MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006448	CAG	2	6	34398	34403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820134
502	NC_006448	TTCA	2	8	34463	34470	25 %	50 %	0 %	25 %	55820134
503	NC_006448	TACT	2	8	34528	34535	25 %	50 %	0 %	25 %	55820134
504	NC_006448	GCC	2	6	34548	34553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55820134
505	NC_006448	GCAA	2	8	34618	34625	50 %	0 %	25 %	25 %	55820134
506	NC_006448	AT	3	6	34636	34641	50 %	50 %	0 %	0 %	55820134
507	NC_006448	TGA	2	6	34651	34656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820134
508	NC_006448	CTT	2	6	34820	34825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820134
509	NC_006448	ACC	2	6	34848	34853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820134
510	NC_006448	TGG	2	6	34873	34878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
511	NC_006448	GGT	2	6	34895	34900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
512	NC_006448	ACA	2	6	34973	34978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820134
513	NC_006448	CAA	2	6	35012	35017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820134
514	NC_006448	A	6	6	35027	35032	100 %	0 %	0 %	0 %	55820134
515	NC_006448	TTC	2	6	35047	35052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820134
516	NC_006448	CAA	2	6	35076	35081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820134
517	NC_006448	TGT	2	6	35167	35172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820134
518	NC_006448	GGT	2	6	35213	35218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
519	NC_006448	GGT	2	6	35240	35245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
520	NC_006448	TTC	2	6	35254	35259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820134
521	NC_006448	GAA	2	6	35324	35329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
522	NC_006448	TGG	2	6	35401	35406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
523	NC_006448	TG	3	6	35411	35416	0 %	50 %	50 %	0 %	55820134
524	NC_006448	TGG	2	6	35532	35537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
525	NC_006448	AGA	2	6	35545	35550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
526	NC_006448	TTG	2	6	35658	35663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820134
527	NC_006448	CGT	2	6	35672	35677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820134
528	NC_006448	AGT	2	6	35704	35709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820134
529	NC_006448	GGT	2	6	35719	35724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
530	NC_006448	AGA	2	6	35746	35751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
531	NC_006448	CTG	2	6	35763	35768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820134
532	NC_006448	TGG	2	6	35884	35889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
533	NC_006448	ACA	2	6	35951	35956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820134
534	NC_006448	TGC	2	6	36019	36024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820134
535	NC_006448	A	6	6	36122	36127	100 %	0 %	0 %	0 %	55820134
536	NC_006448	CTT	2	6	36158	36163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820134
537	NC_006448	TGG	2	6	36205	36210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
538	NC_006448	GAA	2	6	36236	36241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
539	NC_006448	ACC	2	6	36250	36255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820134
540	NC_006448	ACA	2	6	36278	36283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820134
541	NC_006448	GCT	2	6	36320	36325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820134
542	NC_006448	CTA	2	6	36337	36342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820134
543	NC_006448	GATT	2	8	36370	36377	25 %	50 %	25 %	0 %	55820134
544	NC_006448	TCA	2	6	36384	36389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820134
545	NC_006448	TGG	2	6	36460	36465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
546	NC_006448	CTTGCA	2	12	36479	36490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55820134
547	NC_006448	GGA	2	6	36560	36565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820134
548	NC_006448	AGA	2	6	36739	36744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
549	NC_006448	CTG	2	6	36750	36755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820134
550	NC_006448	AGT	2	6	36787	36792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820134
551	NC_006448	AAG	2	6	36867	36872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
552	NC_006448	TGAA	2	8	36906	36913	50 %	25 %	25 %	0 %	55820134
553	NC_006448	TGT	2	6	36931	36936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820134
554	NC_006448	CAG	2	6	36993	36998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820134
555	NC_006448	AGC	2	6	37015	37020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820134
556	NC_006448	GTG	2	6	37086	37091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820134
557	NC_006448	ATC	2	6	37097	37102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820134
558	NC_006448	ATG	2	6	37200	37205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820134
559	NC_006448	CCAA	2	8	37206	37213	50 %	0 %	0 %	50 %	55820134
560	NC_006448	GAC	2	6	37333	37338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820134
561	NC_006448	GAA	2	6	37340	37345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820134
562	NC_006448	CAAG	2	8	37464	37471	50 %	0 %	25 %	25 %	55820134
563	NC_006448	ATT	2	6	37481	37486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820134
564	NC_006448	ATA	2	6	37594	37599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820134
565	NC_006448	GAA	2	6	37793	37798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
566	NC_006448	TGC	2	6	37831	37836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820135
567	NC_006448	TC	3	6	37897	37902	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
568	NC_006448	ATG	2	6	37905	37910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820135
569	NC_006448	TC	3	6	37945	37950	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
570	NC_006448	GCT	2	6	37997	38002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820135
571	NC_006448	GAA	2	6	38146	38151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
572	NC_006448	TCG	2	6	38203	38208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820135
573	NC_006448	CAT	2	6	38220	38225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820135
574	NC_006448	AAG	2	6	38241	38246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
575	NC_006448	CTT	2	6	38279	38284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820135
576	NC_006448	AGT	2	6	38398	38403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820135
577	NC_006448	GTT	2	6	38441	38446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820135
578	NC_006448	ATC	2	6	38447	38452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820135
579	NC_006448	GAT	2	6	38453	38458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820135
580	NC_006448	TCA	2	6	38648	38653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820135
581	NC_006448	GAA	2	6	38678	38683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
582	NC_006448	AAATG	2	10	38695	38704	60 %	20 %	20 %	0 %	55820135
583	NC_006448	A	6	6	38713	38718	100 %	0 %	0 %	0 %	55820135
584	NC_006448	CCAA	2	8	38743	38750	50 %	0 %	0 %	50 %	55820135
585	NC_006448	CT	3	6	38786	38791	0 %	50 %	0 %	50 %	55820135
586	NC_006448	GTT	2	6	38804	38809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820135
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588	NC_006448	CGT	2	6	38864	38869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820135
589	NC_006448	AAG	2	6	38886	38891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
590	NC_006448	ATTG	2	8	38980	38987	25 %	50 %	25 %	0 %	55820135
591	NC_006448	CA	3	6	38996	39001	50 %	0 %	0 %	50 %	55820135
592	NC_006448	AGA	2	6	39004	39009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
593	NC_006448	ACTT	2	8	39041	39048	25 %	50 %	0 %	25 %	55820135
594	NC_006448	TTGA	2	8	39062	39069	25 %	50 %	25 %	0 %	55820135
595	NC_006448	TGG	2	6	39100	39105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820135
596	NC_006448	TG	3	6	39110	39115	0 %	50 %	50 %	0 %	55820135
597	NC_006448	ACT	2	6	39117	39122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820135
598	NC_006448	A	6	6	39159	39164	100 %	0 %	0 %	0 %	55820135
599	NC_006448	GAA	2	6	39182	39187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820135
600	NC_006448	CTT	2	6	39192	39197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820135
601	NC_006448	GTT	2	6	39290	39295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820136
602	NC_006448	A	6	6	39305	39310	100 %	0 %	0 %	0 %	55820136
603	NC_006448	TGG	2	6	39352	39357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820136
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605	NC_006448	TGCT	2	8	39444	39451	0 %	50 %	25 %	25 %	55820136
606	NC_006448	TG	3	6	39488	39493	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
607	NC_006448	TG	3	6	39498	39503	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
608	NC_006448	TG	3	6	39617	39622	0 %	50 %	50 %	0 %	55820136
609	NC_006448	TGG	2	6	39643	39648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820136
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611	NC_006448	GTAT	2	8	39669	39676	25 %	50 %	25 %	0 %	55820136
612	NC_006448	GAC	2	6	39683	39688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820136
613	NC_006448	ATC	2	6	39734	39739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820136
614	NC_006448	CTT	2	6	39770	39775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820136
615	NC_006448	ACTC	2	8	39810	39817	25 %	25 %	0 %	50 %	55820136
616	NC_006448	TCG	2	6	39820	39825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820136
617	NC_006448	GAA	2	6	39848	39853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820136
618	NC_006448	TCC	2	6	39855	39860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820136
619	NC_006448	TTC	2	6	39891	39896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820136
620	NC_006448	AGC	2	6	39922	39927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820136
621	NC_006448	AGA	2	6	39943	39948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820136
622	NC_006448	GGT	3	9	39977	39985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820136
623	NC_006448	GCT	2	6	40025	40030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820136
624	NC_006448	GAA	2	6	40103	40108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820136
625	NC_006448	CTT	2	6	40184	40189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820136
626	NC_006448	GAA	2	6	40222	40227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820136
627	NC_006448	GTG	2	6	40241	40246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820136
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629	NC_006448	AAG	2	6	40430	40435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820137
630	NC_006448	GAA	2	6	40441	40446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820137
631	NC_006448	GTTT	2	8	40486	40493	0 %	75 %	25 %	0 %	55820137
632	NC_006448	TCG	2	6	40511	40516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820137
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638	NC_006448	A	6	6	40862	40867	100 %	0 %	0 %	0 %	55820138
639	NC_006448	AAAAT	2	10	40870	40879	80 %	20 %	0 %	0 %	55820138
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641	NC_006448	A	6	6	40944	40949	100 %	0 %	0 %	0 %	55820138
642	NC_006448	TTGG	2	8	40951	40958	0 %	50 %	50 %	0 %	55820138
643	NC_006448	ATC	2	6	40962	40967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820138
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659	NC_006448	AAC	2	6	41503	41508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820138
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758	NC_006448	CT	3	6	47681	47686	0 %	50 %	0 %	50 %	55820145
759	NC_006448	CAGA	2	8	47724	47731	50 %	0 %	25 %	25 %	55820145
760	NC_006448	CT	3	6	47771	47776	0 %	50 %	0 %	50 %	55820145
761	NC_006448	TGA	2	6	47809	47814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820145
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