MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505669
2	NC_005230	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505669
3	NC_005230	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
4	NC_005230	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
5	NC_005230	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	38505669
6	NC_005230	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505669
7	NC_005230	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505669
8	NC_005230	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505669
9	NC_005230	CA	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	38505669
10	NC_005230	T	6	6	715	720	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
11	NC_005230	CCATC	2	10	761	770	20 %	20 %	0 %	60 %	38505670
12	NC_005230	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505670
13	NC_005230	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505670
14	NC_005230	TTTTA	2	10	937	946	20 %	80 %	0 %	0 %	38505670
15	NC_005230	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
16	NC_005230	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
17	NC_005230	TCTT	2	8	1024	1031	0 %	75 %	0 %	25 %	38505670
18	NC_005230	AT	3	6	1133	1138	50 %	50 %	0 %	0 %	38505670
19	NC_005230	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505670
20	NC_005230	T	6	6	1168	1173	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
21	NC_005230	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
22	NC_005230	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
23	NC_005230	CTTC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	38505670
24	NC_005230	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505670
25	NC_005230	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
26	NC_005230	T	6	6	1248	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
27	NC_005230	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505671
28	NC_005230	CAAA	2	8	1426	1433	75 %	0 %	0 %	25 %	38505671
29	NC_005230	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505671
30	NC_005230	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505671
31	NC_005230	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505671
32	NC_005230	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505671
33	NC_005230	A	6	6	1735	1740	100 %	0 %	0 %	0 %	38505671
34	NC_005230	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505671
35	NC_005230	ATCA	2	8	1798	1805	50 %	25 %	0 %	25 %	38505671
36	NC_005230	CCCG	2	8	1968	1975	0 %	0 %	25 %	75 %	38505672
37	NC_005230	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505672
38	NC_005230	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505672
39	NC_005230	AATTA	2	10	2018	2027	60 %	40 %	0 %	0 %	38505672
40	NC_005230	TGAA	2	8	2396	2403	50 %	25 %	25 %	0 %	38505673
41	NC_005230	GGCA	2	8	2418	2425	25 %	0 %	50 %	25 %	38505673
42	NC_005230	CCTGG	2	10	2545	2554	0 %	20 %	40 %	40 %	38505673
43	NC_005230	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505673
44	NC_005230	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	38505673
45	NC_005230	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
46	NC_005230	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
47	NC_005230	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
48	NC_005230	G	6	6	2790	2795	0 %	0 %	100 %	0 %	38505673
49	NC_005230	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
50	NC_005230	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
51	NC_005230	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
52	NC_005230	T	6	6	3058	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	38505674
53	NC_005230	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505674
54	NC_005230	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
55	NC_005230	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
56	NC_005230	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505674
57	NC_005230	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
58	NC_005230	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	38505674
59	NC_005230	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505674
60	NC_005230	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
61	NC_005230	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505675
62	NC_005230	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
63	NC_005230	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505675
64	NC_005230	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
65	NC_005230	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505675
66	NC_005230	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505675
67	NC_005230	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
68	NC_005230	TATC	2	8	4274	4281	25 %	50 %	0 %	25 %	38505676
69	NC_005230	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
70	NC_005230	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
71	NC_005230	AT	3	6	4419	4424	50 %	50 %	0 %	0 %	38505676
72	NC_005230	GCAA	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	38505676
73	NC_005230	A	7	7	4445	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
74	NC_005230	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
75	NC_005230	A	6	6	4489	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
76	NC_005230	AGGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
77	NC_005230	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505676
78	NC_005230	G	6	6	4648	4653	0 %	0 %	100 %	0 %	38505676
79	NC_005230	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
80	NC_005230	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
81	NC_005230	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
82	NC_005230	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
83	NC_005230	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
84	NC_005230	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
85	NC_005230	A	7	7	5003	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
86	NC_005230	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
87	NC_005230	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505676
88	NC_005230	TG	3	6	5205	5210	0 %	50 %	50 %	0 %	38505676
89	NC_005230	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
90	NC_005230	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
91	NC_005230	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505677
92	NC_005230	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505677
93	NC_005230	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505677
94	NC_005230	TTTCAA	2	12	5474	5485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505677
95	NC_005230	ATTA	2	8	5508	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	38505677
96	NC_005230	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505677
97	NC_005230	G	6	6	5890	5895	0 %	0 %	100 %	0 %	38505677
98	NC_005230	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505677
99	NC_005230	TAAA	2	8	6006	6013	75 %	25 %	0 %	0 %	38505677
100	NC_005230	GA	3	6	6034	6039	50 %	0 %	50 %	0 %	38505677
101	NC_005230	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505677
102	NC_005230	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505677
103	NC_005230	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	38505678
104	NC_005230	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
105	NC_005230	CTGC	2	8	6613	6620	0 %	25 %	25 %	50 %	38505678
106	NC_005230	TAG	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
107	NC_005230	CAG	3	9	6700	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505678
108	NC_005230	ATC	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505678
109	NC_005230	ATT	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505678
110	NC_005230	TGA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
111	NC_005230	GCG	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505678
112	NC_005230	AG	3	6	7092	7097	50 %	0 %	50 %	0 %	38505678
113	NC_005230	A	6	6	7101	7106	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
114	NC_005230	A	7	7	7277	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
115	NC_005230	ATT	2	6	7297	7302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505678
116	NC_005230	AGT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
117	NC_005230	GTC	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505678
118	NC_005230	AGA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505678
119	NC_005230	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
120	NC_005230	A	6	6	7733	7738	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
121	NC_005230	A	6	6	7862	7867	100 %	0 %	0 %	0 %	38505678
122	NC_005230	TGG	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505678
123	NC_005230	TCT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505678
124	NC_005230	AGC	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505678
125	NC_005230	AGA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505678
126	NC_005230	T	6	6	8183	8188	0 %	100 %	0 %	0 %	38505678
127	NC_005230	GTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505678
128	NC_005230	CAAT	2	8	8312	8319	50 %	25 %	0 %	25 %	38505678
129	NC_005230	AAT	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505678
130	NC_005230	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
131	NC_005230	CCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
132	NC_005230	T	6	6	8510	8515	0 %	100 %	0 %	0 %	38505678
133	NC_005230	ACA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
134	NC_005230	CTT	2	6	8540	8545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505679
135	NC_005230	GAA	2	6	8627	8632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
136	NC_005230	GGT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505679
137	NC_005230	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	38505679
138	NC_005230	A	7	7	8743	8749	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
139	NC_005230	AAC	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
140	NC_005230	AGAATT	2	12	8812	8823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	38505679
141	NC_005230	ATA	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505679
142	NC_005230	AT	3	6	8946	8951	50 %	50 %	0 %	0 %	38505679
143	NC_005230	ACA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
144	NC_005230	AATTT	2	10	9062	9071	40 %	60 %	0 %	0 %	38505679
145	NC_005230	ATC	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505679
146	NC_005230	TACT	2	8	9144	9151	25 %	50 %	0 %	25 %	38505679
147	NC_005230	CTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505679
148	NC_005230	A	6	6	9249	9254	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
149	NC_005230	ACC	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505679
150	NC_005230	ACA	2	6	9281	9286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
151	NC_005230	ATTT	2	8	9377	9384	25 %	75 %	0 %	0 %	38505679
152	NC_005230	GAAAT	2	10	9414	9423	60 %	20 %	20 %	0 %	38505679
153	NC_005230	A	7	7	9464	9470	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
154	NC_005230	CTG	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505679
155	NC_005230	TTA	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505679
156	NC_005230	CAA	2	6	9595	9600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
157	NC_005230	GGA	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
158	NC_005230	GAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505679
159	NC_005230	CAAAA	2	10	10090	10099	80 %	0 %	0 %	20 %	38505679
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161	NC_005230	AAC	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
162	NC_005230	TAA	2	6	10195	10200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505679
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165	NC_005230	CAA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505679
166	NC_005230	TATC	2	8	10324	10331	25 %	50 %	0 %	25 %	38505679
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175	NC_005230	AGG	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
176	NC_005230	T	6	6	10995	11000	0 %	100 %	0 %	0 %	38505679
177	NC_005230	A	6	6	11089	11094	100 %	0 %	0 %	0 %	38505679
178	NC_005230	GAG	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505679
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267	NC_005230	TTG	2	6	15725	15730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505684
268	NC_005230	AGG	2	6	15744	15749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505684
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271	NC_005230	ATG	2	6	15832	15837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505685
272	NC_005230	TAA	2	6	15857	15862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505685
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397	NC_005230	TTG	2	6	25304	25309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505695
398	NC_005230	CTTT	2	8	25355	25362	0 %	75 %	0 %	25 %	38505695
399	NC_005230	ACC	2	6	25505	25510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505695
400	NC_005230	ACC	2	6	26368	26373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505696
401	NC_005230	TAC	2	6	26415	26420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505696
402	NC_005230	TGG	2	6	26436	26441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505696
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404	NC_005230	A	6	6	26529	26534	100 %	0 %	0 %	0 %	38505696
405	NC_005230	C	6	6	26557	26562	0 %	0 %	0 %	100 %	38505696
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425	NC_005230	ATC	2	6	27597	27602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505696
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433	NC_005230	TGG	2	6	27987	27992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505697
434	NC_005230	GGAA	2	8	28072	28079	50 %	0 %	50 %	0 %	38505697
435	NC_005230	A	6	6	28164	28169	100 %	0 %	0 %	0 %	38505697
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442	NC_005230	AATT	2	8	28985	28992	50 %	50 %	0 %	0 %	38505698
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470	NC_005230	CAT	2	6	31156	31161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505702
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472	NC_005230	CAC	3	9	31228	31236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505702
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474	NC_005230	CAATC	2	10	31829	31838	40 %	20 %	0 %	40 %	38505703
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500	NC_005230	TTACC	2	10	33745	33754	20 %	40 %	0 %	40 %	38505705

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