MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_006905	GC	3	6	30764	30769	0 %	0 %	50 %	50 %	62178595
503	NC_006905	GGT	2	6	30787	30792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178595
504	NC_006905	CCG	2	6	30813	30818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178595
505	NC_006905	CGC	2	6	30847	30852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178595
506	NC_006905	TTCG	2	8	30897	30904	0 %	50 %	25 %	25 %	62178595
507	NC_006905	GCA	2	6	30949	30954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178595
508	NC_006905	ATCTG	2	10	30966	30975	20 %	40 %	20 %	20 %	62178595
509	NC_006905	TTACG	2	10	31021	31030	20 %	40 %	20 %	20 %	62178595
510	NC_006905	TTA	2	6	31037	31042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178595
511	NC_006905	GC	3	6	31054	31059	0 %	0 %	50 %	50 %	62178595
512	NC_006905	TAT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178596
513	NC_006905	TAT	2	6	31277	31282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178596
514	NC_006905	CGC	2	6	31351	31356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178596
515	NC_006905	CGG	2	6	31389	31394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178596
516	NC_006905	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	62178596
517	NC_006905	GGT	2	6	31432	31437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178596
518	NC_006905	CGC	2	6	31474	31479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178596
519	NC_006905	CAG	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178596
520	NC_006905	CAA	2	6	31514	31519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178596
521	NC_006905	AGC	2	6	31568	31573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178596
522	NC_006905	GCG	2	6	31604	31609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178596
523	NC_006905	GTG	2	6	31610	31615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178596
524	NC_006905	GTG	2	6	31639	31644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178596
525	NC_006905	TGG	2	6	31662	31667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178596
526	NC_006905	TCC	2	6	31727	31732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178596
527	NC_006905	GGC	2	6	31753	31758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178596
528	NC_006905	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	62178596
529	NC_006905	GCC	2	6	31910	31915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178596
530	NC_006905	AAG	2	6	31920	31925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178596
531	NC_006905	AGC	2	6	31931	31936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178596
532	NC_006905	ATG	2	6	31947	31952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178596
533	NC_006905	CTC	2	6	31955	31960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178596
534	NC_006905	GCA	2	6	31978	31983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178596
535	NC_006905	GTC	2	6	32012	32017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178596
536	NC_006905	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	62178597
537	NC_006905	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	62178597
538	NC_006905	GTT	2	6	32257	32262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178597
539	NC_006905	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	62178597
540	NC_006905	ATA	2	6	32309	32314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178597
541	NC_006905	TAT	2	6	32334	32339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178597
542	NC_006905	ATT	2	6	32393	32398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178597
543	NC_006905	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	62178598
544	NC_006905	A	7	7	32582	32588	100 %	0 %	0 %	0 %	62178598
545	NC_006905	TTA	2	6	32615	32620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178598
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547	NC_006905	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	62178598
548	NC_006905	TGT	2	6	32741	32746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178598
549	NC_006905	TCG	2	6	32752	32757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178598
550	NC_006905	CAG	2	6	32758	32763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178598
551	NC_006905	AAG	2	6	32767	32772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178598
552	NC_006905	TGC	2	6	32922	32927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178598
553	NC_006905	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	62178598
554	NC_006905	ATT	2	6	32971	32976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178598
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557	NC_006905	ATA	2	6	34024	34029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178600
558	NC_006905	GCC	2	6	34037	34042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178600
559	NC_006905	GTT	2	6	34065	34070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178600
560	NC_006905	GTC	2	6	34083	34088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178600
561	NC_006905	TGTCT	2	10	34253	34262	0 %	60 %	20 %	20 %	62178600
562	NC_006905	TGT	2	6	34318	34323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178600
563	NC_006905	TAT	2	6	34931	34936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178601
564	NC_006905	CTTA	2	8	34944	34951	25 %	50 %	0 %	25 %	62178601
565	NC_006905	CTG	2	6	35084	35089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178601
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568	NC_006905	AT	3	6	35236	35241	50 %	50 %	0 %	0 %	62178601
569	NC_006905	TTC	2	6	35323	35328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178601
570	NC_006905	AATC	2	8	35350	35357	50 %	25 %	0 %	25 %	62178601
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577	NC_006905	ACCG	2	8	37322	37329	25 %	0 %	25 %	50 %	62178602
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581	NC_006905	GTT	2	6	37433	37438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178602
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583	NC_006905	TGAT	2	8	37606	37613	25 %	50 %	25 %	0 %	62178602
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587	NC_006905	ACG	2	6	37687	37692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178602
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591	NC_006905	GGC	2	6	38057	38062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178602
592	NC_006905	C	6	6	38075	38080	0 %	0 %	0 %	100 %	62178602
593	NC_006905	AATG	2	8	38129	38136	50 %	25 %	25 %	0 %	62178602
594	NC_006905	CGC	2	6	38200	38205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178602
595	NC_006905	AAT	2	6	38217	38222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178602
596	NC_006905	GC	3	6	38224	38229	0 %	0 %	50 %	50 %	62178602
597	NC_006905	CAG	2	6	38235	38240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178602
598	NC_006905	TC	3	6	38395	38400	0 %	50 %	0 %	50 %	62178602
599	NC_006905	ATG	2	6	38412	38417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178602
600	NC_006905	CGG	2	6	38455	38460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178602
601	NC_006905	T	8	8	38473	38480	0 %	100 %	0 %	0 %	62178602
602	NC_006905	CTG	2	6	38527	38532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178603
603	NC_006905	CCTG	2	8	38708	38715	0 %	25 %	25 %	50 %	62178603
604	NC_006905	GCA	2	6	38718	38723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178603
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606	NC_006905	CAG	2	6	39034	39039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178603
607	NC_006905	AGA	2	6	39061	39066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178603
608	NC_006905	G	6	6	39078	39083	0 %	0 %	100 %	0 %	62178603
609	NC_006905	ATT	2	6	39099	39104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178603
610	NC_006905	TAT	2	6	39143	39148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178603
611	NC_006905	GAA	2	6	39149	39154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178603
612	NC_006905	GC	3	6	39209	39214	0 %	0 %	50 %	50 %	62178603
613	NC_006905	TA	3	6	39255	39260	50 %	50 %	0 %	0 %	62178603
614	NC_006905	TGCC	2	8	39294	39301	0 %	25 %	25 %	50 %	62178603
615	NC_006905	GACG	2	8	39331	39338	25 %	0 %	50 %	25 %	62178603
616	NC_006905	G	6	6	39388	39393	0 %	0 %	100 %	0 %	62178603
617	NC_006905	ATG	2	6	39398	39403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178603
618	NC_006905	ACG	2	6	39464	39469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178603
619	NC_006905	GCG	2	6	39507	39512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178603
620	NC_006905	GT	3	6	39566	39571	0 %	50 %	50 %	0 %	62178603
621	NC_006905	TAA	2	6	39583	39588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178603
622	NC_006905	A	7	7	39587	39593	100 %	0 %	0 %	0 %	62178603
623	NC_006905	ATTA	2	8	39638	39645	50 %	50 %	0 %	0 %	62178603
624	NC_006905	T	6	6	39661	39666	0 %	100 %	0 %	0 %	62178603
625	NC_006905	AATC	2	8	39734	39741	50 %	25 %	0 %	25 %	62178603
626	NC_006905	T	6	6	40463	40468	0 %	100 %	0 %	0 %	62178604
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628	NC_006905	CAT	2	6	40489	40494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178604
629	NC_006905	TCA	2	6	40497	40502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178604
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