MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 1178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	50913348
2	NC_006086	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	50913349
3	NC_006086	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	50913350
4	NC_006086	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	50913352
5	NC_006086	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	50913357
6	NC_006086	TACAC	2	10	17002	17011	40 %	20 %	0 %	40 %	50913361
7	NC_006086	TAAAT	2	10	17012	17021	60 %	40 %	0 %	0 %	50913361
8	NC_006086	AGTGA	2	10	34178	34187	40 %	20 %	40 %	0 %	50913364
9	NC_006086	ATTTT	2	10	34877	34886	20 %	80 %	0 %	0 %	50913365
10	NC_006086	TTGAT	2	10	35066	35075	20 %	60 %	20 %	0 %	50913365
11	NC_006086	AATAT	2	10	37226	37235	60 %	40 %	0 %	0 %	50913367
12	NC_006086	GAGTT	2	10	38052	38061	20 %	40 %	40 %	0 %	50913369
13	NC_006086	TTTAT	2	10	38063	38072	20 %	80 %	0 %	0 %	50913369
14	NC_006086	ATCTG	2	10	39888	39897	20 %	40 %	20 %	20 %	50913373
15	NC_006086	AATCG	2	10	40027	40036	40 %	20 %	20 %	20 %	50913374
16	NC_006086	CCTAT	2	10	40081	40090	20 %	40 %	0 %	40 %	50913374
17	NC_006086	AAGCC	2	10	40457	40466	40 %	0 %	20 %	40 %	50913375
18	NC_006086	AGTTG	2	10	40594	40603	20 %	40 %	40 %	0 %	50913376
19	NC_006086	CTACT	2	10	41701	41710	20 %	40 %	0 %	40 %	50913378
20	NC_006086	TTGTA	2	10	43535	43544	20 %	60 %	20 %	0 %	50913380
21	NC_006086	GATAC	2	10	46650	46659	40 %	20 %	20 %	20 %	50913381
22	NC_006086	AGTTA	2	10	48561	48570	40 %	40 %	20 %	0 %	50913383
23	NC_006086	GTTTG	2	10	48958	48967	0 %	60 %	40 %	0 %	50913383
24	NC_006086	GATTG	2	10	51746	51755	20 %	40 %	40 %	0 %	50913388
25	NC_006086	CAAAA	2	10	56537	56546	80 %	0 %	0 %	20 %	50913394
26	NC_006086	CCCTG	2	10	57970	57979	0 %	20 %	20 %	60 %	50913397
27	NC_006086	AAGAT	2	10	60262	60271	60 %	20 %	20 %	0 %	50913402
28	NC_006086	GGCAG	2	10	63732	63741	20 %	0 %	60 %	20 %	50913402
29	NC_006086	GCTAT	2	10	69414	69423	20 %	40 %	20 %	20 %	50913406
30	NC_006086	CAAAA	2	10	71238	71247	80 %	0 %	0 %	20 %	50913409
31	NC_006086	ACAAA	2	10	71350	71359	80 %	0 %	0 %	20 %	50913410
32	NC_006086	TTGGT	2	10	72260	72269	0 %	60 %	40 %	0 %	50913411
33	NC_006086	TAAAT	2	10	72860	72869	60 %	40 %	0 %	0 %	50913411
34	NC_006086	ACTGT	2	10	74706	74715	20 %	40 %	20 %	20 %	50913413
35	NC_006086	TGGTG	2	10	77045	77054	0 %	40 %	60 %	0 %	50913417
36	NC_006086	AGCAG	2	10	84366	84375	40 %	0 %	40 %	20 %	50913421
37	NC_006086	GGTCA	2	10	84730	84739	20 %	20 %	40 %	20 %	50913421
38	NC_006086	TTGGG	2	10	85126	85135	0 %	40 %	60 %	0 %	50913422
39	NC_006086	GCAGG	2	10	89207	89216	20 %	0 %	60 %	20 %	50913424
40	NC_006086	CTGCC	2	10	90171	90180	0 %	20 %	20 %	60 %	50913426
41	NC_006086	CTCAG	2	10	90564	90573	20 %	20 %	20 %	40 %	50913426
42	NC_006086	TACTA	2	10	92202	92211	40 %	40 %	0 %	20 %	50913427
43	NC_006086	TCGGA	2	10	95313	95322	20 %	20 %	40 %	20 %	50913430
44	NC_006086	GCTTT	2	10	98058	98067	0 %	60 %	20 %	20 %	50913433
45	NC_006086	TTTTC	2	10	98256	98265	0 %	80 %	0 %	20 %	50913433
46	NC_006086	AAACC	2	10	98321	98330	60 %	0 %	0 %	40 %	50913433
47	NC_006086	ATGGT	2	10	100094	100103	20 %	40 %	40 %	0 %	50913434
48	NC_006086	ATTCA	2	10	100778	100787	40 %	40 %	0 %	20 %	50913434
49	NC_006086	ATTTT	2	10	102043	102052	20 %	80 %	0 %	0 %	50913435
50	NC_006086	TTTTA	2	10	104549	104558	20 %	80 %	0 %	0 %	50913437
51	NC_006086	AAAGC	2	10	104742	104751	60 %	0 %	20 %	20 %	50913437
52	NC_006086	TTTGG	2	10	108736	108745	0 %	60 %	40 %	0 %	50913444
53	NC_006086	TTCAC	2	10	109092	109101	20 %	40 %	0 %	40 %	50913445
54	NC_006086	GAAAT	2	10	110172	110181	60 %	20 %	20 %	0 %	50913447
55	NC_006086	TCCAA	2	10	115871	115880	40 %	20 %	0 %	40 %	161761326
56	NC_006086	CTTGG	2	10	130077	130086	0 %	40 %	40 %	20 %	50913473
57	NC_006086	TCTTA	2	10	130495	130504	20 %	60 %	0 %	20 %	50913473
58	NC_006086	CACTC	2	10	132039	132048	20 %	20 %	0 %	60 %	50913475
59	NC_006086	GATTG	2	10	134300	134309	20 %	40 %	40 %	0 %	50913476
60	NC_006086	TTGAT	2	10	144459	144468	20 %	60 %	20 %	0 %	50913481
61	NC_006086	AAATC	2	10	144627	144636	60 %	20 %	0 %	20 %	50913481
62	NC_006086	TGAAG	2	10	149943	149952	40 %	20 %	40 %	0 %	50913490
63	NC_006086	TTTAG	2	10	152888	152897	20 %	60 %	20 %	0 %	50913494
64	NC_006086	GTGTT	2	10	157292	157301	0 %	60 %	40 %	0 %	50913500
65	NC_006086	TAGGT	2	10	158110	158119	20 %	40 %	40 %	0 %	50913502
66	NC_006086	TAAAT	2	10	158243	158252	60 %	40 %	0 %	0 %	50913502
67	NC_006086	GAGAG	2	10	159278	159287	40 %	0 %	60 %	0 %	50913503
68	NC_006086	ACAAT	2	10	163369	163378	60 %	20 %	0 %	20 %	50913505
69	NC_006086	CAACT	2	10	165147	165156	40 %	20 %	0 %	40 %	50913505
70	NC_006086	ATTAA	2	10	165454	165463	60 %	40 %	0 %	0 %	50913505
71	NC_006086	TTTAA	2	10	166316	166325	40 %	60 %	0 %	0 %	50913506
72	NC_006086	TATTC	2	10	166881	166890	20 %	60 %	0 %	20 %	50913506
73	NC_006086	TTTTA	2	10	169358	169367	20 %	80 %	0 %	0 %	50913509
74	NC_006086	GCTTT	3	15	169934	169948	0 %	60 %	20 %	20 %	50913509
75	NC_006086	GTCAT	2	10	170253	170262	20 %	40 %	20 %	20 %	50913509
76	NC_006086	TAGTG	2	10	171196	171205	20 %	40 %	40 %	0 %	50913510
77	NC_006086	GTTAA	2	10	171600	171609	40 %	40 %	20 %	0 %	50913511
78	NC_006086	AATAA	2	10	171629	171638	80 %	20 %	0 %	0 %	50913511
79	NC_006086	TTGAT	2	10	172716	172725	20 %	60 %	20 %	0 %	50913512
80	NC_006086	TTGAC	2	10	173938	173947	20 %	40 %	20 %	20 %	50913514
81	NC_006086	TACCT	2	10	174119	174128	20 %	40 %	0 %	40 %	50913514
82	NC_006086	AATCA	2	10	174897	174906	60 %	20 %	0 %	20 %	50913515
83	NC_006086	TCATG	2	10	175504	175513	20 %	40 %	20 %	20 %	50913516
84	NC_006086	AACAA	2	10	176650	176659	80 %	0 %	0 %	20 %	50913517
85	NC_006086	CAAAA	2	10	177867	177876	80 %	0 %	0 %	20 %	50913519
86	NC_006086	TTTTA	2	10	178940	178949	20 %	80 %	0 %	0 %	50913519
87	NC_006086	AAAGC	2	10	180129	180138	60 %	0 %	20 %	20 %	50913521
88	NC_006086	AGTTC	2	10	180379	180388	20 %	40 %	20 %	20 %	50913521
89	NC_006086	GCTGA	2	10	180399	180408	20 %	20 %	40 %	20 %	50913521
90	NC_006086	ATCGC	2	10	183773	183782	20 %	20 %	20 %	40 %	161761324
91	NC_006086	TTGGG	2	10	185176	185185	0 %	40 %	60 %	0 %	50913525
92	NC_006086	GAAAA	2	10	190486	190495	80 %	0 %	20 %	0 %	50913530
93	NC_006086	GGATT	2	10	190603	190612	20 %	40 %	40 %	0 %	50913530
94	NC_006086	TTTTG	2	10	191123	191132	0 %	80 %	20 %	0 %	50913530
95	NC_006086	TCATG	2	10	192629	192638	20 %	40 %	20 %	20 %	50913532
96	NC_006086	GTATC	2	10	193890	193899	20 %	40 %	20 %	20 %	50913533
97	NC_006086	GTCGC	2	10	194329	194338	0 %	20 %	40 %	40 %	50913534
98	NC_006086	CTTGT	2	10	198941	198950	0 %	60 %	20 %	20 %	50913538
99	NC_006086	GCAAC	2	10	199874	199883	40 %	0 %	20 %	40 %	50913539
100	NC_006086	AAGGT	2	10	201556	201565	40 %	20 %	40 %	0 %	50913539
101	NC_006086	ATTTG	2	10	207834	207843	20 %	60 %	20 %	0 %	50913547
102	NC_006086	CAAGA	2	10	209756	209765	60 %	0 %	20 %	20 %	50913548
103	NC_006086	TTTGG	2	10	210923	210932	0 %	60 %	40 %	0 %	50913549
104	NC_006086	TGGAT	2	10	211872	211881	20 %	40 %	40 %	0 %	50913550
105	NC_006086	CCTAA	2	10	212945	212954	40 %	20 %	0 %	40 %	50913550
106	NC_006086	GGAAA	2	10	217974	217983	60 %	0 %	40 %	0 %	50913554
107	NC_006086	TAATC	2	10	220800	220809	40 %	40 %	0 %	20 %	50913558
108	NC_006086	TTTAC	2	10	224932	224941	20 %	60 %	0 %	20 %	50913563
109	NC_006086	CAAAC	2	10	227450	227459	60 %	0 %	0 %	40 %	50913566
110	NC_006086	AGATA	2	10	227564	227573	60 %	20 %	20 %	0 %	50913566
111	NC_006086	ATATA	2	10	228353	228362	60 %	40 %	0 %	0 %	50913566
112	NC_006086	GTTTT	2	10	230309	230318	0 %	80 %	20 %	0 %	50913570
113	NC_006086	TTTTG	2	10	232239	232248	0 %	80 %	20 %	0 %	50913571
114	NC_006086	TTTTA	2	10	234725	234734	20 %	80 %	0 %	0 %	50913574
115	NC_006086	CTAAT	2	10	234963	234972	40 %	40 %	0 %	20 %	50913574
116	NC_006086	GAATG	2	10	235486	235495	40 %	20 %	40 %	0 %	50913574
117	NC_006086	GAGAT	2	10	237357	237366	40 %	20 %	40 %	0 %	50913575
118	NC_006086	CCTTC	2	10	239913	239922	0 %	40 %	0 %	60 %	50913578
119	NC_006086	GCTAA	2	10	239956	239965	40 %	20 %	20 %	20 %	50913578
120	NC_006086	TGGAT	2	10	242046	242055	20 %	40 %	40 %	0 %	50913580
121	NC_006086	CTTTT	2	10	242216	242225	0 %	80 %	0 %	20 %	50913580
122	NC_006086	GAGAA	2	10	243586	243595	60 %	0 %	40 %	0 %	50913581
123	NC_006086	GTTAT	2	10	244611	244620	20 %	60 %	20 %	0 %	50913582
124	NC_006086	AAGAT	2	10	244697	244706	60 %	20 %	20 %	0 %	50913582
125	NC_006086	AAATG	2	10	246245	246254	60 %	20 %	20 %	0 %	50913583
126	NC_006086	CAAAT	2	10	247390	247399	60 %	20 %	0 %	20 %	50913585
127	NC_006086	ATGAA	2	10	249058	249067	60 %	20 %	20 %	0 %	50913587
128	NC_006086	CCTTT	2	10	251757	251766	0 %	60 %	0 %	40 %	50913591
129	NC_006086	CTCAT	2	10	251836	251845	20 %	40 %	0 %	40 %	50913592
130	NC_006086	TTTTC	2	10	252056	252065	0 %	80 %	0 %	20 %	50913592
131	NC_006086	TTATT	2	10	252296	252305	20 %	80 %	0 %	0 %	50913592
132	NC_006086	TTGTC	2	10	253796	253805	0 %	60 %	20 %	20 %	50913594
133	NC_006086	GCAGC	2	10	258052	258061	20 %	0 %	40 %	40 %	50913598
134	NC_006086	ATTCC	2	10	259357	259366	20 %	40 %	0 %	40 %	50913600
135	NC_006086	AATCA	2	10	263900	263909	60 %	20 %	0 %	20 %	50913605
136	NC_006086	AGCTA	2	10	267572	267581	40 %	20 %	20 %	20 %	50913607
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