MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 7465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006511	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	56412278
2	NC_006511	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	56412278
3	NC_006511	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	56412278
4	NC_006511	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	56412278
5	NC_006511	GT	3	6	1832	1837	0 %	50 %	50 %	0 %	56412278
6	NC_006511	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	56412278
7	NC_006511	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	56412278
8	NC_006511	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	56412278
9	NC_006511	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	56412278
10	NC_006511	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	56412279
11	NC_006511	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	56412279
12	NC_006511	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	56412280
13	NC_006511	AG	3	6	4000	4005	50 %	0 %	50 %	0 %	56412280
14	NC_006511	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	56412280
15	NC_006511	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	56412281
16	NC_006511	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	56412281
17	NC_006511	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	56412281
18	NC_006511	TC	3	6	7772	7777	0 %	50 %	0 %	50 %	56412282
19	NC_006511	CG	3	6	7859	7864	0 %	0 %	50 %	50 %	56412282
20	NC_006511	CG	3	6	7957	7962	0 %	0 %	50 %	50 %	56412282
21	NC_006511	CT	3	6	8450	8455	0 %	50 %	0 %	50 %	56412282
22	NC_006511	GC	3	6	9572	9577	0 %	0 %	50 %	50 %	56412284
23	NC_006511	CG	3	6	10532	10537	0 %	0 %	50 %	50 %	56412285
24	NC_006511	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	56412287
25	NC_006511	GC	3	6	13302	13307	0 %	0 %	50 %	50 %	56412287
26	NC_006511	GC	3	6	14539	14544	0 %	0 %	50 %	50 %	56412288
27	NC_006511	GA	3	6	14650	14655	50 %	0 %	50 %	0 %	56412288
28	NC_006511	AT	3	6	15365	15370	50 %	50 %	0 %	0 %	56412289
29	NC_006511	AT	3	6	15640	15645	50 %	50 %	0 %	0 %	56412289
30	NC_006511	AT	3	6	15893	15898	50 %	50 %	0 %	0 %	56412289
31	NC_006511	GA	3	6	17057	17062	50 %	0 %	50 %	0 %	56412292
32	NC_006511	CT	3	6	20333	20338	0 %	50 %	0 %	50 %	459642539
33	NC_006511	GC	3	6	20649	20654	0 %	0 %	50 %	50 %	459642539
34	NC_006511	GC	3	6	20769	20774	0 %	0 %	50 %	50 %	459642539
35	NC_006511	GC	3	6	22032	22037	0 %	0 %	50 %	50 %	459642539
36	NC_006511	CT	3	6	22787	22792	0 %	50 %	0 %	50 %	459642539
37	NC_006511	AT	3	6	23575	23580	50 %	50 %	0 %	0 %	56412294
38	NC_006511	CG	3	6	23645	23650	0 %	0 %	50 %	50 %	56412294
39	NC_006511	GC	4	8	23788	23795	0 %	0 %	50 %	50 %	56412294
40	NC_006511	CT	3	6	25343	25348	0 %	50 %	0 %	50 %	56412296
41	NC_006511	AT	3	6	25373	25378	50 %	50 %	0 %	0 %	56412296
42	NC_006511	GC	3	6	26076	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	56412297
43	NC_006511	CG	3	6	28006	28011	0 %	0 %	50 %	50 %	56412297
44	NC_006511	GC	3	6	28134	28139	0 %	0 %	50 %	50 %	56412297
45	NC_006511	TC	3	6	28366	28371	0 %	50 %	0 %	50 %	56412297
46	NC_006511	GT	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	56412298
47	NC_006511	GT	3	6	28613	28618	0 %	50 %	50 %	0 %	56412298
48	NC_006511	AT	3	6	30525	30530	50 %	50 %	0 %	0 %	56412300
49	NC_006511	GC	3	6	30756	30761	0 %	0 %	50 %	50 %	56412300
50	NC_006511	GC	3	6	31046	31051	0 %	0 %	50 %	50 %	56412300
51	NC_006511	TC	3	6	33478	33483	0 %	50 %	0 %	50 %	56412304
52	NC_006511	AT	3	6	33728	33733	50 %	50 %	0 %	0 %	56412304
53	NC_006511	TA	3	6	33931	33936	50 %	50 %	0 %	0 %	56412304
54	NC_006511	TA	3	6	34426	34431	50 %	50 %	0 %	0 %	56412305
55	NC_006511	AT	3	6	34685	34690	50 %	50 %	0 %	0 %	56412305
56	NC_006511	AT	3	6	35431	35436	50 %	50 %	0 %	0 %	56412306
57	NC_006511	TG	4	8	35646	35653	0 %	50 %	50 %	0 %	56412306
58	NC_006511	GC	3	6	36239	36244	0 %	0 %	50 %	50 %	56412306
59	NC_006511	TA	3	6	37189	37194	50 %	50 %	0 %	0 %	56412307
60	NC_006511	AT	3	6	39505	39510	50 %	50 %	0 %	0 %	56412308
61	NC_006511	GT	3	6	41737	41742	0 %	50 %	50 %	0 %	56412309
62	NC_006511	TG	3	6	42767	42772	0 %	50 %	50 %	0 %	56412309
63	NC_006511	CG	3	6	43282	43287	0 %	0 %	50 %	50 %	56412310
64	NC_006511	TA	3	6	43655	43660	50 %	50 %	0 %	0 %	56412310
65	NC_006511	CA	3	6	44968	44973	50 %	0 %	0 %	50 %	56412311
66	NC_006511	GC	3	6	45671	45676	0 %	0 %	50 %	50 %	56412311
67	NC_006511	TA	3	6	46775	46780	50 %	50 %	0 %	0 %	56412312
68	NC_006511	TG	3	6	47156	47161	0 %	50 %	50 %	0 %	56412312
69	NC_006511	GC	4	8	47295	47302	0 %	0 %	50 %	50 %	56412312
70	NC_006511	GA	3	6	48209	48214	50 %	0 %	50 %	0 %	56412313
71	NC_006511	CG	4	8	49276	49283	0 %	0 %	50 %	50 %	56412314
72	NC_006511	CG	3	6	49489	49494	0 %	0 %	50 %	50 %	56412314
73	NC_006511	TG	3	6	50107	50112	0 %	50 %	50 %	0 %	56412314
74	NC_006511	GC	3	6	51175	51180	0 %	0 %	50 %	50 %	56412315
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90	NC_006511	AT	3	6	63024	63029	50 %	50 %	0 %	0 %	56412326
91	NC_006511	GC	4	8	64062	64069	0 %	0 %	50 %	50 %	56412327
92	NC_006511	AT	3	6	64103	64108	50 %	50 %	0 %	0 %	56412327
93	NC_006511	GT	3	6	64434	64439	0 %	50 %	50 %	0 %	56412327
94	NC_006511	GC	3	6	64527	64532	0 %	0 %	50 %	50 %	56412327
95	NC_006511	GC	3	6	66162	66167	0 %	0 %	50 %	50 %	56412328
96	NC_006511	CG	3	6	66259	66264	0 %	0 %	50 %	50 %	56412328
97	NC_006511	GC	3	6	66665	66670	0 %	0 %	50 %	50 %	56412329
98	NC_006511	AT	3	6	68089	68094	50 %	50 %	0 %	0 %	56412330
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100	NC_006511	GC	3	6	69542	69547	0 %	0 %	50 %	50 %	56412331
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104	NC_006511	GC	3	6	69847	69852	0 %	0 %	50 %	50 %	56412332
105	NC_006511	CG	3	6	70476	70481	0 %	0 %	50 %	50 %	56412333
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107	NC_006511	TG	3	6	71397	71402	0 %	50 %	50 %	0 %	56412334
108	NC_006511	GC	3	6	72215	72220	0 %	0 %	50 %	50 %	56412334
109	NC_006511	GC	3	6	72392	72397	0 %	0 %	50 %	50 %	56412335
110	NC_006511	CG	3	6	73253	73258	0 %	0 %	50 %	50 %	56412336
111	NC_006511	GC	3	6	73399	73404	0 %	0 %	50 %	50 %	56412336
112	NC_006511	CG	3	6	74582	74587	0 %	0 %	50 %	50 %	56412337
113	NC_006511	CT	3	6	75922	75927	0 %	50 %	0 %	50 %	56412338
114	NC_006511	GC	3	6	77090	77095	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
115	NC_006511	CG	3	6	77226	77231	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
116	NC_006511	TC	3	6	77388	77393	0 %	50 %	0 %	50 %	56412339
117	NC_006511	CG	3	6	77702	77707	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
118	NC_006511	GC	5	10	78748	78757	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
119	NC_006511	CG	3	6	78808	78813	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
120	NC_006511	GC	3	6	79393	79398	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
121	NC_006511	GC	3	6	79892	79897	0 %	0 %	50 %	50 %	56412339
122	NC_006511	TG	3	6	80300	80305	0 %	50 %	50 %	0 %	56412340
123	NC_006511	CG	3	6	80951	80956	0 %	0 %	50 %	50 %	56412341
124	NC_006511	CT	3	6	81031	81036	0 %	50 %	0 %	50 %	56412341
125	NC_006511	CG	4	8	81694	81701	0 %	0 %	50 %	50 %	56412342
126	NC_006511	GC	3	6	84219	84224	0 %	0 %	50 %	50 %	56412344
127	NC_006511	GT	4	8	84241	84248	0 %	50 %	50 %	0 %	56412344
128	NC_006511	TC	3	6	85894	85899	0 %	50 %	0 %	50 %	56412345
129	NC_006511	GC	3	6	86159	86164	0 %	0 %	50 %	50 %	56412345
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131	NC_006511	CT	3	6	88675	88680	0 %	50 %	0 %	50 %	56412347
132	NC_006511	AC	3	6	88740	88745	50 %	0 %	0 %	50 %	56412347
133	NC_006511	CT	4	8	88894	88901	0 %	50 %	0 %	50 %	56412347
134	NC_006511	CA	3	6	89106	89111	50 %	0 %	0 %	50 %	56412347
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136	NC_006511	CG	4	8	91381	91388	0 %	0 %	50 %	50 %	56412349
137	NC_006511	GC	3	6	92108	92113	0 %	0 %	50 %	50 %	56412351
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141	NC_006511	GC	3	6	98919	98924	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
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143	NC_006511	GC	3	6	99838	99843	0 %	0 %	50 %	50 %	56412357
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