MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83501	NC_006905	TA	3	6	4752055	4752060	50 %	50 %	0 %	0 %	62183011
83502	NC_006905	CTG	2	6	4752121	4752126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62183011
83503	NC_006905	ATA	2	6	4752340	4752345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62183011
83504	NC_006905	GGT	2	6	4752352	4752357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62183011
83505	NC_006905	A	6	6	4752367	4752372	100 %	0 %	0 %	0 %	62183011
83506	NC_006905	TCT	2	6	4752386	4752391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62183011
83507	NC_006905	GATT	2	8	4752518	4752525	25 %	50 %	25 %	0 %	62183011
83508	NC_006905	T	7	7	4752620	4752626	0 %	100 %	0 %	0 %	62183011
83509	NC_006905	CCG	2	6	4752653	4752658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62183011
83510	NC_006905	GAT	2	6	4753092	4753097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62183012
83511	NC_006905	TCA	2	6	4753134	4753139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62183012
83512	NC_006905	ATT	2	6	4753189	4753194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62183012
83513	NC_006905	AGC	2	6	4753300	4753305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62183012
83514	NC_006905	TGA	2	6	4753315	4753320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62183012
83515	NC_006905	AGC	2	6	4753347	4753352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62183012
83516	NC_006905	T	6	6	4753363	4753368	0 %	100 %	0 %	0 %	62183012
83517	NC_006905	CGC	2	6	4753652	4753657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62183013
83518	NC_006905	TGG	2	6	4753682	4753687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62183013
83519	NC_006905	GAT	2	6	4753689	4753694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62183013
83520	NC_006905	ACG	2	6	4753734	4753739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62183013
83521	NC_006905	TTC	2	6	4753792	4753797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62183013
83522	NC_006905	GC	3	6	4753807	4753812	0 %	0 %	50 %	50 %	62183013
83523	NC_006905	CG	3	6	4753851	4753856	0 %	0 %	50 %	50 %	62183013
83524	NC_006905	ACG	2	6	4753959	4753964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62183013
83525	NC_006905	CAG	2	6	4754001	4754006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62183013
83526	NC_006905	ATC	2	6	4754058	4754063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62183013
83527	NC_006905	AG	3	6	4754223	4754228	50 %	0 %	50 %	0 %	62183013
83528	NC_006905	CAT	2	6	4754267	4754272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62183013
83529	NC_006905	CAA	2	6	4754497	4754502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62183014
83530	NC_006905	CAT	2	6	4754503	4754508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62183014
83531	NC_006905	GCC	2	6	4755044	4755049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62183015
83532	NC_006905	ATT	2	6	4755149	4755154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62183015
83533	NC_006905	ATA	2	6	4755156	4755161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62183015
83534	NC_006905	CGA	2	6	4755216	4755221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62183015
83535	NC_006905	TAC	2	6	4755248	4755253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62183015
83536	NC_006905	TTA	2	6	4755278	4755283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62183015
83537	NC_006905	GCTGGC	2	12	4755358	4755369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	62183015
83538	NC_006905	GGC	2	6	4755394	4755399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62183015
83539	NC_006905	TGA	2	6	4755496	4755501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62183015
83540	NC_006905	CG	4	8	4755521	4755528	0 %	0 %	50 %	50 %	62183015
83541	NC_006905	GGC	2	6	4755556	4755561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62183015
83542	NC_006905	ACA	2	6	4755589	4755594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62183015
83543	NC_006905	CTG	2	6	4755605	4755610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62183015
83544	NC_006905	A	8	8	4755657	4755664	100 %	0 %	0 %	0 %	62183015

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.