MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 34266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006086	TCG	2	6	37877	37882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913369
502	NC_006086	GAA	3	9	37900	37908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913369
503	NC_006086	TCT	2	6	37913	37918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913369
504	NC_006086	T	7	7	37924	37930	0 %	100 %	0 %	0 %	50913369
505	NC_006086	AGT	2	6	38016	38021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913369
506	NC_006086	CT	3	6	38039	38044	0 %	50 %	0 %	50 %	50913369
507	NC_006086	GAGTT	2	10	38052	38061	20 %	40 %	40 %	0 %	50913369
508	NC_006086	TTTAT	2	10	38063	38072	20 %	80 %	0 %	0 %	50913369
509	NC_006086	T	6	6	38151	38156	0 %	100 %	0 %	0 %	50913369
510	NC_006086	ACA	2	6	38818	38823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913370
511	NC_006086	A	6	6	38836	38841	100 %	0 %	0 %	0 %	50913370
512	NC_006086	AAG	2	6	38844	38849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913370
513	NC_006086	TAA	2	6	38897	38902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913370
514	NC_006086	GAA	2	6	38935	38940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913370
515	NC_006086	A	7	7	38939	38945	100 %	0 %	0 %	0 %	50913370
516	NC_006086	AGA	2	6	39001	39006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913370
517	NC_006086	ATG	2	6	39078	39083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913371
518	NC_006086	TTA	2	6	39090	39095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913371
519	NC_006086	GGA	2	6	39121	39126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913371
520	NC_006086	GCG	2	6	39174	39179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913371
521	NC_006086	GAA	2	6	39200	39205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913371
522	NC_006086	ACTT	2	8	39352	39359	25 %	50 %	0 %	25 %	50913372
523	NC_006086	AGA	2	6	39385	39390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913372
524	NC_006086	TGA	2	6	39397	39402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913372
525	NC_006086	AAG	2	6	39407	39412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913372
526	NC_006086	TCAA	2	8	39447	39454	50 %	25 %	0 %	25 %	50913372
527	NC_006086	ACT	2	6	39816	39821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913373
528	NC_006086	ATCTG	2	10	39888	39897	20 %	40 %	20 %	20 %	50913373
529	NC_006086	A	7	7	39944	39950	100 %	0 %	0 %	0 %	50913373
530	NC_006086	TTA	2	6	40013	40018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913374
531	NC_006086	AATCG	2	10	40027	40036	40 %	20 %	20 %	20 %	50913374
532	NC_006086	CCTAT	2	10	40081	40090	20 %	40 %	0 %	40 %	50913374
533	NC_006086	CAAG	2	8	40110	40117	50 %	0 %	25 %	25 %	50913374
534	NC_006086	AAT	2	6	40156	40161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913374
535	NC_006086	CGA	2	6	40232	40237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913374
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537	NC_006086	AGG	2	6	40291	40296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913374
538	NC_006086	AT	3	6	40378	40383	50 %	50 %	0 %	0 %	50913375
539	NC_006086	TGA	2	6	40397	40402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913375
540	NC_006086	G	9	9	40436	40444	0 %	0 %	100 %	0 %	50913375
541	NC_006086	AAGCC	2	10	40457	40466	40 %	0 %	20 %	40 %	50913375
542	NC_006086	GAAA	2	8	40515	40522	75 %	0 %	25 %	0 %	50913375
543	NC_006086	ATT	2	6	40571	40576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913376
544	NC_006086	GAC	2	6	40577	40582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913376
545	NC_006086	AGTTG	2	10	40594	40603	20 %	40 %	40 %	0 %	50913376
546	NC_006086	CTA	2	6	40636	40641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913376
547	NC_006086	AG	3	6	40837	40842	50 %	0 %	50 %	0 %	50913377
548	NC_006086	TGT	2	6	40906	40911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913377
549	NC_006086	GAA	2	6	40913	40918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913377
550	NC_006086	AGAA	2	8	40935	40942	75 %	0 %	25 %	0 %	50913377
551	NC_006086	GAA	2	6	40997	41002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913377
552	NC_006086	AGG	2	6	41022	41027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913377
553	NC_006086	GA	4	8	41032	41039	50 %	0 %	50 %	0 %	50913377
554	NC_006086	GAA	2	6	41066	41071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913377
555	NC_006086	TTG	2	6	41088	41093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913377
556	NC_006086	CT	3	6	41106	41111	0 %	50 %	0 %	50 %	50913377
557	NC_006086	ACT	2	6	41133	41138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913378
558	NC_006086	ATT	2	6	41518	41523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913378
559	NC_006086	ATT	2	6	41647	41652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913378
560	NC_006086	GGA	2	6	41694	41699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913378
561	NC_006086	CTACT	2	10	41701	41710	20 %	40 %	0 %	40 %	50913378
562	NC_006086	AATT	2	8	41843	41850	50 %	50 %	0 %	0 %	50913378
563	NC_006086	TGA	2	6	41886	41891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913378
564	NC_006086	AAG	2	6	41929	41934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913378
565	NC_006086	AAG	2	6	41966	41971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913378
566	NC_006086	AAG	2	6	41984	41989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913378
567	NC_006086	TTA	2	6	42160	42165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913378
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570	NC_006086	AGT	2	6	42310	42315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913379
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575	NC_006086	CAA	2	6	42715	42720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913379
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577	NC_006086	TTG	2	6	42753	42758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913379
578	NC_006086	GGC	2	6	42776	42781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913379
579	NC_006086	GAA	2	6	42818	42823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913379
580	NC_006086	ATATTG	2	12	42903	42914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50913380
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587	NC_006086	TTGTA	2	10	43535	43544	20 %	60 %	20 %	0 %	50913380
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592	NC_006086	TA	3	6	43892	43897	50 %	50 %	0 %	0 %	50913380
593	NC_006086	GAT	2	6	43907	43912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913380
594	NC_006086	AG	3	6	43916	43921	50 %	0 %	50 %	0 %	50913380
595	NC_006086	AGC	2	6	43986	43991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913380
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598	NC_006086	TGA	2	6	44305	44310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913380
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600	NC_006086	GTT	2	6	44660	44665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913380
601	NC_006086	TAT	2	6	44686	44691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913380
602	NC_006086	TAT	2	6	44795	44800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913380
603	NC_006086	TAGA	2	8	44810	44817	50 %	25 %	25 %	0 %	50913380
604	NC_006086	TCT	2	6	44844	44849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913381
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607	NC_006086	GCAA	2	8	45011	45018	50 %	0 %	25 %	25 %	50913381
608	NC_006086	A	7	7	45194	45200	100 %	0 %	0 %	0 %	50913381
609	NC_006086	GCT	2	6	45201	45206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913381
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611	NC_006086	ATG	2	6	45240	45245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913381
612	NC_006086	TGA	2	6	45248	45253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913381
613	NC_006086	TGA	2	6	45305	45310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913381
614	NC_006086	ACG	2	6	45385	45390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913381
615	NC_006086	ACGC	2	8	45468	45475	25 %	0 %	25 %	50 %	50913381
616	NC_006086	A	6	6	45498	45503	100 %	0 %	0 %	0 %	50913381
617	NC_006086	A	6	6	45522	45527	100 %	0 %	0 %	0 %	50913381
618	NC_006086	GAA	2	6	45600	45605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913381
619	NC_006086	ATG	3	9	45667	45675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913381
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622	NC_006086	CTA	2	6	45793	45798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913381
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626	NC_006086	ACG	2	6	46033	46038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913381
627	NC_006086	A	6	6	46041	46046	100 %	0 %	0 %	0 %	50913381
628	NC_006086	TGCA	2	8	46273	46280	25 %	25 %	25 %	25 %	50913381
629	NC_006086	AG	3	6	46344	46349	50 %	0 %	50 %	0 %	50913381
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