031	64038	25 %	25 %	0 %	50 %	62178623
1059	NC_006905	AG	3	6	64064	64069	50 %	0 %	50 %	0 %	62178623
1060	NC_006905	AGC	2	6	64078	64083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178623
1061	NC_006905	GCG	2	6	64092	64097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178623
1062	NC_006905	GGT	2	6	64106	64111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178623
1063	NC_006905	CG	3	6	64143	64148	0 %	0 %	50 %	50 %	62178623
1064	NC_006905	GC	3	6	64171	64176	0 %	0 %	50 %	50 %	62178623
1065	NC_006905	GCAG	2	8	64202	64209	25 %	0 %	50 %	25 %	62178623
1066	NC_006905	GC	3	6	64217	64222	0 %	0 %	50 %	50 %	62178623
1067	NC_006905	TGT	2	6	64275	64280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178624
1068	NC_006905	AGA	2	6	64354	64359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178624
1069	NC_006905	TCA	2	6	64402	64407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178624
1070	NC_006905	GTG	2	6	64445	64450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178624
1071	NC_006905	CGT	2	6	64498	64503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178624
1072	NC_006905	GTG	2	6	64506	64511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178624
1073	NC_006905	GCTGGA	2	12	64558	64569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62178624
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1075	NC_006905	TGG	2	6	64695	64700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178624
1076	NC_006905	GGC	2	6	64711	64716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178624
1077	NC_006905	TGC	2	6	64788	64793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178624
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1079	NC_006905	CG	3	6	64800	64805	0 %	0 %	50 %	50 %	62178624
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1089	NC_006905	GTG	2	6	65090	65095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178624
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1097	NC_006905	CGTGC	2	10	65621	65630	0 %	20 %	40 %	40 %	62178625
1098	NC_006905	CGA	2	6	65633	65638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178625
1099	NC_006905	TG	3	6	65721	65726	0 %	50 %	50 %	0 %	62178625
1100	NC_006905	CTGA	2	8	65733	65740	25 %	25 %	25 %	25 %	62178625
1101	NC_006905	A	6	6	65830	65835	100 %	0 %	0 %	0 %	62178625
1102	NC_006905	GGC	2	6	65894	65899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178625
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1105	NC_006905	CAT	2	6	66147	66152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178625
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1108	NC_006905	GC	3	6	66232	66237	0 %	0 %	50 %	50 %	62178625
1109	NC_006905	TGA	2	6	66268	66273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178625
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1111	NC_006905	GCA	2	6	66324	66329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178625
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1113	NC_006905	ACCGC	2	10	66351	66360	20 %	0 %	20 %	60 %	62178625
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1252	NC_006905	GTC	2	6	74115	74120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178631
1253	NC_006905	CAT	2	6	74161	74166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178631
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1255	NC_006905	CGC	2	6	74183	74188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178631
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