MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_006448	GAA	2	6	251016	251021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820342
4002	NC_006448	AGC	2	6	251109	251114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820342
4003	NC_006448	T	6	6	251117	251122	0 %	100 %	0 %	0 %	55820342
4004	NC_006448	CTT	2	6	251123	251128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820342
4005	NC_006448	CGTT	2	8	251149	251156	0 %	50 %	25 %	25 %	55820342
4006	NC_006448	CGAA	2	8	251247	251254	50 %	0 %	25 %	25 %	55820342
4007	NC_006448	ATA	2	6	251272	251277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820342
4008	NC_006448	TGA	2	6	251318	251323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820342
4009	NC_006448	GAC	2	6	251336	251341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820342
4010	NC_006448	CCAG	2	8	251358	251365	25 %	0 %	25 %	50 %	55820342
4011	NC_006448	CA	3	6	251391	251396	50 %	0 %	0 %	50 %	55820342
4012	NC_006448	GCA	2	6	251422	251427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820342
4013	NC_006448	CTT	2	6	251647	251652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820343
4014	NC_006448	GTT	2	6	251717	251722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820343
4015	NC_006448	TAA	2	6	251810	251815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820343
4016	NC_006448	TCAA	2	8	251944	251951	50 %	25 %	0 %	25 %	55820344
4017	NC_006448	TTG	2	6	251984	251989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820344
4018	NC_006448	GTG	2	6	252057	252062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820344
4019	NC_006448	TTC	2	6	252069	252074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820344
4020	NC_006448	GAG	2	6	252089	252094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820344
4021	NC_006448	TTG	2	6	252186	252191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820344
4022	NC_006448	AAAC	2	8	252203	252210	75 %	0 %	0 %	25 %	55820344
4023	NC_006448	CT	3	6	252226	252231	0 %	50 %	0 %	50 %	55820344
4024	NC_006448	GGA	2	6	252253	252258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820344
4025	NC_006448	CAG	2	6	252297	252302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820344
4026	NC_006448	TGC	2	6	252304	252309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820344
4027	NC_006448	ATG	2	6	252315	252320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820344
4028	NC_006448	AGA	2	6	252360	252365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820344
4029	NC_006448	A	6	6	252443	252448	100 %	0 %	0 %	0 %	55820344
4030	NC_006448	CT	3	6	252474	252479	0 %	50 %	0 %	50 %	55820344
4031	NC_006448	AGAC	2	8	252510	252517	50 %	0 %	25 %	25 %	55820344
4032	NC_006448	GCCAG	2	10	252607	252616	20 %	0 %	40 %	40 %	55820344
4033	NC_006448	AG	3	6	252619	252624	50 %	0 %	50 %	0 %	55820344
4034	NC_006448	TGTTGC	2	12	252631	252642	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	55820344
4035	NC_006448	TAT	3	9	252765	252773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820345
4036	NC_006448	AGA	2	6	252783	252788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820345
4037	NC_006448	GTT	2	6	252808	252813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820345
4038	NC_006448	GTTA	2	8	252901	252908	25 %	50 %	25 %	0 %	55820345
4039	NC_006448	A	6	6	252928	252933	100 %	0 %	0 %	0 %	55820345
4040	NC_006448	GGT	2	6	252964	252969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820345
4041	NC_006448	T	6	6	252981	252986	0 %	100 %	0 %	0 %	55820345
4042	NC_006448	TAT	2	6	252988	252993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820345
4043	NC_006448	TAA	2	6	253014	253019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820345
4044	NC_006448	A	6	6	253084	253089	100 %	0 %	0 %	0 %	55820345
4045	NC_006448	ATC	2	6	253099	253104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820345
4046	NC_006448	CCG	2	6	253135	253140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55820345
4047	NC_006448	TGG	2	6	253169	253174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820345
4048	NC_006448	AAG	2	6	253193	253198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820345
4049	NC_006448	T	6	6	253237	253242	0 %	100 %	0 %	0 %	55820345
4050	NC_006448	TTG	2	6	253370	253375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820346
4051	NC_006448	CAG	2	6	253394	253399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820346
4052	NC_006448	CT	4	8	253424	253431	0 %	50 %	0 %	50 %	55820346
4053	NC_006448	ATT	2	6	253457	253462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820346
4054	NC_006448	TTG	2	6	253487	253492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820346
4055	NC_006448	T	7	7	253505	253511	0 %	100 %	0 %	0 %	55820346
4056	NC_006448	GTG	2	6	253517	253522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820346
4057	NC_006448	AAG	2	6	253527	253532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820346
4058	NC_006448	ATC	2	6	253600	253605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820346
4059	NC_006448	TCT	2	6	253658	253663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820346
4060	NC_006448	TTAA	2	8	253855	253862	50 %	50 %	0 %	0 %	55820346
4061	NC_006448	TAT	2	6	253870	253875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820346
4062	NC_006448	GATG	2	8	253897	253904	25 %	25 %	50 %	0 %	55820346
4063	NC_006448	TTA	2	6	253940	253945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820346
4064	NC_006448	TCTT	2	8	254134	254141	0 %	75 %	0 %	25 %	55820347
4065	NC_006448	GTCT	2	8	254181	254188	0 %	50 %	25 %	25 %	55820347
4066	NC_006448	ACTT	2	8	254202	254209	25 %	50 %	0 %	25 %	55820347
4067	NC_006448	T	6	6	254208	254213	0 %	100 %	0 %	0 %	55820347
4068	NC_006448	GTAG	2	8	254294	254301	25 %	25 %	50 %	0 %	55820347
4069	NC_006448	GTC	2	6	254310	254315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820347
4070	NC_006448	ATCTT	2	10	254395	254404	20 %	60 %	0 %	20 %	55820347
4071	NC_006448	GTT	2	6	254766	254771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820348
4072	NC_006448	AG	3	6	254783	254788	50 %	0 %	50 %	0 %	55820348
4073	NC_006448	TTA	2	6	254847	254852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820348
4074	NC_006448	AG	3	6	254863	254868	50 %	0 %	50 %	0 %	55820348
4075	NC_006448	TAGG	2	8	254869	254876	25 %	25 %	50 %	0 %	55820348
4076	NC_006448	T	7	7	254906	254912	0 %	100 %	0 %	0 %	55820348
4077	NC_006448	ATC	2	6	255017	255022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820348
4078	NC_006448	TTTGG	2	10	255087	255096	0 %	60 %	40 %	0 %	55820348
4079	NC_006448	A	6	6	255279	255284	100 %	0 %	0 %	0 %	55820349
4080	NC_006448	CGG	2	6	255318	255323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820349
4081	NC_006448	GAAG	2	8	255493	255500	50 %	0 %	50 %	0 %	55820349
4082	NC_006448	AGA	2	6	255604	255609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820349
4083	NC_006448	CG	3	6	255619	255624	0 %	0 %	50 %	50 %	55820349
4084	NC_006448	TCT	2	6	255669	255674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820349
4085	NC_006448	CTTT	2	8	255704	255711	0 %	75 %	0 %	25 %	55820349
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4087	NC_006448	TCT	2	6	255732	255737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820349
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4090	NC_006448	CTT	2	6	255859	255864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820349
4091	NC_006448	GCT	2	6	255905	255910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820349
4092	NC_006448	GGT	2	6	255980	255985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820349
4093	NC_006448	TGC	2	6	256027	256032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820349
4094	NC_006448	TGA	2	6	256060	256065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820349
4095	NC_006448	ACC	2	6	256245	256250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820349
4096	NC_006448	TTCG	2	8	256437	256444	0 %	50 %	25 %	25 %	55820349
4097	NC_006448	AAG	2	6	256461	256466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820349
4098	NC_006448	TCG	2	6	256486	256491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820349
4099	NC_006448	ATGA	2	8	256502	256509	50 %	25 %	25 %	0 %	55820349
4100	NC_006448	GATTT	2	10	256530	256539	20 %	60 %	20 %	0 %	55820349
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4102	NC_006448	AAG	2	6	256606	256611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820350
4103	NC_006448	CCTT	2	8	256646	256653	0 %	50 %	0 %	50 %	55820350
4104	NC_006448	GAA	2	6	256700	256705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820350
4105	NC_006448	CTT	2	6	256727	256732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820350
4106	NC_006448	TAG	3	9	256979	256987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820350
4107	NC_006448	CTG	2	6	256997	257002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820350
4108	NC_006448	ACTT	2	8	257005	257012	25 %	50 %	0 %	25 %	55820350
4109	NC_006448	T	6	6	257011	257016	0 %	100 %	0 %	0 %	55820350
4110	NC_006448	GAT	2	6	257017	257022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820350
4111	NC_006448	CT	3	6	257051	257056	0 %	50 %	0 %	50 %	55820350
4112	NC_006448	T	6	6	257085	257090	0 %	100 %	0 %	0 %	55820350
4113	NC_006448	TAAG	2	8	257118	257125	50 %	25 %	25 %	0 %	55820350
4114	NC_006448	ATT	2	6	257377	257382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820351
4115	NC_006448	CAAA	2	8	257436	257443	75 %	0 %	0 %	25 %	55820351
4116	NC_006448	ATG	2	6	257497	257502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820351
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4118	NC_006448	ATT	2	6	257557	257562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820351
4119	NC_006448	ACA	2	6	257565	257570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820351
4120	NC_006448	A	6	6	257596	257601	100 %	0 %	0 %	0 %	55820351
4121	NC_006448	GTA	2	6	257721	257726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820352
4122	NC_006448	CAG	2	6	257806	257811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820352
4123	NC_006448	AG	3	6	257820	257825	50 %	0 %	50 %	0 %	55820352
4124	NC_006448	GAT	2	6	257870	257875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820352
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4126	NC_006448	CAG	2	6	257899	257904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820352
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4131	NC_006448	TGTCC	2	10	258094	258103	0 %	40 %	20 %	40 %	55820352
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4134	NC_006448	ATT	2	6	258243	258248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820352
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4498	NC_006448	GGT	2	6	278012	278017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820378
4499	NC_006448	TC	3	6	278139	278144	0 %	50 %	0 %	50 %	55820378
4500	NC_006448	AGA	2	6	278170	278175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820378

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