MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005232	GGT	2	6	28553	28558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505856
502	NC_005232	AAG	2	6	28650	28655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505856
503	NC_005232	CGGAT	2	10	28743	28752	20 %	20 %	40 %	20 %	38505856
504	NC_005232	TG	3	6	28753	28758	0 %	50 %	50 %	0 %	38505856
505	NC_005232	CGC	3	9	28781	28789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505856
506	NC_005232	AACC	2	8	28970	28977	50 %	0 %	0 %	50 %	38505856
507	NC_005232	TGG	2	6	28992	28997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505856
508	NC_005232	G	7	7	29187	29193	0 %	0 %	100 %	0 %	38505856
509	NC_005232	A	7	7	29239	29245	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
510	NC_005232	CCA	2	6	29534	29539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505856
511	NC_005232	ACT	2	6	29584	29589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505856
512	NC_005232	ATT	2	6	29646	29651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505856
513	NC_005232	GTG	2	6	29700	29705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505856
514	NC_005232	CGG	2	6	29719	29724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505856
515	NC_005232	CCA	2	6	29734	29739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505856
516	NC_005232	TCG	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505856
517	NC_005232	ATC	2	6	29807	29812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505856
518	NC_005232	A	7	7	29818	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	38505856
519	NC_005232	ACT	2	6	29933	29938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505856
520	NC_005232	AACGGG	2	12	29965	29976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	38505856
521	NC_005232	CCG	2	6	30083	30088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505856
522	NC_005232	CGA	2	6	30115	30120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505856
523	NC_005232	GGA	2	6	30128	30133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505856
524	NC_005232	CTG	2	6	30228	30233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505856
525	NC_005232	ATCG	2	8	30240	30247	25 %	25 %	25 %	25 %	38505856
526	NC_005232	CCA	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505856
527	NC_005232	GGGGT	2	10	30422	30431	0 %	20 %	80 %	0 %	38505856
528	NC_005232	ATT	2	6	30485	30490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505856
529	NC_005232	GTA	2	6	30580	30585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505856
530	NC_005232	ACC	2	6	30703	30708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505856
531	NC_005232	GTC	2	6	30742	30747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505856
532	NC_005232	CCAT	2	8	30817	30824	25 %	25 %	0 %	50 %	38505856
533	NC_005232	C	6	6	30886	30891	0 %	0 %	0 %	100 %	38505856
534	NC_005232	CAC	2	6	30953	30958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505856
535	NC_005232	GTC	2	6	30991	30996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505856
536	NC_005232	AACTG	2	10	31067	31076	40 %	20 %	20 %	20 %	38505856
537	NC_005232	GGA	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505856
538	NC_005232	GCC	2	6	31130	31135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505856
539	NC_005232	GTG	2	6	31185	31190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505856
540	NC_005232	CTA	2	6	31264	31269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505856
541	NC_005232	ACAA	2	8	31452	31459	75 %	0 %	0 %	25 %	38505857
542	NC_005232	TTG	2	6	31466	31471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505857
543	NC_005232	TCC	2	6	31496	31501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505857
544	NC_005232	CAC	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505857
545	NC_005232	CGC	2	6	31556	31561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505857
546	NC_005232	TAC	2	6	31649	31654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505858
547	NC_005232	AGAA	2	8	31745	31752	75 %	0 %	25 %	0 %	38505858
548	NC_005232	GGCAA	2	10	31784	31793	40 %	0 %	40 %	20 %	38505858
549	NC_005232	TTG	2	6	32140	32145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505859
550	NC_005232	T	6	6	32206	32211	0 %	100 %	0 %	0 %	38505859
551	NC_005232	GGC	2	6	32218	32223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505859
552	NC_005232	TTG	3	9	32247	32255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505859
553	NC_005232	CCT	2	6	32274	32279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505859
554	NC_005232	TGGTT	2	10	32305	32314	0 %	60 %	40 %	0 %	38505859
555	NC_005232	GTC	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505859
556	NC_005232	TTG	2	6	32414	32419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505859
557	NC_005232	ATT	2	6	32479	32484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505859
558	NC_005232	TGG	2	6	32521	32526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505859
559	NC_005232	T	6	6	32716	32721	0 %	100 %	0 %	0 %	38505860
560	NC_005232	GTTT	2	8	32853	32860	0 %	75 %	25 %	0 %	38505860
561	NC_005232	CAA	2	6	32907	32912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505861
562	NC_005232	TCAC	2	8	32963	32970	25 %	25 %	0 %	50 %	38505861
563	NC_005232	ACA	3	9	32978	32986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505861
564	NC_005232	GTG	2	6	33056	33061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505861
565	NC_005232	AAT	2	6	33106	33111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505861
566	NC_005232	CATC	2	8	33224	33231	25 %	25 %	0 %	50 %	38505861
567	NC_005232	TCTTCA	2	12	33248	33259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	38505861
568	NC_005232	GGC	2	6	33310	33315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505861
569	NC_005232	ACC	2	6	33329	33334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505861
570	NC_005232	CCCA	2	8	33360	33367	25 %	0 %	0 %	75 %	38505861
571	NC_005232	GA	3	6	33431	33436	50 %	0 %	50 %	0 %	38505861
572	NC_005232	CTG	2	6	33441	33446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505861
573	NC_005232	TAA	2	6	33486	33491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505861
574	NC_005232	TTGA	2	8	33943	33950	25 %	50 %	25 %	0 %	38505862
575	NC_005232	GCG	2	6	33952	33957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505862
576	NC_005232	GAAG	2	8	33987	33994	50 %	0 %	50 %	0 %	38505862
577	NC_005232	TTG	2	6	34012	34017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505862
578	NC_005232	GCG	3	9	34027	34035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505862
579	NC_005232	AAC	2	6	34062	34067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505862
580	NC_005232	CTGAA	2	10	34082	34091	40 %	20 %	20 %	20 %	38505862
581	NC_005232	AGA	2	6	34098	34103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505862
582	NC_005232	TGG	2	6	34136	34141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505862
583	NC_005232	GTC	2	6	34199	34204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505862
584	NC_005232	GGT	2	6	34212	34217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505862
585	NC_005232	TTG	2	6	34225	34230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505862
586	NC_005232	AGA	2	6	34260	34265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505862
587	NC_005232	ATA	2	6	34276	34281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505862
588	NC_005232	TGA	2	6	34373	34378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505863
589	NC_005232	GGGGA	2	10	34480	34489	20 %	0 %	80 %	0 %	38505863
590	NC_005232	AGG	2	6	34502	34507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505863
591	NC_005232	TCA	2	6	34533	34538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505863
592	NC_005232	TAA	2	6	34557	34562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505863
593	NC_005232	ACC	2	6	34610	34615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505863
594	NC_005232	AT	3	6	34802	34807	50 %	50 %	0 %	0 %	38505864
595	NC_005232	ACT	2	6	34819	34824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505864
596	NC_005232	CAAT	2	8	34864	34871	50 %	25 %	0 %	25 %	38505864
597	NC_005232	GAT	2	6	34882	34887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505864
598	NC_005232	CAA	2	6	34892	34897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505864
599	NC_005232	CATGCA	2	12	34900	34911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38505864
600	NC_005232	ATG	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505864
601	NC_005232	CCA	2	6	34948	34953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505864
602	NC_005232	ATG	2	6	35123	35128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505864
603	NC_005232	ATG	2	6	35150	35155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505864
604	NC_005232	GAT	2	6	35215	35220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505864
605	NC_005232	CCA	2	6	35224	35229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505864
606	NC_005232	TGA	2	6	35241	35246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505864
607	NC_005232	GATG	2	8	35296	35303	25 %	25 %	50 %	0 %	38505864
608	NC_005232	TTG	2	6	35387	35392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505865
609	NC_005232	TGG	2	6	35394	35399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505865
610	NC_005232	GCTA	2	8	35524	35531	25 %	25 %	25 %	25 %	38505865
611	NC_005232	GAT	2	6	35672	35677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505865
612	NC_005232	TTAA	2	8	35681	35688	50 %	50 %	0 %	0 %	38505865
613	NC_005232	CAG	2	6	35759	35764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505865
614	NC_005232	GATTA	2	10	35784	35793	40 %	40 %	20 %	0 %	38505865
615	NC_005232	GTA	2	6	35807	35812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505865
616	NC_005232	CAA	2	6	35885	35890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505865
617	NC_005232	AGT	2	6	35897	35902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505865
618	NC_005232	CGG	2	6	35934	35939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505865
619	NC_005232	CCA	2	6	35943	35948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505865
620	NC_005232	TGT	2	6	35953	35958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505865
621	NC_005232	ATT	2	6	36080	36085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505866
622	NC_005232	TTA	2	6	36113	36118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505866
623	NC_005232	ATG	2	6	36235	36240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505866
624	NC_005232	ACA	2	6	36257	36262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505866
625	NC_005232	TAT	2	6	36381	36386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505866
626	NC_005232	ATT	2	6	36413	36418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505866
627	NC_005232	ACC	2	6	36465	36470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505866
628	NC_005232	ACC	2	6	36534	36539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505866
629	NC_005232	TGG	2	6	36580	36585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505866
630	NC_005232	CAT	2	6	36594	36599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505866
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