MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005230	GGAATT	2	12	33759	33770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505705
502	NC_005230	TG	3	6	33800	33805	0 %	50 %	50 %	0 %	38505705
503	NC_005230	CAAGC	2	10	33823	33832	40 %	0 %	20 %	40 %	38505705
504	NC_005230	CAG	2	6	34203	34208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505705
505	NC_005230	AAC	2	6	34233	34238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505705
506	NC_005230	CAT	2	6	34341	34346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505705
507	NC_005230	TCT	2	6	34427	34432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505705
508	NC_005230	CTGT	2	8	34463	34470	0 %	50 %	25 %	25 %	38505705
509	NC_005230	A	6	6	34519	34524	100 %	0 %	0 %	0 %	38505705
510	NC_005230	CCA	2	6	34553	34558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505705
511	NC_005230	CTCC	2	8	34605	34612	0 %	25 %	0 %	75 %	38505705
512	NC_005230	A	6	6	34711	34716	100 %	0 %	0 %	0 %	38505705
513	NC_005230	TC	3	6	34764	34769	0 %	50 %	0 %	50 %	38505705
514	NC_005230	CGA	2	6	34782	34787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505705
515	NC_005230	CGC	3	9	34857	34865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505705
516	NC_005230	C	6	6	34865	34870	0 %	0 %	0 %	100 %	38505705
517	NC_005230	GAT	2	6	34876	34881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505705
518	NC_005230	CAG	2	6	34899	34904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505705
519	NC_005230	A	6	6	34943	34948	100 %	0 %	0 %	0 %	38505705
520	NC_005230	CGA	2	6	34974	34979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505705
521	NC_005230	CTA	2	6	35040	35045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505705
522	NC_005230	CAAA	2	8	35106	35113	75 %	0 %	0 %	25 %	38505705
523	NC_005230	TGA	2	6	35265	35270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505705
524	NC_005230	TCAA	2	8	35285	35292	50 %	25 %	0 %	25 %	38505705
525	NC_005230	C	6	6	35425	35430	0 %	0 %	0 %	100 %	38505705
526	NC_005230	GAC	2	6	35431	35436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505705
527	NC_005230	CTT	2	6	35501	35506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505705
528	NC_005230	CTT	2	6	36085	36090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505706
529	NC_005230	GGC	2	6	36095	36100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505706
530	NC_005230	CGG	2	6	36142	36147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505706
531	NC_005230	ATTGA	2	10	36177	36186	40 %	40 %	20 %	0 %	38505706
532	NC_005230	ATTGG	2	10	36228	36237	20 %	40 %	40 %	0 %	38505707
533	NC_005230	CGC	2	6	36248	36253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505707
534	NC_005230	CAA	2	6	36258	36263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505707
535	NC_005230	AAT	2	6	36264	36269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505707
536	NC_005230	CTG	2	6	36282	36287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505707
537	NC_005230	ACCCC	2	10	36337	36346	20 %	0 %	0 %	80 %	38505707
538	NC_005230	CGAATA	2	12	36388	36399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	38505707
539	NC_005230	ATC	2	6	36475	36480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505707
540	NC_005230	TGA	2	6	36674	36679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505708
541	NC_005230	GGT	2	6	36686	36691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505708
542	NC_005230	TGG	2	6	36697	36702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505708
543	NC_005230	TGA	2	6	36718	36723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505708
544	NC_005230	G	6	6	36876	36881	0 %	0 %	100 %	0 %	38505709
545	NC_005230	CCCA	2	8	36905	36912	25 %	0 %	0 %	75 %	38505709
546	NC_005230	TAA	2	6	36970	36975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505709
547	NC_005230	GTTG	2	8	37039	37046	0 %	50 %	50 %	0 %	38505709
548	NC_005230	TCCT	2	8	37047	37054	0 %	50 %	0 %	50 %	38505709
549	NC_005230	TGG	2	6	37121	37126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505709
550	NC_005230	ATT	2	6	37190	37195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505709
551	NC_005230	GTA	2	6	37335	37340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505710
552	NC_005230	GAA	2	6	37380	37385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505710
553	NC_005230	TCC	2	6	37391	37396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505710
554	NC_005230	AAT	2	6	37450	37455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505710
555	NC_005230	CAA	2	6	37586	37591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505711
556	NC_005230	C	9	9	37616	37624	0 %	0 %	0 %	100 %	38505711
557	NC_005230	T	6	6	37689	37694	0 %	100 %	0 %	0 %	38505711
558	NC_005230	TTC	2	6	37707	37712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505711
559	NC_005230	AT	3	6	37819	37824	50 %	50 %	0 %	0 %	38505711
560	NC_005230	GTAA	2	8	37893	37900	50 %	25 %	25 %	0 %	38505711
561	NC_005230	TGT	2	6	37903	37908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505711
562	NC_005230	AAC	2	6	37918	37923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505711
563	NC_005230	AGC	2	6	37986	37991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505711
564	NC_005230	TCC	2	6	38002	38007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505711
565	NC_005230	TTTC	2	8	38039	38046	0 %	75 %	0 %	25 %	38505711
566	NC_005230	CTG	2	6	38085	38090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505711
567	NC_005230	GAC	2	6	38095	38100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505711
568	NC_005230	T	6	6	38127	38132	0 %	100 %	0 %	0 %	38505711
569	NC_005230	CAG	2	6	38205	38210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505712
570	NC_005230	ACC	2	6	38226	38231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505712
571	NC_005230	TTG	2	6	38349	38354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505712
572	NC_005230	GC	3	6	38371	38376	0 %	0 %	50 %	50 %	38505712
573	NC_005230	TGGC	2	8	38388	38395	0 %	25 %	50 %	25 %	38505712
574	NC_005230	CAA	2	6	38496	38501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505712
575	NC_005230	AAC	2	6	38595	38600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505712
576	NC_005230	GGC	2	6	38656	38661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505712
577	NC_005230	CTC	2	6	38679	38684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505712
578	NC_005230	C	6	6	40050	40055	0 %	0 %	0 %	100 %	38505713
579	NC_005230	CAT	2	6	40072	40077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505713
580	NC_005230	CTT	2	6	40167	40172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505713
581	NC_005230	CTT	2	6	40186	40191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505713
582	NC_005230	AG	3	6	40217	40222	50 %	0 %	50 %	0 %	38505713
583	NC_005230	AGC	2	6	40226	40231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505713
584	NC_005230	CATT	2	8	40242	40249	25 %	50 %	0 %	25 %	38505714
585	NC_005230	CAA	2	6	40271	40276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505714
586	NC_005230	CTC	2	6	40293	40298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505714
587	NC_005230	CCAA	2	8	40345	40352	50 %	0 %	0 %	50 %	38505714
588	NC_005230	CAA	2	6	40455	40460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505714
589	NC_005230	AGGT	2	8	40495	40502	25 %	25 %	50 %	0 %	38505714
590	NC_005230	CACAGA	2	12	40704	40715	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	38505715
591	NC_005230	GA	3	6	40714	40719	50 %	0 %	50 %	0 %	38505715
592	NC_005230	CAC	2	6	40736	40741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505715
593	NC_005230	CAA	2	6	40762	40767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505715
594	NC_005230	CAG	2	6	41009	41014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505715
595	NC_005230	CCG	2	6	41020	41025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505715
596	NC_005230	GTA	2	6	41027	41032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505715
597	NC_005230	CCG	2	6	41056	41061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505715
598	NC_005230	A	6	6	41075	41080	100 %	0 %	0 %	0 %	38505715
599	NC_005230	AGG	2	6	41118	41123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505715
600	NC_005230	CGG	2	6	41221	41226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505715
601	NC_005230	TGAT	2	8	41251	41258	25 %	50 %	25 %	0 %	38505715
602	NC_005230	TGAC	2	8	41422	41429	25 %	25 %	25 %	25 %	38505716
603	NC_005230	TAT	2	6	41464	41469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505716
604	NC_005230	AGA	2	6	41474	41479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505716
605	NC_005230	AAT	2	6	41530	41535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505716
606	NC_005230	CCG	2	6	41568	41573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505716
607	NC_005230	AGCA	2	8	41632	41639	50 %	0 %	25 %	25 %	38505716
608	NC_005230	CTA	2	6	41914	41919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505717
609	NC_005230	TAG	2	6	42029	42034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505717
610	NC_005230	TGA	2	6	42077	42082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505717
611	NC_005230	TCG	2	6	42083	42088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505717
612	NC_005230	TTC	2	6	42175	42180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505717
613	NC_005230	CGC	2	6	42189	42194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505717
614	NC_005230	GCGAGG	2	12	42253	42264	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	38505717
615	NC_005230	GAA	2	6	42330	42335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505717
616	NC_005230	AAG	2	6	42425	42430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505717
617	NC_005230	CTC	2	6	43074	43079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505718
618	NC_005230	TGGCAG	2	12	43129	43140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	38505718
619	NC_005230	CAAGC	2	10	43143	43152	40 %	0 %	20 %	40 %	38505718
620	NC_005230	CGA	2	6	43235	43240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505718
621	NC_005230	AAT	2	6	43338	43343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505718
622	NC_005230	GGA	2	6	43353	43358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505718
623	NC_005230	AGT	2	6	43403	43408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505718
624	NC_005230	CAG	3	9	43452	43460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505718
625	NC_005230	G	6	6	43464	43469	0 %	0 %	100 %	0 %	38505718
626	NC_005230	GGA	2	6	43496	43501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505718
627	NC_005230	TAG	2	6	43594	43599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505718
628	NC_005230	TAA	2	6	43637	43642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505718
629	NC_005230	T	6	6	43795	43800	0 %	100 %	0 %	0 %	38505719
630	NC_005230	TGA	2	6	43860	43865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505719
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747	NC_005230	TGG	2	6	51643	51648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505729
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882	NC_005230	AAGGCT	2	12	58963	58974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505734
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888	NC_005230	T	6	6	59556	59561	0 %	100 %	0 %	0 %	38505734
889	NC_005230	ATTTTT	2	12	59604	59615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	38505734
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