MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 5928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006576	CTGG	2	8	2840	2847	0 %	25 %	50 %	25 %	56750014
2	NC_006576	TCAA	2	8	3276	3283	50 %	25 %	0 %	25 %	56750014
3	NC_006576	TCCT	2	8	3313	3320	0 %	50 %	0 %	50 %	56750014
4	NC_006576	TCAG	2	8	3636	3643	25 %	25 %	25 %	25 %	56750014
5	NC_006576	TAAA	2	8	5913	5920	75 %	25 %	0 %	0 %	56750015
6	NC_006576	AATA	2	8	6240	6247	75 %	25 %	0 %	0 %	56750015
7	NC_006576	GCAG	2	8	6445	6452	25 %	0 %	50 %	25 %	56750015
8	NC_006576	CCTT	2	8	6487	6494	0 %	50 %	0 %	50 %	56750015
9	NC_006576	TGCC	2	8	9190	9197	0 %	25 %	25 %	50 %	56750018
10	NC_006576	ATCA	2	8	9370	9377	50 %	25 %	0 %	25 %	56750018
11	NC_006576	AAGA	2	8	9650	9657	75 %	0 %	25 %	0 %	56750018
12	NC_006576	CAGC	2	8	9715	9722	25 %	0 %	25 %	50 %	56750018
13	NC_006576	CAGC	2	8	10352	10359	25 %	0 %	25 %	50 %	56750019
14	NC_006576	CGGA	2	8	11048	11055	25 %	0 %	50 %	25 %	56750019
15	NC_006576	ACCA	2	8	11198	11205	50 %	0 %	0 %	50 %	56750019
16	NC_006576	TCAT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	56750020
17	NC_006576	CCGA	2	8	11463	11470	25 %	0 %	25 %	50 %	56750020
18	NC_006576	AGGA	2	8	11767	11774	50 %	0 %	50 %	0 %	56750020
19	NC_006576	GGCT	2	8	12192	12199	0 %	25 %	50 %	25 %	56750020
20	NC_006576	CGAT	2	8	12267	12274	25 %	25 %	25 %	25 %	56750021
21	NC_006576	CAGC	2	8	12541	12548	25 %	0 %	25 %	50 %	56750021
22	NC_006576	GCTT	2	8	14110	14117	0 %	50 %	25 %	25 %	56750023
23	NC_006576	CCGA	2	8	15280	15287	25 %	0 %	25 %	50 %	56750024
24	NC_006576	GCAA	2	8	16461	16468	50 %	0 %	25 %	25 %	56750025
25	NC_006576	TGCC	2	8	16984	16991	0 %	25 %	25 %	50 %	56750025
26	NC_006576	CAAC	2	8	17053	17060	50 %	0 %	0 %	50 %	56750025
27	NC_006576	GTCC	2	8	17820	17827	0 %	25 %	25 %	50 %	56750026
28	NC_006576	ATCA	2	8	19184	19191	50 %	25 %	0 %	25 %	56750028
29	NC_006576	GTCT	2	8	20106	20113	0 %	50 %	25 %	25 %	56750029
30	NC_006576	TTGG	2	8	20238	20245	0 %	50 %	50 %	0 %	56750029
31	NC_006576	AGTG	2	8	20348	20355	25 %	25 %	50 %	0 %	56750029
32	NC_006576	CTGT	2	8	23933	23940	0 %	50 %	25 %	25 %	56750032
33	NC_006576	CACT	2	8	24248	24255	25 %	25 %	0 %	50 %	56750032
34	NC_006576	GCTG	2	8	24524	24531	0 %	25 %	50 %	25 %	56750033
35	NC_006576	GCCT	2	8	24736	24743	0 %	25 %	25 %	50 %	56750033
36	NC_006576	CATC	2	8	24813	24820	25 %	25 %	0 %	50 %	56750033
37	NC_006576	AGGC	2	8	25301	25308	25 %	0 %	50 %	25 %	56750033
38	NC_006576	GCTC	2	8	25740	25747	0 %	25 %	25 %	50 %	56750033
39	NC_006576	GATC	2	8	26103	26110	25 %	25 %	25 %	25 %	56750033
40	NC_006576	GATT	2	8	26226	26233	25 %	50 %	25 %	0 %	56750033
41	NC_006576	ATCG	2	8	27423	27430	25 %	25 %	25 %	25 %	56750034
42	NC_006576	CCAT	2	8	27529	27536	25 %	25 %	0 %	50 %	56750034
43	NC_006576	AGGC	2	8	27631	27638	25 %	0 %	50 %	25 %	56750035
44	NC_006576	TGGG	2	8	27699	27706	0 %	25 %	75 %	0 %	56750035
45	NC_006576	CCAT	2	8	28081	28088	25 %	25 %	0 %	50 %	56750035
46	NC_006576	CAAC	2	8	28268	28275	50 %	0 %	0 %	50 %	56750036
47	NC_006576	TTGC	2	8	28747	28754	0 %	50 %	25 %	25 %	56750036
48	NC_006576	TCAT	2	8	31810	31817	25 %	50 %	0 %	25 %	56750037
49	NC_006576	ATCA	2	8	32314	32321	50 %	25 %	0 %	25 %	56750038
50	NC_006576	CAGT	2	8	32771	32778	25 %	25 %	25 %	25 %	56750038
51	NC_006576	CCTG	2	8	33504	33511	0 %	25 %	25 %	50 %	56750038
52	NC_006576	CTTT	2	8	34348	34355	0 %	75 %	0 %	25 %	56750039
53	NC_006576	TGAG	2	8	34937	34944	25 %	25 %	50 %	0 %	56750040
54	NC_006576	TGCC	2	8	35501	35508	0 %	25 %	25 %	50 %	56750040
55	NC_006576	CGCA	2	8	37309	37316	25 %	0 %	25 %	50 %	56750040
56	NC_006576	GATC	2	8	37362	37369	25 %	25 %	25 %	25 %	56750040
57	NC_006576	CTGG	2	8	37448	37455	0 %	25 %	50 %	25 %	56750040
58	NC_006576	TGGA	2	8	37909	37916	25 %	25 %	50 %	0 %	56750041
59	NC_006576	GGCG	2	8	38028	38035	0 %	0 %	75 %	25 %	56750041
60	NC_006576	GGGT	2	8	38216	38223	0 %	25 %	75 %	0 %	56750041
61	NC_006576	AGCC	2	8	38280	38287	25 %	0 %	25 %	50 %	56750041
62	NC_006576	GGCA	2	8	38354	38361	25 %	0 %	50 %	25 %	56750041
63	NC_006576	TGGC	2	8	38775	38782	0 %	25 %	50 %	25 %	56750041
64	NC_006576	TGGA	2	8	38866	38873	25 %	25 %	50 %	0 %	56750041
65	NC_006576	GGCT	2	8	39961	39968	0 %	25 %	50 %	25 %	56750042
66	NC_006576	GGCT	2	8	40394	40401	0 %	25 %	50 %	25 %	56750042
67	NC_006576	CAAC	2	8	40544	40551	50 %	0 %	0 %	50 %	56750042
68	NC_006576	CGGG	2	8	40667	40674	0 %	0 %	75 %	25 %	56750042
69	NC_006576	CGAT	2	8	41015	41022	25 %	25 %	25 %	25 %	56750042
70	NC_006576	CAAC	2	8	41899	41906	50 %	0 %	0 %	50 %	56750043
71	NC_006576	CTGA	2	8	42424	42431	25 %	25 %	25 %	25 %	56750043
72	NC_006576	CAAA	2	8	43206	43213	75 %	0 %	0 %	25 %	56750044
73	NC_006576	TCGA	2	8	43439	43446	25 %	25 %	25 %	25 %	56750044
74	NC_006576	ACGC	2	8	43762	43769	25 %	0 %	25 %	50 %	56750044
75	NC_006576	CCCA	2	8	44398	44405	25 %	0 %	0 %	75 %	56750045
76	NC_006576	GACT	2	8	44684	44691	25 %	25 %	25 %	25 %	56750045
77	NC_006576	GGAG	2	8	45076	45083	25 %	0 %	75 %	0 %	56750046
78	NC_006576	TTGC	2	8	46122	46129	0 %	50 %	25 %	25 %	56750047
79	NC_006576	ATTT	2	8	46430	46437	25 %	75 %	0 %	0 %	56750047
80	NC_006576	GATT	2	8	46704	46711	25 %	50 %	25 %	0 %	56750047
81	NC_006576	CGAT	2	8	46782	46789	25 %	25 %	25 %	25 %	56750047
82	NC_006576	TTTC	2	8	46899	46906	0 %	75 %	0 %	25 %	56750047
83	NC_006576	GATT	2	8	47182	47189	25 %	50 %	25 %	0 %	56750047
84	NC_006576	TGGT	2	8	47500	47507	0 %	50 %	50 %	0 %	56750047
85	NC_006576	AATC	2	8	47891	47898	50 %	25 %	0 %	25 %	56750048
86	NC_006576	ATCG	2	8	48249	48256	25 %	25 %	25 %	25 %	56750048
87	NC_006576	CTGA	2	8	48275	48282	25 %	25 %	25 %	25 %	56750048
88	NC_006576	GCGA	2	8	49068	49075	25 %	0 %	50 %	25 %	56750048
89	NC_006576	CCGC	2	8	49220	49227	0 %	0 %	25 %	75 %	56750048
90	NC_006576	CCAT	2	8	50398	50405	25 %	25 %	0 %	50 %	56750050
91	NC_006576	TCAA	2	8	50655	50662	50 %	25 %	0 %	25 %	56750050
92	NC_006576	AGCC	2	8	50808	50815	25 %	0 %	25 %	50 %	56750050
93	NC_006576	GGTG	2	8	51442	51449	0 %	25 %	75 %	0 %	56750051
94	NC_006576	TAGC	2	8	51577	51584	25 %	25 %	25 %	25 %	56750051
95	NC_006576	ATCG	2	8	51621	51628	25 %	25 %	25 %	25 %	56750051
96	NC_006576	AGGG	2	8	51819	51826	25 %	0 %	75 %	0 %	56750051
97	NC_006576	AGTG	2	8	52403	52410	25 %	25 %	50 %	0 %	56750052
98	NC_006576	GATC	2	8	52436	52443	25 %	25 %	25 %	25 %	56750052
99	NC_006576	GATC	2	8	52823	52830	25 %	25 %	25 %	25 %	56750052
100	NC_006576	CTGA	2	8	53007	53014	25 %	25 %	25 %	25 %	56750052
101	NC_006576	GAGG	2	8	54470	54477	25 %	0 %	75 %	0 %	56750054
102	NC_006576	TCAG	2	8	55435	55442	25 %	25 %	25 %	25 %	56750054
103	NC_006576	GGCT	2	8	55448	55455	0 %	25 %	50 %	25 %	56750054
104	NC_006576	AGCC	2	8	56318	56325	25 %	0 %	25 %	50 %	56750054
105	NC_006576	AACC	2	8	56462	56469	50 %	0 %	0 %	50 %	56750054
106	NC_006576	CAGC	2	8	58174	58181	25 %	0 %	25 %	50 %	56750055
107	NC_006576	TGGC	2	8	58444	58451	0 %	25 %	50 %	25 %	56750056
108	NC_006576	CAGC	2	8	58567	58574	25 %	0 %	25 %	50 %	56750056
109	NC_006576	CCAG	2	8	58771	58778	25 %	0 %	25 %	50 %	56750056
110	NC_006576	TGCC	2	8	59044	59051	0 %	25 %	25 %	50 %	56750056
111	NC_006576	GCTC	2	8	59130	59137	0 %	25 %	25 %	50 %	56750057
112	NC_006576	ATCC	2	8	60100	60107	25 %	25 %	0 %	50 %	56750058
113	NC_006576	TGCC	2	8	60282	60289	0 %	25 %	25 %	50 %	56750058
114	NC_006576	AGCC	2	8	61009	61016	25 %	0 %	25 %	50 %	56750059
115	NC_006576	GTGG	2	8	63052	63059	0 %	25 %	75 %	0 %	56750061
116	NC_006576	GCCA	2	8	63077	63084	25 %	0 %	25 %	50 %	56750061
117	NC_006576	CGGG	2	8	63362	63369	0 %	0 %	75 %	25 %	56750061
118	NC_006576	TGGC	2	8	63842	63849	0 %	25 %	50 %	25 %	56750062
119	NC_006576	GCTG	2	8	64356	64363	0 %	25 %	50 %	25 %	56750062
120	NC_006576	CCAA	2	8	64970	64977	50 %	0 %	0 %	50 %	56750063
121	NC_006576	CCAC	2	8	65120	65127	25 %	0 %	0 %	75 %	56750063
122	NC_006576	ACTG	2	8	65350	65357	25 %	25 %	25 %	25 %	56750064
123	NC_006576	CTGC	2	8	65911	65918	0 %	25 %	25 %	50 %	56750064
124	NC_006576	CGGT	2	8	66072	66079	0 %	25 %	50 %	25 %	56750065
125	NC_006576	GCTG	2	8	67243	67250	0 %	25 %	50 %	25 %	56750066
126	NC_006576	TGCA	2	8	68414	68421	25 %	25 %	25 %	25 %	56750068
127	NC_006576	GGCA	2	8	69303	69310	25 %	0 %	50 %	25 %	56750069
128	NC_006576	TCAA	2	8	69794	69801	50 %	25 %	0 %	25 %	56750069
129	NC_006576	TCGT	2	8	70283	70290	0 %	50 %	25 %	25 %	56750070
130	NC_006576	CAGC	2	8	70587	70594	25 %	0 %	25 %	50 %	56750070
131	NC_006576	GCAA	2	8	71037	71044	50 %	0 %	25 %	25 %	56750070
132	NC_006576	AGGG	2	8	71123	71130	25 %	0 %	75 %	0 %	56750070
133	NC_006576	CGAT	2	8	71267	71274	25 %	25 %	25 %	25 %	56750070
134	NC_006576	ACAA	2	8	71832	71839	75 %	0 %	0 %	25 %	56750071
135	NC_006576	GCTA	2	8	72654	72661	25 %	25 %	25 %	25 %	56750072
136	NC_006576	GGTT	2	8	74475	74482	0 %	50 %	50 %	0 %	56750073
137	NC_006576	GCGA	2	8	75110	75117	25 %	0 %	50 %	25 %	56750074
138	NC_006576	CGGC	2	8	75307	75314	0 %	0 %	50 %	50 %	56750074
139	NC_006576	CGAT	2	8	75406	75413	25 %	25 %	25 %	25 %	56750074
140	NC_006576	GGGC	2	8	75757	75764	0 %	0 %	75 %	25 %	56750074
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