MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006905	GGCAG	2	10	303156	303165	20 %	0 %	60 %	20 %	62178833
5502	NC_006905	GCG	2	6	303289	303294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5503	NC_006905	GCG	2	6	303310	303315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5504	NC_006905	ACG	2	6	303322	303327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
5505	NC_006905	ATT	2	6	303361	303366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178833
5506	NC_006905	ATC	2	6	303392	303397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178833
5507	NC_006905	CCA	3	9	303474	303482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178833
5508	NC_006905	GTG	3	9	303521	303529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178833
5509	NC_006905	CGTC	2	8	303579	303586	0 %	25 %	25 %	50 %	62178833
5510	NC_006905	TGA	2	6	303587	303592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178833
5511	NC_006905	CGG	2	6	303604	303609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5512	NC_006905	GAA	2	6	303688	303693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178833
5513	NC_006905	GCA	2	6	303726	303731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
5514	NC_006905	GCA	2	6	303765	303770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
5515	NC_006905	CCCTG	2	10	303773	303782	0 %	20 %	20 %	60 %	62178833
5516	NC_006905	GCA	2	6	303882	303887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
5517	NC_006905	TTC	2	6	303913	303918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178833
5518	NC_006905	GGC	2	6	304025	304030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5519	NC_006905	GGGC	2	8	304044	304051	0 %	0 %	75 %	25 %	62178833
5520	NC_006905	CGG	2	6	304057	304062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5521	NC_006905	CGG	2	6	304065	304070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5522	NC_006905	CCT	2	6	304080	304085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178833
5523	NC_006905	GCT	2	6	304117	304122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178833
5524	NC_006905	AACG	2	8	304165	304172	50 %	0 %	25 %	25 %	62178833
5525	NC_006905	CG	3	6	304179	304184	0 %	0 %	50 %	50 %	62178833
5526	NC_006905	GAC	2	6	304279	304284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178833
5527	NC_006905	TG	3	6	304298	304303	0 %	50 %	50 %	0 %	62178833
5528	NC_006905	GGC	2	6	304420	304425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5529	NC_006905	GC	3	6	304566	304571	0 %	0 %	50 %	50 %	62178834
5530	NC_006905	GGC	2	6	304690	304695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178834
5531	NC_006905	GC	3	6	304724	304729	0 %	0 %	50 %	50 %	62178834
5532	NC_006905	CATA	2	8	304764	304771	50 %	25 %	0 %	25 %	62178834
5533	NC_006905	GCG	2	6	304785	304790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178834
5534	NC_006905	CGC	3	9	304813	304821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178834
5535	NC_006905	GA	3	6	304880	304885	50 %	0 %	50 %	0 %	62178834
5536	NC_006905	CGA	2	6	304889	304894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178834
5537	NC_006905	CA	3	6	304962	304967	50 %	0 %	0 %	50 %	62178834
5538	NC_006905	GCA	2	6	304986	304991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178834
5539	NC_006905	CAG	2	6	305070	305075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178835
5540	NC_006905	GGT	2	6	305127	305132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178835
5541	NC_006905	CAG	2	6	305271	305276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178835
5542	NC_006905	GCG	2	6	305297	305302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178835
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5544	NC_006905	CGC	2	6	305345	305350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178835
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5546	NC_006905	GCC	2	6	305412	305417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178835
5547	NC_006905	GCCC	2	8	305426	305433	0 %	0 %	25 %	75 %	62178835
5548	NC_006905	GCC	2	6	305506	305511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178835
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5550	NC_006905	GTT	2	6	305558	305563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178835
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5552	NC_006905	CA	4	8	305697	305704	50 %	0 %	0 %	50 %	62178835
5553	NC_006905	GGC	2	6	305723	305728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178835
5554	NC_006905	CTG	2	6	305757	305762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178835
5555	NC_006905	T	7	7	305837	305843	0 %	100 %	0 %	0 %	62178836
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5557	NC_006905	CGG	2	6	305918	305923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178836
5558	NC_006905	GCCA	2	8	306011	306018	25 %	0 %	25 %	50 %	62178836
5559	NC_006905	GC	3	6	306075	306080	0 %	0 %	50 %	50 %	62178836
5560	NC_006905	CCA	2	6	306084	306089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178836
5561	NC_006905	GTGTCG	2	12	306101	306112	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	62178836
5562	NC_006905	ACG	2	6	306129	306134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178836
5563	NC_006905	CTG	2	6	306217	306222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178836
5564	NC_006905	AAT	2	6	306298	306303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178836
5565	NC_006905	TGT	3	9	306329	306337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178836
5566	NC_006905	GAAAC	2	10	306396	306405	60 %	0 %	20 %	20 %	62178836
5567	NC_006905	CGGGA	2	10	306408	306417	20 %	0 %	60 %	20 %	62178836
5568	NC_006905	TCA	2	6	306419	306424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178836
5569	NC_006905	CAT	2	6	306474	306479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178836
5570	NC_006905	TGA	2	6	306494	306499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178836
5571	NC_006905	GCACA	2	10	306524	306533	40 %	0 %	20 %	40 %	62178836
5572	NC_006905	TCA	2	6	306536	306541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178836
5573	NC_006905	CCA	2	6	306556	306561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178836
5574	NC_006905	GCG	2	6	306635	306640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178836
5575	NC_006905	ATGT	2	8	306653	306660	25 %	50 %	25 %	0 %	62178836
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5578	NC_006905	CG	3	6	309873	309878	0 %	0 %	50 %	50 %	62178838
5579	NC_006905	CG	3	6	309883	309888	0 %	0 %	50 %	50 %	62178838
5580	NC_006905	CG	3	6	309890	309895	0 %	0 %	50 %	50 %	62178838
5581	NC_006905	A	7	7	309934	309940	100 %	0 %	0 %	0 %	62178838
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5585	NC_006905	CG	3	6	310076	310081	0 %	0 %	50 %	50 %	62178838
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5588	NC_006905	GACCC	2	10	310294	310303	20 %	0 %	20 %	60 %	62178838
5589	NC_006905	GT	3	6	310352	310357	0 %	50 %	50 %	0 %	62178838
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5592	NC_006905	TCC	2	6	310695	310700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178839
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5594	NC_006905	CGA	2	6	310739	310744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178839
5595	NC_006905	GCG	2	6	310787	310792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178839
5596	NC_006905	TAC	2	6	310908	310913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178839
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5599	NC_006905	GAA	2	6	311208	311213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178839
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5601	NC_006905	GGC	2	6	311385	311390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178839
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5603	NC_006905	CCG	2	6	311429	311434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178839
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5605	NC_006905	TAC	2	6	311538	311543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178839
5606	NC_006905	GCCAAC	2	12	311559	311570	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	62178839
5607	NC_006905	AATG	2	8	311688	311695	50 %	25 %	25 %	0 %	62178839
5608	NC_006905	CTC	2	6	311729	311734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62178839
5609	NC_006905	CGT	2	6	311751	311756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178839
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5614	NC_006905	AT	3	6	311978	311983	50 %	50 %	0 %	0 %	62178840
5615	NC_006905	AT	3	6	311987	311992	50 %	50 %	0 %	0 %	62178840
5616	NC_006905	GT	3	6	312044	312049	0 %	50 %	50 %	0 %	62178840
5617	NC_006905	TTATG	2	10	312236	312245	20 %	60 %	20 %	0 %	62178840
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5622	NC_006905	AT	3	6	312542	312547	50 %	50 %	0 %	0 %	62178841
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5997	NC_006905	CG	3	6	329456	329461	0 %	0 %	50 %	50 %	62178854
5998	NC_006905	ATG	2	6	329548	329553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178854
5999	NC_006905	ACGC	2	8	329555	329562	25 %	0 %	25 %	50 %	62178854
6000	NC_006905	GACG	2	8	329576	329583	25 %	0 %	50 %	25 %	62178854

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