MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006086	CAA	2	6	178884	178889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913519
3002	NC_006086	TTTTA	2	10	178940	178949	20 %	80 %	0 %	0 %	50913519
3003	NC_006086	CTG	2	6	178956	178961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913519
3004	NC_006086	TTAT	2	8	178962	178969	25 %	75 %	0 %	0 %	50913519
3005	NC_006086	CTTA	2	8	178996	179003	25 %	50 %	0 %	25 %	50913519
3006	NC_006086	GTT	2	6	179052	179057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913519
3007	NC_006086	AAAAGC	2	12	179067	179078	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50913519
3008	NC_006086	TA	3	6	179101	179106	50 %	50 %	0 %	0 %	50913519
3009	NC_006086	CTTA	2	8	179125	179132	25 %	50 %	0 %	25 %	50913519
3010	NC_006086	TTG	2	6	179209	179214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913519
3011	NC_006086	CCA	2	6	179223	179228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913519
3012	NC_006086	TTTATT	2	12	179253	179264	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50913519
3013	NC_006086	T	6	6	179340	179345	0 %	100 %	0 %	0 %	50913519
3014	NC_006086	GGA	2	6	179364	179369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913519
3015	NC_006086	ATGTCA	2	12	179404	179415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50913519
3016	NC_006086	GAA	2	6	179418	179423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913519
3017	NC_006086	GGA	2	6	179432	179437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913519
3018	NC_006086	ATT	2	6	179462	179467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161761325
3019	NC_006086	TGG	2	6	179478	179483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161761325
3020	NC_006086	TTC	2	6	179488	179493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761325
3021	NC_006086	GGT	2	6	179560	179565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161761325
3022	NC_006086	AGA	2	6	179589	179594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761325
3023	NC_006086	TTG	2	6	179753	179758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161761325
3024	NC_006086	AGC	2	6	179853	179858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161761325
3025	NC_006086	GTC	2	6	179890	179895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161761325
3026	NC_006086	TAAA	2	8	179909	179916	75 %	25 %	0 %	0 %	161761325
3027	NC_006086	AAG	2	6	180043	180048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913521
3028	NC_006086	AAAGC	2	10	180129	180138	60 %	0 %	20 %	20 %	50913521
3029	NC_006086	GCA	3	9	180182	180190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913521
3030	NC_006086	AAGA	2	8	180202	180209	75 %	0 %	25 %	0 %	50913521
3031	NC_006086	CTA	2	6	180216	180221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913521
3032	NC_006086	CTT	2	6	180259	180264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913521
3033	NC_006086	GAA	3	9	180291	180299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913521
3034	NC_006086	T	6	6	180305	180310	0 %	100 %	0 %	0 %	50913521
3035	NC_006086	A	6	6	180364	180369	100 %	0 %	0 %	0 %	50913521
3036	NC_006086	AGTTC	2	10	180379	180388	20 %	40 %	20 %	20 %	50913521
3037	NC_006086	GCTGA	2	10	180399	180408	20 %	20 %	40 %	20 %	50913521
3038	NC_006086	ATT	2	6	180496	180501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913521
3039	NC_006086	AGA	2	6	180533	180538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913521
3040	NC_006086	CAT	2	6	180548	180553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913521
3041	NC_006086	T	6	6	180562	180567	0 %	100 %	0 %	0 %	50913521
3042	NC_006086	AGG	2	6	180577	180582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913521
3043	NC_006086	ACT	2	6	180618	180623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913522
3044	NC_006086	ACA	2	6	180690	180695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913522
3045	NC_006086	CAGT	2	8	180717	180724	25 %	25 %	25 %	25 %	50913522
3046	NC_006086	ATCT	2	8	180770	180777	25 %	50 %	0 %	25 %	50913522
3047	NC_006086	ATT	2	6	180845	180850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913522
3048	NC_006086	GTT	2	6	180884	180889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913522
3049	NC_006086	AAAGCT	2	12	180891	180902	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913522
3050	NC_006086	TTA	2	6	180924	180929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913522
3051	NC_006086	GGC	2	6	180953	180958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913522
3052	NC_006086	TGA	2	6	180989	180994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913522
3053	NC_006086	GGT	2	6	181007	181012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913522
3054	NC_006086	CAA	2	6	181143	181148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913522
3055	NC_006086	TGAT	2	8	181162	181169	25 %	50 %	25 %	0 %	50913522
3056	NC_006086	ATG	2	6	181227	181232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913522
3057	NC_006086	TTA	2	6	181236	181241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913522
3058	NC_006086	TGA	2	6	181244	181249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913522
3059	NC_006086	GAT	2	6	181287	181292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913522
3060	NC_006086	TGA	2	6	181300	181305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913522
3061	NC_006086	TTG	2	6	181408	181413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913522
3062	NC_006086	ATTT	2	8	181429	181436	25 %	75 %	0 %	0 %	50913522
3063	NC_006086	TGCT	2	8	181471	181478	0 %	50 %	25 %	25 %	50913522
3064	NC_006086	T	6	6	181481	181486	0 %	100 %	0 %	0 %	50913522
3065	NC_006086	A	6	6	181508	181513	100 %	0 %	0 %	0 %	50913522
3066	NC_006086	GCT	2	6	181530	181535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913522
3067	NC_006086	GAT	2	6	181651	181656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913523
3068	NC_006086	TAA	2	6	181677	181682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913523
3069	NC_006086	TAT	2	6	181735	181740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913523
3070	NC_006086	AGA	2	6	181750	181755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913523
3071	NC_006086	TGC	2	6	181759	181764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913523
3072	NC_006086	CTCA	2	8	181781	181788	25 %	25 %	0 %	50 %	50913523
3073	NC_006086	CAG	2	6	181809	181814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913523
3074	NC_006086	TCA	2	6	181831	181836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913523
3075	NC_006086	ATA	2	6	182125	182130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161761324
3076	NC_006086	TTG	2	6	182147	182152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161761324
3077	NC_006086	AAG	2	6	182168	182173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761324
3078	NC_006086	ATT	2	6	182224	182229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161761324
3079	NC_006086	AGT	2	6	182298	182303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761324
3080	NC_006086	ACT	2	6	182305	182310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761324
3081	NC_006086	GTCG	2	8	182322	182329	0 %	25 %	50 %	25 %	161761324
3082	NC_006086	GTG	2	6	182423	182428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161761324
3083	NC_006086	AAG	2	6	182492	182497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761324
3084	NC_006086	TGG	2	6	182585	182590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161761324
3085	NC_006086	GGT	2	6	182785	182790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161761324
3086	NC_006086	GCT	2	6	182794	182799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161761324
3087	NC_006086	GCA	2	6	182835	182840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161761324
3088	NC_006086	TTAT	2	8	182873	182880	25 %	75 %	0 %	0 %	161761324
3089	NC_006086	AGC	2	6	183012	183017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161761324
3090	NC_006086	TGA	2	6	183162	183167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761324
3091	NC_006086	CTTA	2	8	183179	183186	25 %	50 %	0 %	25 %	161761324
3092	NC_006086	TCC	2	6	183285	183290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161761324
3093	NC_006086	GAT	2	6	183427	183432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761324
3094	NC_006086	CAA	2	6	183474	183479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161761324
3095	NC_006086	AGA	2	6	183522	183527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761324
3096	NC_006086	TGG	2	6	183539	183544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161761324
3097	NC_006086	GGA	2	6	183603	183608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161761324
3098	NC_006086	AAG	2	6	183665	183670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761324
3099	NC_006086	CTTT	2	8	183718	183725	0 %	75 %	0 %	25 %	161761324
3100	NC_006086	ATCGC	2	10	183773	183782	20 %	20 %	20 %	40 %	161761324
3101	NC_006086	GCA	2	6	183785	183790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161761324
3102	NC_006086	AGA	2	6	183801	183806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761324
3103	NC_006086	CAC	2	6	183856	183861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161761324
3104	NC_006086	GGA	2	6	183874	183879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161761324
3105	NC_006086	TGGT	2	8	183923	183930	0 %	50 %	50 %	0 %	50913525
3106	NC_006086	TGA	2	6	183935	183940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913525
3107	NC_006086	TTG	2	6	183941	183946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913525
3108	NC_006086	AGA	2	6	184137	184142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913525
3109	NC_006086	CGG	2	6	184185	184190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913525
3110	NC_006086	TCGT	2	8	184313	184320	0 %	50 %	25 %	25 %	50913525
3111	NC_006086	T	6	6	184337	184342	0 %	100 %	0 %	0 %	50913525
3112	NC_006086	TGA	2	6	184410	184415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913525
3113	NC_006086	ATGA	2	8	184474	184481	50 %	25 %	25 %	0 %	50913525
3114	NC_006086	GATC	2	8	184504	184511	25 %	25 %	25 %	25 %	50913525
3115	NC_006086	TATT	2	8	184517	184524	25 %	75 %	0 %	0 %	50913525
3116	NC_006086	ACA	2	6	184579	184584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913525
3117	NC_006086	TCA	2	6	184625	184630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913525
3118	NC_006086	ATT	2	6	184646	184651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913525
3119	NC_006086	TC	3	6	184731	184736	0 %	50 %	0 %	50 %	50913525
3120	NC_006086	A	6	6	184771	184776	100 %	0 %	0 %	0 %	50913525
3121	NC_006086	AGA	2	6	184812	184817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913525
3122	NC_006086	ACCC	2	8	184825	184832	25 %	0 %	0 %	75 %	50913525
3123	NC_006086	ATT	2	6	184870	184875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913525
3124	NC_006086	TA	3	6	184889	184894	50 %	50 %	0 %	0 %	50913525
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3495	NC_006086	ATTG	2	8	204992	204999	25 %	50 %	25 %	0 %	50913543
3496	NC_006086	TGG	2	6	205025	205030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913543
3497	NC_006086	AGA	2	6	205109	205114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913543
3498	NC_006086	CTG	2	6	205117	205122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913543
3499	NC_006086	GCG	2	6	205125	205130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913543
3500	NC_006086	TGA	2	6	205284	205289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913544

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