MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006905	GCG	2	6	329679	329684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6002	NC_006905	CGG	2	6	329710	329715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6003	NC_006905	GCAG	2	8	329758	329765	25 %	0 %	50 %	25 %	62178854
6004	NC_006905	ACG	2	6	329800	329805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6005	NC_006905	GGC	2	6	329812	329817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6006	NC_006905	ACGA	2	8	329829	329836	50 %	0 %	25 %	25 %	62178854
6007	NC_006905	CGG	2	6	329900	329905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6008	NC_006905	GCC	2	6	329908	329913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178854
6009	NC_006905	CGG	2	6	329947	329952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6010	NC_006905	CGG	2	6	329960	329965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6011	NC_006905	GCG	2	6	330006	330011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6012	NC_006905	ACG	2	6	330061	330066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6013	NC_006905	CGG	2	6	330067	330072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6014	NC_006905	CTG	2	6	330078	330083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6015	NC_006905	CCG	2	6	330089	330094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178854
6016	NC_006905	GGC	2	6	330097	330102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6017	NC_006905	ATG	2	6	330103	330108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178854
6018	NC_006905	CGG	2	6	330109	330114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6019	NC_006905	CTG	2	6	330165	330170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6020	NC_006905	TGC	2	6	330193	330198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6021	NC_006905	TAC	2	6	330270	330275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178854
6022	NC_006905	TCA	2	6	330316	330321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178854
6023	NC_006905	CG	3	6	330331	330336	0 %	0 %	50 %	50 %	62178854
6024	NC_006905	ACC	2	6	330337	330342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178854
6025	NC_006905	GGC	2	6	330370	330375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6026	NC_006905	CGG	2	6	330384	330389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6027	NC_006905	GTG	2	6	330447	330452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178854
6028	NC_006905	GCT	2	6	330500	330505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6029	NC_006905	ATT	2	6	330538	330543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178854
6030	NC_006905	ACG	2	6	330607	330612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6031	NC_006905	CGG	2	6	330613	330618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6032	NC_006905	CTG	2	6	330624	330629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6033	NC_006905	GGC	2	6	330634	330639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6034	NC_006905	GA	3	6	330643	330648	50 %	0 %	50 %	0 %	62178854
6035	NC_006905	GCAG	2	8	330663	330670	25 %	0 %	50 %	25 %	62178854
6036	NC_006905	GTG	2	6	330672	330677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178854
6037	NC_006905	GGT	2	6	330737	330742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178854
6038	NC_006905	GCA	2	6	330767	330772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6039	NC_006905	ACG	2	6	330853	330858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6040	NC_006905	GGAA	2	8	330896	330903	50 %	0 %	50 %	0 %	62178854
6041	NC_006905	GAC	2	6	330917	330922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6042	NC_006905	GAA	2	6	330967	330972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178854
6043	NC_006905	GCA	2	6	330973	330978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6044	NC_006905	GCG	2	6	331035	331040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6045	NC_006905	GC	3	6	331087	331092	0 %	0 %	50 %	50 %	62178854
6046	NC_006905	GGA	2	6	331094	331099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178854
6047	NC_006905	GACG	2	8	331103	331110	25 %	0 %	50 %	25 %	62178854
6048	NC_006905	GCCCG	2	10	331176	331185	0 %	0 %	40 %	60 %	62178854
6049	NC_006905	CAG	2	6	331188	331193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6050	NC_006905	TATGCG	2	12	331326	331337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	62178854
6051	NC_006905	GATC	2	8	331355	331362	25 %	25 %	25 %	25 %	62178854
6052	NC_006905	GAT	2	6	331404	331409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178854
6053	NC_006905	AG	3	6	331461	331466	50 %	0 %	50 %	0 %	62178854
6054	NC_006905	CGG	2	6	331469	331474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178854
6055	NC_006905	CAG	2	6	331561	331566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178854
6056	NC_006905	ATT	2	6	331618	331623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178854
6057	NC_006905	TTC	2	6	331682	331687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178854
6058	NC_006905	AT	3	6	331693	331698	50 %	50 %	0 %	0 %	62178854
6059	NC_006905	TGA	2	6	331799	331804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178854
6060	NC_006905	TGA	2	6	331837	331842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178855
6061	NC_006905	A	6	6	331847	331852	100 %	0 %	0 %	0 %	62178855
6062	NC_006905	TTTA	2	8	331957	331964	25 %	75 %	0 %	0 %	62178855
6063	NC_006905	TAT	2	6	331976	331981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178855
6064	NC_006905	TGGA	2	8	332049	332056	25 %	25 %	50 %	0 %	62178855
6065	NC_006905	TGG	2	6	332066	332071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178855
6066	NC_006905	AAG	2	6	332116	332121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178855
6067	NC_006905	TA	3	6	332129	332134	50 %	50 %	0 %	0 %	62178855
6068	NC_006905	TGG	2	6	332135	332140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178855
6069	NC_006905	ACC	2	6	332234	332239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178856
6070	NC_006905	CTC	2	6	332275	332280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178856
6071	NC_006905	CGC	2	6	332331	332336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178856
6072	NC_006905	CTT	2	6	332355	332360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178856
6073	NC_006905	CCAG	2	8	332361	332368	25 %	0 %	25 %	50 %	62178856
6074	NC_006905	GGT	2	6	332407	332412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178856
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6078	NC_006905	AG	3	6	333984	333989	50 %	0 %	50 %	0 %	62178857
6079	NC_006905	AGA	2	6	334028	334033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178857
6080	NC_006905	T	6	6	334045	334050	0 %	100 %	0 %	0 %	62178857
6081	NC_006905	TAA	2	6	334058	334063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178857
6082	NC_006905	AT	3	6	334080	334085	50 %	50 %	0 %	0 %	62178857
6083	NC_006905	T	6	6	334130	334135	0 %	100 %	0 %	0 %	62178857
6084	NC_006905	TTATA	2	10	334227	334236	40 %	60 %	0 %	0 %	62178857
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6087	NC_006905	A	6	6	334297	334302	100 %	0 %	0 %	0 %	62178857
6088	NC_006905	GCAA	2	8	334310	334317	50 %	0 %	25 %	25 %	62178857
6089	NC_006905	GAT	2	6	334326	334331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178857
6090	NC_006905	AATTA	2	10	334352	334361	60 %	40 %	0 %	0 %	62178857
6091	NC_006905	AAT	2	6	334615	334620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178858
6092	NC_006905	TGCT	2	8	334671	334678	0 %	50 %	25 %	25 %	62178858
6093	NC_006905	TAC	2	6	334726	334731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178858
6094	NC_006905	ATTA	2	8	334768	334775	50 %	50 %	0 %	0 %	62178858
6095	NC_006905	TGA	2	6	334807	334812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178858
6096	NC_006905	CTGTTG	2	12	334815	334826	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	62178858
6097	NC_006905	TGA	2	6	334840	334845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178858
6098	NC_006905	GGTT	2	8	334873	334880	0 %	50 %	50 %	0 %	62178858
6099	NC_006905	TTA	2	6	334899	334904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178858
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6101	NC_006905	TAT	2	6	335025	335030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178859
6102	NC_006905	T	7	7	335111	335117	0 %	100 %	0 %	0 %	62178859
6103	NC_006905	TTA	2	6	335139	335144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178859
6104	NC_006905	TGC	2	6	335193	335198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178859
6105	NC_006905	TAA	2	6	335251	335256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178859
6106	NC_006905	TC	3	6	335300	335305	0 %	50 %	0 %	50 %	62178859
6107	NC_006905	CCA	2	6	335503	335508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178860
6108	NC_006905	CGG	2	6	335531	335536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178860
6109	NC_006905	AAC	2	6	335613	335618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62178860
6110	NC_006905	TGC	2	6	335821	335826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178861
6111	NC_006905	GAA	2	6	335921	335926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178861
6112	NC_006905	GGA	2	6	336083	336088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178861
6113	NC_006905	GGT	2	6	336850	336855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178862
6114	NC_006905	A	7	7	336874	336880	100 %	0 %	0 %	0 %	62178862
6115	NC_006905	ATG	2	6	336905	336910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178862
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6119	NC_006905	TCCTC	2	10	336980	336989	0 %	40 %	0 %	60 %	62178862
6120	NC_006905	CTA	2	6	337080	337085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178862
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6122	NC_006905	AGA	2	6	337211	337216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178862
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6497	NC_006905	CACG	2	8	366683	366690	25 %	0 %	25 %	50 %	62178888
6498	NC_006905	GCC	2	6	366702	366707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178888
6499	NC_006905	ATT	2	6	366734	366739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178888
6500	NC_006905	GGC	2	6	366752	366757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178888

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