MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 1590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006448	AC	3	6	2426	2431	50 %	0 %	0 %	50 %	55820105
2	NC_006448	TC	3	6	5883	5888	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
3	NC_006448	CA	3	6	6161	6166	50 %	0 %	0 %	50 %	55820109
4	NC_006448	TC	3	6	6668	6673	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
5	NC_006448	TC	3	6	8347	8352	0 %	50 %	0 %	50 %	55820109
6	NC_006448	TG	3	6	12252	12257	0 %	50 %	50 %	0 %	55820114
7	NC_006448	GA	3	6	12410	12415	50 %	0 %	50 %	0 %	55820114
8	NC_006448	CT	3	6	14061	14066	0 %	50 %	0 %	50 %	55820115
9	NC_006448	AC	3	6	14482	14487	50 %	0 %	0 %	50 %	55820115
10	NC_006448	TC	3	6	14729	14734	0 %	50 %	0 %	50 %	55820116
11	NC_006448	AT	3	6	16094	16099	50 %	50 %	0 %	0 %	55820119
12	NC_006448	AT	3	6	16171	16176	50 %	50 %	0 %	0 %	55820119
13	NC_006448	CA	3	6	16976	16981	50 %	0 %	0 %	50 %	55820122
14	NC_006448	TC	3	6	17039	17044	0 %	50 %	0 %	50 %	55820122
15	NC_006448	AG	3	6	32635	32640	50 %	0 %	50 %	0 %	55820132
16	NC_006448	AT	3	6	34042	34047	50 %	50 %	0 %	0 %	55820134
17	NC_006448	AT	3	6	34636	34641	50 %	50 %	0 %	0 %	55820134
18	NC_006448	TG	3	6	35411	35416	0 %	50 %	50 %	0 %	55820134
19	NC_006448	TC	3	6	37897	37902	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
20	NC_006448	TC	3	6	37945	37950	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
21	NC_006448	CT	3	6	38786	38791	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
22	NC_006448	CA	3	6	38996	39001	50 %	0 %	0 %	50 %	55820135
23	NC_006448	TG	3	6	39110	39115	0 %	50 %	50 %	0 %	55820135
24	NC_006448	TG	3	6	39488	39493	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
25	NC_006448	TG	3	6	39498	39503	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
26	NC_006448	TG	3	6	39617	39622	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
27	NC_006448	CA	3	6	41409	41414	50 %	0 %	0 %	50 %	55820138
28	NC_006448	AT	3	6	42626	42631	50 %	50 %	0 %	0 %	55820139
29	NC_006448	AT	3	6	42703	42708	50 %	50 %	0 %	0 %	55820139
30	NC_006448	AT	3	6	44185	44190	50 %	50 %	0 %	0 %	55820142
31	NC_006448	TC	4	8	45548	45555	0 %	50 %	0 %	50 %	55820143
32	NC_006448	GT	3	6	47178	47183	0 %	50 %	50 %	0 %	55820145
33	NC_006448	GT	3	6	47566	47571	0 %	50 %	50 %	0 %	55820145
34	NC_006448	CT	3	6	47681	47686	0 %	50 %	0 %	50 %	55820145
35	NC_006448	CT	3	6	47771	47776	0 %	50 %	0 %	50 %	55820145
36	NC_006448	CA	3	6	47844	47849	50 %	0 %	0 %	50 %	55820145
37	NC_006448	AC	3	6	47895	47900	50 %	0 %	0 %	50 %	55820145
38	NC_006448	CA	3	6	48603	48608	50 %	0 %	0 %	50 %	55820146
39	NC_006448	TC	3	6	50512	50517	0 %	50 %	0 %	50 %	55820148
40	NC_006448	GT	3	6	53128	53133	0 %	50 %	50 %	0 %	55820150
41	NC_006448	AG	3	6	54865	54870	50 %	0 %	50 %	0 %	55820151
42	NC_006448	TC	3	6	56219	56224	0 %	50 %	0 %	50 %	55820153
43	NC_006448	AG	3	6	56807	56812	50 %	0 %	50 %	0 %	55820153
44	NC_006448	AC	3	6	57819	57824	50 %	0 %	0 %	50 %	55820153
45	NC_006448	GA	3	6	57994	57999	50 %	0 %	50 %	0 %	55820153
46	NC_006448	TC	4	8	58075	58082	0 %	50 %	0 %	50 %	55820153
47	NC_006448	TG	4	8	59566	59573	0 %	50 %	50 %	0 %	55820156
48	NC_006448	TA	3	6	60425	60430	50 %	50 %	0 %	0 %	55820157
49	NC_006448	AG	3	6	60632	60637	50 %	0 %	50 %	0 %	55820157
50	NC_006448	TG	3	6	61320	61325	0 %	50 %	50 %	0 %	55820157
51	NC_006448	AT	3	6	62174	62179	50 %	50 %	0 %	0 %	55820159
52	NC_006448	AT	3	6	62654	62659	50 %	50 %	0 %	0 %	55820159
53	NC_006448	CA	3	6	63461	63466	50 %	0 %	0 %	50 %	55820161
54	NC_006448	AT	3	6	64549	64554	50 %	50 %	0 %	0 %	55820161
55	NC_006448	AC	3	6	65738	65743	50 %	0 %	0 %	50 %	55820162
56	NC_006448	AT	3	6	73015	73020	50 %	50 %	0 %	0 %	55820164
57	NC_006448	AG	3	6	73190	73195	50 %	0 %	50 %	0 %	55820164
58	NC_006448	GA	3	6	73205	73210	50 %	0 %	50 %	0 %	55820164
59	NC_006448	CT	3	6	73297	73302	0 %	50 %	0 %	50 %	55820164
60	NC_006448	AT	3	6	73531	73536	50 %	50 %	0 %	0 %	55820164
61	NC_006448	CT	3	6	74817	74822	0 %	50 %	0 %	50 %	55820164
62	NC_006448	AT	3	6	75428	75433	50 %	50 %	0 %	0 %	55820164
63	NC_006448	CA	3	6	77430	77435	50 %	0 %	0 %	50 %	55820165
64	NC_006448	GA	3	6	79274	79279	50 %	0 %	50 %	0 %	55820167
65	NC_006448	GA	3	6	80463	80468	50 %	0 %	50 %	0 %	55820170
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67	NC_006448	AT	3	6	81022	81027	50 %	50 %	0 %	0 %	55820172
68	NC_006448	AC	3	6	82298	82303	50 %	0 %	0 %	50 %	55820174
69	NC_006448	CA	3	6	83443	83448	50 %	0 %	0 %	50 %	55820175
70	NC_006448	GA	4	8	85008	85015	50 %	0 %	50 %	0 %	55820177
71	NC_006448	AT	3	6	85722	85727	50 %	50 %	0 %	0 %	55820178
72	NC_006448	AG	3	6	85839	85844	50 %	0 %	50 %	0 %	55820178
73	NC_006448	AT	3	6	86152	86157	50 %	50 %	0 %	0 %	55820179
74	NC_006448	GC	3	6	87160	87165	0 %	0 %	50 %	50 %	55820179
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78	NC_006448	AC	3	6	93562	93567	50 %	0 %	0 %	50 %	55820183
79	NC_006448	GA	3	6	93858	93863	50 %	0 %	50 %	0 %	55820184
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82	NC_006448	TC	3	6	98720	98725	0 %	50 %	0 %	50 %	55820190
83	NC_006448	TG	3	6	99365	99370	0 %	50 %	50 %	0 %	55820191
84	NC_006448	AT	3	6	99729	99734	50 %	50 %	0 %	0 %	55820192
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91	NC_006448	TA	3	6	105342	105347	50 %	50 %	0 %	0 %	55820200
92	NC_006448	AG	4	8	106926	106933	50 %	0 %	50 %	0 %	55820200
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94	NC_006448	AG	3	6	107481	107486	50 %	0 %	50 %	0 %	55820200
95	NC_006448	AG	3	6	107720	107725	50 %	0 %	50 %	0 %	55820201
96	NC_006448	TA	3	6	107775	107780	50 %	50 %	0 %	0 %	55820201
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98	NC_006448	TA	3	6	108506	108511	50 %	50 %	0 %	0 %	55820201
99	NC_006448	TA	3	6	108745	108750	50 %	50 %	0 %	0 %	55820201
100	NC_006448	AT	3	6	108766	108771	50 %	50 %	0 %	0 %	55820201
101	NC_006448	AT	3	6	109081	109086	50 %	50 %	0 %	0 %	55820202
102	NC_006448	TG	3	6	111448	111453	0 %	50 %	50 %	0 %	55820204
103	NC_006448	AG	3	6	111823	111828	50 %	0 %	50 %	0 %	55820204
104	NC_006448	GA	3	6	111908	111913	50 %	0 %	50 %	0 %	55820204
105	NC_006448	AT	3	6	112002	112007	50 %	50 %	0 %	0 %	55820204
106	NC_006448	AT	3	6	112174	112179	50 %	50 %	0 %	0 %	55820204
107	NC_006448	TA	3	6	113336	113341	50 %	50 %	0 %	0 %	55820205
108	NC_006448	AG	3	6	115096	115101	50 %	0 %	50 %	0 %	55820207
109	NC_006448	TA	3	6	115123	115128	50 %	50 %	0 %	0 %	55820207
110	NC_006448	TG	3	6	115392	115397	0 %	50 %	50 %	0 %	55820207
111	NC_006448	AG	3	6	116826	116831	50 %	0 %	50 %	0 %	55820209
112	NC_006448	TA	3	6	116957	116962	50 %	50 %	0 %	0 %	55820209
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114	NC_006448	TA	3	6	119172	119177	50 %	50 %	0 %	0 %	55820212
115	NC_006448	GA	3	6	119846	119851	50 %	0 %	50 %	0 %	55820213
116	NC_006448	CA	3	6	121491	121496	50 %	0 %	0 %	50 %	55820216
117	NC_006448	CA	3	6	127149	127154	50 %	0 %	0 %	50 %	55820220
118	NC_006448	AC	3	6	141109	141114	50 %	0 %	0 %	50 %	55820223
119	NC_006448	TA	3	6	141238	141243	50 %	50 %	0 %	0 %	55820223
120	NC_006448	CT	3	6	142331	142336	0 %	50 %	0 %	50 %	55820223
121	NC_006448	AG	3	6	142618	142623	50 %	0 %	50 %	0 %	55820224
122	NC_006448	CT	3	6	142884	142889	0 %	50 %	0 %	50 %	55820224
123	NC_006448	CA	4	8	145874	145881	50 %	0 %	0 %	50 %	55820226
124	NC_006448	TG	3	6	146550	146555	0 %	50 %	50 %	0 %	55820227
125	NC_006448	TA	3	6	149054	149059	50 %	50 %	0 %	0 %	55820229
126	NC_006448	CT	3	6	149778	149783	0 %	50 %	0 %	50 %	55820230
127	NC_006448	AT	3	6	151499	151504	50 %	50 %	0 %	0 %	55820232
128	NC_006448	CA	3	6	152010	152015	50 %	0 %	0 %	50 %	55820232
129	NC_006448	AG	3	6	153817	153822	50 %	0 %	50 %	0 %	55820234
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131	NC_006448	CT	3	6	154688	154693	0 %	50 %	0 %	50 %	55820235
132	NC_006448	GA	3	6	158950	158955	50 %	0 %	50 %	0 %	55820242
133	NC_006448	TA	3	6	159345	159350	50 %	50 %	0 %	0 %	55820243
134	NC_006448	CT	3	6	160792	160797	0 %	50 %	0 %	50 %	55820243
135	NC_006448	TC	3	6	161618	161623	0 %	50 %	0 %	50 %	55820244
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138	NC_006448	CT	3	6	167290	167295	0 %	50 %	0 %	50 %	55820251
139	NC_006448	AG	3	6	167405	167410	50 %	0 %	50 %	0 %	55820251
140	NC_006448	AG	3	6	169162	169167	50 %	0 %	50 %	0 %	55820253
141	NC_006448	AG	3	6	170706	170711	50 %	0 %	50 %	0 %	55820256
142	NC_006448	TC	3	6	170931	170936	0 %	50 %	0 %	50 %	55820256
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