MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005231	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505776
2	NC_005231	TTG	2	6	1992	1997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505776
3	NC_005231	AGT	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505776
4	NC_005231	TGA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505776
5	NC_005231	ATC	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505776
6	NC_005231	TGA	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505776
7	NC_005231	TCT	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505776
8	NC_005231	TCC	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505777
9	NC_005231	CCA	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505777
10	NC_005231	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505777
11	NC_005231	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505777
12	NC_005231	AAT	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505777
13	NC_005231	TCC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505777
14	NC_005231	ACA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505777
15	NC_005231	CCG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505777
16	NC_005231	CGC	2	6	3526	3531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505777
17	NC_005231	CAC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505777
18	NC_005231	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505777
19	NC_005231	TTC	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505777
20	NC_005231	TTC	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505778
21	NC_005231	TCT	3	9	3793	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505778
22	NC_005231	CCT	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505779
23	NC_005231	TAA	2	6	3856	3861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505779
24	NC_005231	TCA	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505779
25	NC_005231	CGG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505779
26	NC_005231	CGG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505779
27	NC_005231	ATG	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505779
28	NC_005231	TAG	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505779
29	NC_005231	GAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505779
30	NC_005231	AGA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505779
31	NC_005231	GCG	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505779
32	NC_005231	TTC	2	6	4289	4294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505779
33	NC_005231	GGT	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505779
34	NC_005231	GAT	3	9	4331	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505779
35	NC_005231	CAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505780
36	NC_005231	TCC	3	9	4659	4667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505781
37	NC_005231	TCA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505781
38	NC_005231	CCA	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505781
39	NC_005231	AGG	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505781
40	NC_005231	TCT	2	6	4719	4724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505781
41	NC_005231	TGT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
42	NC_005231	TGG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505781
43	NC_005231	AAT	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
44	NC_005231	AAC	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505781
45	NC_005231	TGA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505781
46	NC_005231	AGT	2	6	5460	5465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505781
47	NC_005231	GCC	2	6	5473	5478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505781
48	NC_005231	TTG	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
49	NC_005231	TTG	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
50	NC_005231	TTG	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505781
51	NC_005231	TGG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505781
52	NC_005231	AGA	2	6	5565	5570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505781
53	NC_005231	TAA	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
54	NC_005231	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505781
55	NC_005231	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
56	NC_005231	TAA	2	6	5791	5796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505781
57	NC_005231	GGT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505781
58	NC_005231	CAA	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505782
59	NC_005231	CTG	2	6	6211	6216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505782
60	NC_005231	CCT	2	6	6258	6263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505782
61	NC_005231	TCA	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505782
62	NC_005231	CAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505782
63	NC_005231	TCA	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505782
64	NC_005231	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505783
65	NC_005231	CAA	2	6	6663	6668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505784
66	NC_005231	CAA	2	6	6676	6681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505784
67	NC_005231	TCC	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
68	NC_005231	AAC	2	6	6875	6880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505784
69	NC_005231	CCA	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505784
70	NC_005231	GCC	2	6	6940	6945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505784
71	NC_005231	CTT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
72	NC_005231	TCT	2	6	7002	7007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
73	NC_005231	CTT	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
74	NC_005231	CGG	2	6	7065	7070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505784
75	NC_005231	ACC	2	6	7190	7195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505784
76	NC_005231	TTC	2	6	7238	7243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505784
77	NC_005231	CTC	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
78	NC_005231	AGA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505784
79	NC_005231	GCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505784
80	NC_005231	GAC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505784
81	NC_005231	ATC	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505784
82	NC_005231	AGG	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505784
83	NC_005231	CAG	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505784
84	NC_005231	CCT	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
85	NC_005231	CCT	2	6	7860	7865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
86	NC_005231	CTC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505784
87	NC_005231	GTT	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505784
88	NC_005231	GCG	2	6	8068	8073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505784
89	NC_005231	GAC	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505785
90	NC_005231	TGT	3	9	8595	8603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505785
91	NC_005231	CAG	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505786
92	NC_005231	GGC	2	6	8921	8926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505786
93	NC_005231	ATA	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505786
94	NC_005231	GTG	2	6	9041	9046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505786
95	NC_005231	TAA	2	6	9138	9143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505786
96	NC_005231	CTG	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505786
97	NC_005231	CCA	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505786
98	NC_005231	GAC	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505787
99	NC_005231	CTG	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505787
100	NC_005231	TTC	2	6	9508	9513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505787
101	NC_005231	GGT	2	6	9526	9531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505787
102	NC_005231	ACT	2	6	9608	9613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505787
103	NC_005231	CCG	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505788
104	NC_005231	GAA	2	6	10011	10016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505789
105	NC_005231	GAA	2	6	10032	10037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505789
106	NC_005231	ACA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505789
107	NC_005231	CAT	2	6	10097	10102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505789
108	NC_005231	ACT	2	6	10148	10153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505789
109	NC_005231	TTG	2	6	10300	10305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505789
110	NC_005231	TAG	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505789
111	NC_005231	AGG	2	6	10427	10432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505790
112	NC_005231	AAT	2	6	10542	10547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505790
113	NC_005231	CAA	2	6	10603	10608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505790
114	NC_005231	TGG	2	6	10687	10692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505790
115	NC_005231	CAG	2	6	10741	10746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505790
116	NC_005231	GCG	2	6	10767	10772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505790
117	NC_005231	AGA	2	6	10829	10834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505790
118	NC_005231	GCA	3	9	10896	10904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505790
119	NC_005231	ACA	2	6	10979	10984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505790
120	NC_005231	AGC	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505791
121	NC_005231	GAA	2	6	11064	11069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505791
122	NC_005231	ACA	2	6	11081	11086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505791
123	NC_005231	GGA	2	6	11247	11252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505791
124	NC_005231	AGC	2	6	11261	11266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505791
125	NC_005231	AGG	2	6	11455	11460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505791
126	NC_005231	AGA	2	6	11576	11581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505791
127	NC_005231	CAG	2	6	11586	11591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505791
128	NC_005231	AGG	2	6	12635	12640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505792
129	NC_005231	AAG	2	6	12800	12805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505792
130	NC_005231	CAA	2	6	12911	12916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505792
131	NC_005231	GTA	2	6	13038	13043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505792
132	NC_005231	AGG	2	6	13697	13702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505793
133	NC_005231	ATG	2	6	13885	13890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505793
134	NC_005231	TTG	2	6	13993	13998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505793
135	NC_005231	CTG	2	6	14003	14008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505793
136	NC_005231	AGC	2	6	14208	14213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505793
137	NC_005231	TGG	2	6	14242	14247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505793
138	NC_005231	GAT	2	6	14296	14301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505793
139	NC_005231	TGG	2	6	14303	14308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505793
140	NC_005231	CTT	2	6	14355	14360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505793
141	NC_005231	CTT	2	6	14363	14368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505793
142	NC_005231	CTC	2	6	14376	14381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505793
143	NC_005231	AAC	2	6	14431	14436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505793
144	NC_005231	CAT	2	6	14474	14479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505793
145	NC_005231	TCT	2	6	14974	14979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505793
146	NC_005231	ACC	2	6	15283	15288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505793
147	NC_005231	TCT	2	6	15864	15869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505794
148	NC_005231	CGA	2	6	15905	15910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505794
149	NC_005231	GAT	2	6	15945	15950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505794
150	NC_005231	TCG	2	6	16017	16022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505794
151	NC_005231	ATG	2	6	16029	16034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505794
152	NC_005231	GGA	2	6	16056	16061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505794
153	NC_005231	GAT	2	6	16141	16146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505794
154	NC_005231	CAA	2	6	16157	16162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505794
155	NC_005231	CTT	2	6	16249	16254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505794
156	NC_005231	TAC	2	6	16399	16404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505794
157	NC_005231	TTG	2	6	16436	16441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505794
158	NC_005231	CTG	2	6	16459	16464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505794
159	NC_005231	GCA	2	6	16537	16542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505794
160	NC_005231	TTC	2	6	16697	16702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505794
161	NC_005231	TGC	2	6	16703	16708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505794
162	NC_005231	GGA	2	6	16982	16987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505794
163	NC_005231	CTT	2	6	17017	17022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505794
164	NC_005231	ACT	2	6	17078	17083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505794
165	NC_005231	GTT	2	6	17112	17117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505794
166	NC_005231	GCT	2	6	17779	17784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505795
167	NC_005231	GTA	2	6	17837	17842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505795
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172	NC_005231	GCC	2	6	18682	18687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505796
173	NC_005231	GGT	2	6	18735	18740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505796
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184	NC_005231	CCT	2	6	20082	20087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505798
185	NC_005231	TCA	2	6	20170	20175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505798
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187	NC_005231	GCC	2	6	20493	20498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505798
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192	NC_005231	AGA	2	6	20948	20953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505798
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227	NC_005231	TGG	2	6	25469	25474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505805
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239	NC_005231	TGG	2	6	26585	26590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505805
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245	NC_005231	TAA	2	6	27012	27017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505805
246	NC_005231	ACC	2	6	27205	27210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505805
247	NC_005231	CAG	2	6	27293	27298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505805
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249	NC_005231	ATT	2	6	27352	27357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505806
250	NC_005231	TGA	2	6	27358	27363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505806
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252	NC_005231	TGA	2	6	27529	27534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505806
253	NC_005231	CGG	2	6	27560	27565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505806
254	NC_005231	ATC	2	6	27756	27761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505806
255	NC_005231	GCC	2	6	27831	27836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505806
256	NC_005231	AGC	2	6	27850	27855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505806
257	NC_005231	CAT	2	6	27869	27874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505806
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259	NC_005231	TGG	2	6	28003	28008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505806
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.