MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006448	TGC	2	6	305515	305520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820409
5002	NC_006448	CAAG	2	8	305569	305576	50 %	0 %	25 %	25 %	55820409
5003	NC_006448	GAC	2	6	305621	305626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820409
5004	NC_006448	AATC	2	8	305705	305712	50 %	25 %	0 %	25 %	55820409
5005	NC_006448	ATA	2	6	305740	305745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820409
5006	NC_006448	AG	3	6	305757	305762	50 %	0 %	50 %	0 %	55820409
5007	NC_006448	TA	3	6	305948	305953	50 %	50 %	0 %	0 %	55820409
5008	NC_006448	CTA	2	6	305992	305997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820409
5009	NC_006448	ATTT	2	8	306035	306042	25 %	75 %	0 %	0 %	55820409
5010	NC_006448	AG	3	6	306070	306075	50 %	0 %	50 %	0 %	55820409
5011	NC_006448	TCC	2	6	306087	306092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820409
5012	NC_006448	AAC	2	6	306153	306158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820409
5013	NC_006448	GAT	2	6	306200	306205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820409
5014	NC_006448	GAT	2	6	306320	306325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820409
5015	NC_006448	TTA	2	6	306415	306420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820410
5016	NC_006448	ACG	2	6	306432	306437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820410
5017	NC_006448	T	6	6	306459	306464	0 %	100 %	0 %	0 %	55820410
5018	NC_006448	GA	3	6	306646	306651	50 %	0 %	50 %	0 %	55820410
5019	NC_006448	TCA	2	6	306769	306774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820410
5020	NC_006448	AAG	2	6	306778	306783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820410
5021	NC_006448	TTA	2	6	306802	306807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820410
5022	NC_006448	TCCAGC	2	12	306870	306881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55820410
5023	NC_006448	GAA	2	6	306926	306931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820410
5024	NC_006448	CATTC	2	10	307007	307016	20 %	40 %	0 %	40 %	55820410
5025	NC_006448	TTTTTG	2	12	307050	307061	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	55820410
5026	NC_006448	CTT	2	6	307470	307475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820411
5027	NC_006448	AAC	2	6	307521	307526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820411
5028	NC_006448	CAAG	2	8	307529	307536	50 %	0 %	25 %	25 %	55820411
5029	NC_006448	AGT	2	6	307543	307548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820411
5030	NC_006448	TGC	2	6	307681	307686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820411
5031	NC_006448	ATA	2	6	307767	307772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820411
5032	NC_006448	TTC	2	6	307773	307778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820411
5033	NC_006448	AGA	2	6	307861	307866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820411
5034	NC_006448	TGA	2	6	307936	307941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820411
5035	NC_006448	AATT	2	8	307943	307950	50 %	50 %	0 %	0 %	55820411
5036	NC_006448	TTA	2	6	308099	308104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820412
5037	NC_006448	TTG	2	6	308123	308128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820412
5038	NC_006448	GA	3	6	308134	308139	50 %	0 %	50 %	0 %	55820412
5039	NC_006448	TC	3	6	308156	308161	0 %	50 %	0 %	50 %	55820412
5040	NC_006448	ACG	2	6	308183	308188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820412
5041	NC_006448	CGT	2	6	308299	308304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820412
5042	NC_006448	CAA	2	6	308308	308313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820412
5043	NC_006448	TAT	2	6	308328	308333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820412
5044	NC_006448	GAT	2	6	308334	308339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820412
5045	NC_006448	TTG	2	6	308366	308371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820412
5046	NC_006448	TGA	2	6	308391	308396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820412
5047	NC_006448	TAT	2	6	308400	308405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820412
5048	NC_006448	GAA	2	6	308422	308427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820412
5049	NC_006448	CGT	2	6	308455	308460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820412
5050	NC_006448	CTA	2	6	308474	308479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820412
5051	NC_006448	GTT	2	6	308542	308547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820412
5052	NC_006448	TGA	2	6	308553	308558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820412
5053	NC_006448	AC	3	6	308597	308602	50 %	0 %	0 %	50 %	55820412
5054	NC_006448	ATG	2	6	308663	308668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820412
5055	NC_006448	AAAC	2	8	308678	308685	75 %	0 %	0 %	25 %	55820412
5056	NC_006448	TTAC	2	8	308706	308713	25 %	50 %	0 %	25 %	55820412
5057	NC_006448	ATT	2	6	308798	308803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820413
5058	NC_006448	A	6	6	308822	308827	100 %	0 %	0 %	0 %	55820413
5059	NC_006448	CTG	2	6	308842	308847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820413
5060	NC_006448	TCT	2	6	308851	308856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820413
5061	NC_006448	GTT	2	6	308883	308888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820413
5062	NC_006448	CTT	2	6	308907	308912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820413
5063	NC_006448	ATA	2	6	308938	308943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820413
5064	NC_006448	GTT	2	6	308955	308960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820413
5065	NC_006448	TGA	2	6	308987	308992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820413
5066	NC_006448	ATCA	2	8	309050	309057	50 %	25 %	0 %	25 %	55820413
5067	NC_006448	GTCT	2	8	309131	309138	0 %	50 %	25 %	25 %	55820413
5068	NC_006448	GAG	2	6	309177	309182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820413
5069	NC_006448	TAC	2	6	309259	309264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820413
5070	NC_006448	AAG	2	6	309288	309293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820413
5071	NC_006448	TTG	2	6	309298	309303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820413
5072	NC_006448	CTA	2	6	309335	309340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820413
5073	NC_006448	TTC	2	6	309436	309441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820413
5074	NC_006448	TAT	3	9	309473	309481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820413
5075	NC_006448	ATG	2	6	309526	309531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820413
5076	NC_006448	TTAACT	2	12	309550	309561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	55820413
5077	NC_006448	ATG	2	6	309564	309569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820413
5078	NC_006448	CAGATG	2	12	309591	309602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820413
5079	NC_006448	GTCA	2	8	309618	309625	25 %	25 %	25 %	25 %	55820413
5080	NC_006448	TTA	2	6	309649	309654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820413
5081	NC_006448	GAA	2	6	309708	309713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820413
5082	NC_006448	TTC	2	6	309833	309838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820413
5083	NC_006448	GAC	2	6	309876	309881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820413
5084	NC_006448	CAGC	2	8	309935	309942	25 %	0 %	25 %	50 %	55820413
5085	NC_006448	TTA	2	6	309955	309960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820413
5086	NC_006448	TGAT	2	8	309967	309974	25 %	50 %	25 %	0 %	55820413
5087	NC_006448	TAA	2	6	309998	310003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820413
5088	NC_006448	AGATG	2	10	310034	310043	40 %	20 %	40 %	0 %	55820413
5089	NC_006448	GGTACA	2	12	310046	310057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55820413
5090	NC_006448	AGA	2	6	310082	310087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820413
5091	NC_006448	AT	3	6	310096	310101	50 %	50 %	0 %	0 %	55820413
5092	NC_006448	ATA	2	6	310451	310456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161611298
5093	NC_006448	TCG	4	12	310503	310514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161611298
5094	NC_006448	TAC	2	6	310542	310547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161611298
5095	NC_006448	GAA	2	6	310561	310566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161611298
5096	NC_006448	A	6	6	310585	310590	100 %	0 %	0 %	0 %	161611298
5097	NC_006448	TC	3	6	310610	310615	0 %	50 %	0 %	50 %	161611298
5098	NC_006448	TGA	2	6	310640	310645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161611298
5099	NC_006448	ATG	2	6	310724	310729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161611298
5100	NC_006448	TGA	2	6	310785	310790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161611298
5101	NC_006448	TGA	2	6	310839	310844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161611298
5102	NC_006448	GAA	2	6	310849	310854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161611298
5103	NC_006448	A	6	6	310888	310893	100 %	0 %	0 %	0 %	161611298
5104	NC_006448	A	6	6	310900	310905	100 %	0 %	0 %	0 %	161611298
5105	NC_006448	GAA	2	6	310917	310922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820415
5106	NC_006448	GTT	2	6	310975	310980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820415
5107	NC_006448	ATT	2	6	310989	310994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820415
5108	NC_006448	ATC	2	6	311050	311055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820415
5109	NC_006448	CTA	2	6	311068	311073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820415
5110	NC_006448	ATC	2	6	311080	311085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820415
5111	NC_006448	TTG	2	6	311142	311147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820415
5112	NC_006448	TGT	2	6	311177	311182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820415
5113	NC_006448	CTAT	2	8	311199	311206	25 %	50 %	0 %	25 %	55820415
5114	NC_006448	A	6	6	311251	311256	100 %	0 %	0 %	0 %	55820415
5115	NC_006448	CAG	2	6	311266	311271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820415
5116	NC_006448	CGA	2	6	311287	311292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820415
5117	NC_006448	TGA	2	6	311342	311347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820415
5118	NC_006448	A	6	6	311528	311533	100 %	0 %	0 %	0 %	55820415
5119	NC_006448	ACC	2	6	311545	311550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820415
5120	NC_006448	ATT	2	6	311553	311558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820415
5121	NC_006448	CAAGCT	2	12	311586	311597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55820415
5122	NC_006448	GTG	2	6	311608	311613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820415
5123	NC_006448	TTAC	2	8	311678	311685	25 %	50 %	0 %	25 %	55820415
5124	NC_006448	A	7	7	311727	311733	100 %	0 %	0 %	0 %	55820415
5125	NC_006448	GGAC	2	8	311802	311809	25 %	0 %	50 %	25 %	55820415
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5143	NC_006448	TCAT	2	8	312579	312586	25 %	50 %	0 %	25 %	55820416
5144	NC_006448	GCT	2	6	312591	312596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820416
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5154	NC_006448	AT	3	6	313088	313093	50 %	50 %	0 %	0 %	55820417
5155	NC_006448	TCG	2	6	313180	313185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820417
5156	NC_006448	CTG	2	6	313225	313230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820417
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5162	NC_006448	TAAA	2	8	313444	313451	75 %	25 %	0 %	0 %	55820417
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5235	NC_006448	TCT	2	6	317808	317813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820419
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5247	NC_006448	TATT	2	8	319132	319139	25 %	75 %	0 %	0 %	55820420
5248	NC_006448	AAG	2	6	319190	319195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820420
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5252	NC_006448	TAA	2	6	319415	319420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820421
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5359	NC_006448	CCCT	2	8	325195	325202	0 %	25 %	0 %	75 %	55820427
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5367	NC_006448	TGGTT	2	10	325667	325676	0 %	60 %	40 %	0 %	55820427
5368	NC_006448	TAC	2	6	325683	325688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820427
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5374	NC_006448	TTC	2	6	326165	326170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820428
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5493	NC_006448	ATA	2	6	333137	333142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820436
5494	NC_006448	GTA	2	6	333214	333219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820436
5495	NC_006448	TTG	2	6	333338	333343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820437
5496	NC_006448	CTC	2	6	333381	333386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820437
5497	NC_006448	GAA	2	6	333394	333399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820437
5498	NC_006448	AAG	2	6	333572	333577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820437
5499	NC_006448	A	6	6	333592	333597	100 %	0 %	0 %	0 %	55820437
5500	NC_006448	GCAGAA	2	12	333643	333654	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55820437

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