MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 83544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006905	TCG	2	6	269420	269425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178802
5002	NC_006905	GGC	2	6	269643	269648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178802
5003	NC_006905	CGG	2	6	269651	269656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178802
5004	NC_006905	TGC	2	6	269692	269697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178802
5005	NC_006905	GCT	2	6	269775	269780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178802
5006	NC_006905	CAT	2	6	269792	269797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178802
5007	NC_006905	CGC	2	6	269800	269805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178802
5008	NC_006905	CAT	2	6	269834	269839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178802
5009	NC_006905	GCG	2	6	269854	269859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178802
5010	NC_006905	GGC	2	6	269882	269887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178802
5011	NC_006905	GCT	2	6	269903	269908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178802
5012	NC_006905	GAT	2	6	269943	269948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178802
5013	NC_006905	A	6	6	269951	269956	100 %	0 %	0 %	0 %	62178802
5014	NC_006905	CGT	2	6	269958	269963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178802
5015	NC_006905	TGA	2	6	269974	269979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178802
5016	NC_006905	A	6	6	270187	270192	100 %	0 %	0 %	0 %	62178803
5017	NC_006905	GCCGC	2	10	270249	270258	0 %	0 %	40 %	60 %	62178803
5018	NC_006905	AGT	2	6	270267	270272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178803
5019	NC_006905	GGC	2	6	270302	270307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178803
5020	NC_006905	GC	3	6	270404	270409	0 %	0 %	50 %	50 %	62178803
5021	NC_006905	GC	4	8	270482	270489	0 %	0 %	50 %	50 %	62178803
5022	NC_006905	TACT	2	8	270497	270504	25 %	50 %	0 %	25 %	62178803
5023	NC_006905	CGG	2	6	270535	270540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178803
5024	NC_006905	CTA	2	6	270598	270603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178803
5025	NC_006905	GGC	2	6	270717	270722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178803
5026	NC_006905	CTG	2	6	270888	270893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178803
5027	NC_006905	TGG	2	6	270907	270912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62178803
5028	NC_006905	TCT	3	9	270943	270951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178803
5029	NC_006905	GCC	2	6	270965	270970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178803
5030	NC_006905	ATC	2	6	271068	271073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178803
5031	NC_006905	GGC	2	6	271077	271082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178803
5032	NC_006905	GCG	3	9	271090	271098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178803
5033	NC_006905	CTA	2	6	271133	271138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178803
5034	NC_006905	GTGCCG	2	12	271164	271175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	62178803
5035	NC_006905	GGC	2	6	271221	271226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178803
5036	NC_006905	ATT	2	6	271372	271377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62178803
5037	NC_006905	GTC	2	6	271389	271394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178803
5038	NC_006905	GAT	2	6	271395	271400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178803
5039	NC_006905	CG	3	6	271469	271474	0 %	0 %	50 %	50 %	62178803
5040	NC_006905	GCCGG	2	10	271479	271488	0 %	0 %	60 %	40 %	62178803
5041	NC_006905	CGAC	2	8	271537	271544	25 %	0 %	25 %	50 %	62178803
5042	NC_006905	ACC	2	6	271761	271766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62178803
5043	NC_006905	CCTG	2	8	271773	271780	0 %	25 %	25 %	50 %	62178803
5044	NC_006905	AGC	3	9	271782	271790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178803
5045	NC_006905	GCCT	2	8	271880	271887	0 %	25 %	25 %	50 %	62178803
5046	NC_006905	TAA	2	6	271938	271943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178803
5047	NC_006905	CAT	2	6	272021	272026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178804
5048	NC_006905	TTG	2	6	272139	272144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62178804
5049	NC_006905	GCG	2	6	272173	272178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178804
5050	NC_006905	CT	3	6	272248	272253	0 %	50 %	0 %	50 %	62178804
5051	NC_006905	T	6	6	272319	272324	0 %	100 %	0 %	0 %	62178804
5052	NC_006905	GCTG	2	8	272339	272346	0 %	25 %	50 %	25 %	62178804
5053	NC_006905	TCA	2	6	272366	272371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178804
5054	NC_006905	ATA	2	6	272392	272397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62178804
5055	NC_006905	CGC	2	6	272401	272406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178804
5056	NC_006905	AAG	2	6	272437	272442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62178804
5057	NC_006905	CTGT	2	8	272507	272514	0 %	50 %	25 %	25 %	62178804
5058	NC_006905	T	6	6	272523	272528	0 %	100 %	0 %	0 %	62178804
5059	NC_006905	GGC	2	6	272529	272534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178804
5060	NC_006905	GTAT	2	8	272698	272705	25 %	50 %	25 %	0 %	62178804
5061	NC_006905	TGA	3	9	272770	272778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178804
5062	NC_006905	CT	3	6	272791	272796	0 %	50 %	0 %	50 %	62178804
5063	NC_006905	CGG	2	6	272831	272836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178804
5064	NC_006905	CTG	2	6	272946	272951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178804
5065	NC_006905	GCG	2	6	273064	273069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178804
5066	NC_006905	GGC	2	6	273122	273127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178804
5067	NC_006905	ATG	2	6	273195	273200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178804
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5069	NC_006905	TGC	2	6	273259	273264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62178804
5070	NC_006905	GATT	2	8	273283	273290	25 %	50 %	25 %	0 %	62178804
5071	NC_006905	TGA	2	6	273392	273397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178804
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5073	NC_006905	GATG	2	8	273506	273513	25 %	25 %	50 %	0 %	62178804
5074	NC_006905	CGC	2	6	273545	273550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178804
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5081	NC_006905	GAT	2	6	273860	273865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62178804
5082	NC_006905	AGGTG	2	10	273902	273911	20 %	20 %	60 %	0 %	62178804
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5090	NC_006905	GC	3	6	274953	274958	0 %	0 %	50 %	50 %	62178806
5091	NC_006905	GCA	2	6	275009	275014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178806
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5093	NC_006905	CCGG	2	8	275067	275074	0 %	0 %	50 %	50 %	62178806
5094	NC_006905	CTT	2	6	275118	275123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62178806
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5096	NC_006905	T	6	6	275231	275236	0 %	100 %	0 %	0 %	62178806
5097	NC_006905	GC	4	8	275243	275250	0 %	0 %	50 %	50 %	62178806
5098	NC_006905	CAG	2	6	275262	275267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178806
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5103	NC_006905	CGG	2	6	275424	275429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178806
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5105	NC_006905	GCTG	2	8	275446	275453	0 %	25 %	50 %	25 %	62178806
5106	NC_006905	AGG	2	6	275506	275511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62178806
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5108	NC_006905	CGA	2	6	275525	275530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178806
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5111	NC_006905	ACG	2	6	275622	275627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178806
5112	NC_006905	CGC	2	6	275650	275655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178806
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5123	NC_006905	TCAT	2	8	276288	276295	25 %	50 %	0 %	25 %	62178807
5124	NC_006905	GCA	2	6	276325	276330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62178808
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5246	NC_006905	AGC	2	6	283193	283198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162139613
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5367	NC_006905	CGATT	2	10	295661	295670	20 %	40 %	20 %	20 %	62178825
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5402	NC_006905	ATCGCC	2	12	297748	297759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	62178827
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5494	NC_006905	CAGC	2	8	303051	303058	25 %	0 %	25 %	50 %	62178833
5495	NC_006905	GGC	2	6	303059	303064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5496	NC_006905	GCG	2	6	303066	303071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5497	NC_006905	GCG	2	6	303075	303080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62178833
5498	NC_006905	CGCC	2	8	303096	303103	0 %	0 %	25 %	75 %	62178833
5499	NC_006905	CGC	2	6	303112	303117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62178833
5500	NC_006905	ATC	2	6	303130	303135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62178833

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