MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505669
2	NC_005230	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505669
3	NC_005230	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
4	NC_005230	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
5	NC_005230	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505669
6	NC_005230	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505669
7	NC_005230	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505669
8	NC_005230	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505670
9	NC_005230	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505670
10	NC_005230	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
11	NC_005230	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
12	NC_005230	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505670
13	NC_005230	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
14	NC_005230	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
15	NC_005230	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505670
16	NC_005230	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
17	NC_005230	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505671
18	NC_005230	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505671
19	NC_005230	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505671
20	NC_005230	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505671
21	NC_005230	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505671
22	NC_005230	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505671
23	NC_005230	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505672
24	NC_005230	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505672
25	NC_005230	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505673
26	NC_005230	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
27	NC_005230	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
28	NC_005230	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
29	NC_005230	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
30	NC_005230	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
31	NC_005230	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
32	NC_005230	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505674
33	NC_005230	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
34	NC_005230	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
35	NC_005230	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505674
36	NC_005230	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
37	NC_005230	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505674
38	NC_005230	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
39	NC_005230	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505675
40	NC_005230	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
41	NC_005230	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505675
42	NC_005230	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
43	NC_005230	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505675
44	NC_005230	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505675
45	NC_005230	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
46	NC_005230	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
47	NC_005230	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
48	NC_005230	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
49	NC_005230	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505676
50	NC_005230	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
51	NC_005230	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
52	NC_005230	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
53	NC_005230	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
54	NC_005230	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
55	NC_005230	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505676
56	NC_005230	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
57	NC_005230	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505677
58	NC_005230	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505677
59	NC_005230	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505677
60	NC_005230	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505677
61	NC_005230	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505677
62	NC_005230	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505677
63	NC_005230	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505677
64	NC_005230	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
65	NC_005230	TAG	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
66	NC_005230	CAG	3	9	6700	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505678
67	NC_005230	ATC	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505678
68	NC_005230	ATT	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505678
69	NC_005230	TGA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
70	NC_005230	GCG	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505678
71	NC_005230	ATT	2	6	7297	7302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505678
72	NC_005230	AGT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
73	NC_005230	GTC	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505678
74	NC_005230	AGA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505678
75	NC_005230	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
76	NC_005230	TGG	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505678
77	NC_005230	TCT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505678
78	NC_005230	AGC	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505678
79	NC_005230	AGA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505678
80	NC_005230	GTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505678
81	NC_005230	AAT	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505678
82	NC_005230	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
83	NC_005230	CCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
84	NC_005230	ACA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
85	NC_005230	CTT	2	6	8540	8545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505679
86	NC_005230	GAA	2	6	8627	8632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
87	NC_005230	GGT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505679
88	NC_005230	AAC	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
89	NC_005230	ATA	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505679
90	NC_005230	ACA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
91	NC_005230	ATC	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505679
92	NC_005230	CTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505679
93	NC_005230	ACC	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505679
94	NC_005230	ACA	2	6	9281	9286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
95	NC_005230	CTG	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505679
96	NC_005230	TTA	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505679
97	NC_005230	CAA	2	6	9595	9600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
98	NC_005230	GGA	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
99	NC_005230	GAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
100	NC_005230	AAC	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
101	NC_005230	TAA	2	6	10195	10200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505679
102	NC_005230	AGG	2	6	10210	10215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
103	NC_005230	CAA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
104	NC_005230	AGT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505679
105	NC_005230	CAA	3	9	10435	10443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
106	NC_005230	AGA	2	6	10528	10533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
107	NC_005230	TTG	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505679
108	NC_005230	GCC	2	6	10823	10828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505679
109	NC_005230	GTA	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505679
110	NC_005230	TCC	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505679
111	NC_005230	AGG	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
112	NC_005230	GAG	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
113	NC_005230	ATT	2	6	11246	11251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505679
114	NC_005230	TCC	2	6	11370	11375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505679
115	NC_005230	AAC	2	6	11379	11384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
116	NC_005230	CAA	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
117	NC_005230	CTT	2	6	11555	11560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505680
118	NC_005230	AAG	2	6	12383	12388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505680
119	NC_005230	ATG	2	6	12407	12412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505680
120	NC_005230	CAA	2	6	12445	12450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505680
121	NC_005230	TGG	2	6	12486	12491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505680
122	NC_005230	AAG	3	9	12493	12501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505680
123	NC_005230	ATT	2	6	12809	12814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505681
124	NC_005230	GCT	2	6	12968	12973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505681
125	NC_005230	TAT	2	6	12983	12988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505681
126	NC_005230	TGG	2	6	13006	13011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505681
127	NC_005230	TCT	2	6	13145	13150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505681
128	NC_005230	ATC	2	6	13221	13226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505681
129	NC_005230	CAA	2	6	13256	13261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505681
130	NC_005230	GTT	2	6	13280	13285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505681
131	NC_005230	ATT	2	6	13329	13334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505681
132	NC_005230	ACG	2	6	13385	13390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505681
133	NC_005230	TGA	2	6	13446	13451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505682
134	NC_005230	GTT	2	6	13471	13476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505682
135	NC_005230	GCA	2	6	13489	13494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505682
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137	NC_005230	CGT	2	6	13639	13644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505682
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140	NC_005230	TTA	2	6	13717	13722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505682
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166	NC_005230	GTG	2	6	15530	15535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505684
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