MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005229	AG	3	6	4236	4241	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
2	NC_005229	AT	3	6	6099	6104	50 %	50 %	0 %	0 %	38505540
3	NC_005229	TC	3	6	6474	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	38505540
4	NC_005229	GA	3	6	7024	7029	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
5	NC_005229	AC	3	6	8011	8016	50 %	0 %	0 %	50 %	38505540
6	NC_005229	CT	3	6	8029	8034	0 %	50 %	0 %	50 %	38505540
7	NC_005229	CT	3	6	9781	9786	0 %	50 %	0 %	50 %	38505540
8	NC_005229	TA	3	6	9802	9807	50 %	50 %	0 %	0 %	38505540
9	NC_005229	GC	4	8	10401	10408	0 %	0 %	50 %	50 %	38505540
10	NC_005229	GA	3	6	12783	12788	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
11	NC_005229	CT	3	6	18347	18352	0 %	50 %	0 %	50 %	38505547
12	NC_005229	CA	3	6	22064	22069	50 %	0 %	0 %	50 %	38505551
13	NC_005229	CT	3	6	22343	22348	0 %	50 %	0 %	50 %	38505551
14	NC_005229	AT	3	6	22706	22711	50 %	50 %	0 %	0 %	38505551
15	NC_005229	GA	3	6	23780	23785	50 %	0 %	50 %	0 %	38505553
16	NC_005229	AT	3	6	26475	26480	50 %	50 %	0 %	0 %	38505558
17	NC_005229	AT	3	6	26656	26661	50 %	50 %	0 %	0 %	38505558
18	NC_005229	TG	3	6	26889	26894	0 %	50 %	50 %	0 %	38505558
19	NC_005229	AT	3	6	27446	27451	50 %	50 %	0 %	0 %	38505559
20	NC_005229	TG	3	6	29873	29878	0 %	50 %	50 %	0 %	38505561
21	NC_005229	AG	3	6	31409	31414	50 %	0 %	50 %	0 %	38505564
22	NC_005229	GT	3	6	31432	31437	0 %	50 %	50 %	0 %	38505564
23	NC_005229	AT	3	6	31464	31469	50 %	50 %	0 %	0 %	38505564
24	NC_005229	AT	3	6	31501	31506	50 %	50 %	0 %	0 %	38505564
25	NC_005229	AT	3	6	31750	31755	50 %	50 %	0 %	0 %	38505564
26	NC_005229	CT	3	6	32304	32309	0 %	50 %	0 %	50 %	38505565
27	NC_005229	CT	3	6	36820	36825	0 %	50 %	0 %	50 %	38505572
28	NC_005229	GT	3	6	37385	37390	0 %	50 %	50 %	0 %	38505573
29	NC_005229	CA	3	6	40206	40211	50 %	0 %	0 %	50 %	38505576
30	NC_005229	AT	3	6	40955	40960	50 %	50 %	0 %	0 %	38505577
31	NC_005229	AT	3	6	43350	43355	50 %	50 %	0 %	0 %	38505581
32	NC_005229	CA	3	6	43860	43865	50 %	0 %	0 %	50 %	38505581
33	NC_005229	CA	3	6	48809	48814	50 %	0 %	0 %	50 %	38505585
34	NC_005229	CT	3	6	49845	49850	0 %	50 %	0 %	50 %	38505586
35	NC_005229	CT	3	6	49911	49916	0 %	50 %	0 %	50 %	38505586
36	NC_005229	CT	3	6	49944	49949	0 %	50 %	0 %	50 %	38505586
37	NC_005229	TC	3	6	53175	53180	0 %	50 %	0 %	50 %	38505589
38	NC_005229	GA	3	6	54486	54491	50 %	0 %	50 %	0 %	38505590
39	NC_005229	AC	3	6	57663	57668	50 %	0 %	0 %	50 %	38505592
40	NC_005229	GA	3	6	59825	59830	50 %	0 %	50 %	0 %	38505593
41	NC_005229	AT	3	6	61266	61271	50 %	50 %	0 %	0 %	38505595
42	NC_005229	TG	3	6	61454	61459	0 %	50 %	50 %	0 %	38505595
43	NC_005229	AG	3	6	62121	62126	50 %	0 %	50 %	0 %	38505595
44	NC_005229	CT	3	6	62670	62675	0 %	50 %	0 %	50 %	38505595
45	NC_005229	GA	3	6	63554	63559	50 %	0 %	50 %	0 %	38505595
46	NC_005229	CA	3	6	63734	63739	50 %	0 %	0 %	50 %	38505595
47	NC_005229	TA	3	6	70471	70476	50 %	50 %	0 %	0 %	38505604
48	NC_005229	GA	3	6	71362	71367	50 %	0 %	50 %	0 %	38505605
49	NC_005229	GA	3	6	72945	72950	50 %	0 %	50 %	0 %	38505608
50	NC_005229	GT	3	6	73783	73788	0 %	50 %	50 %	0 %	38505610
51	NC_005229	TC	3	6	74040	74045	0 %	50 %	0 %	50 %	38505610
52	NC_005229	AT	3	6	75036	75041	50 %	50 %	0 %	0 %	38505611
53	NC_005229	TG	3	6	77954	77959	0 %	50 %	50 %	0 %	38505614
54	NC_005229	AT	3	6	83996	84001	50 %	50 %	0 %	0 %	38505618
55	NC_005229	AG	3	6	85119	85124	50 %	0 %	50 %	0 %	38505619
56	NC_005229	CA	3	6	87687	87692	50 %	0 %	0 %	50 %	38505622
57	NC_005229	AG	3	6	88703	88708	50 %	0 %	50 %	0 %	38505623
58	NC_005229	AC	3	6	91398	91403	50 %	0 %	0 %	50 %	38505628
59	NC_005229	AT	3	6	94802	94807	50 %	50 %	0 %	0 %	38505632
60	NC_005229	CA	3	6	96171	96176	50 %	0 %	0 %	50 %	38505636
61	NC_005229	TC	3	6	98673	98678	0 %	50 %	0 %	50 %	38505640
62	NC_005229	TA	3	6	101949	101954	50 %	50 %	0 %	0 %	38505644
63	NC_005229	AT	3	6	105149	105154	50 %	50 %	0 %	0 %	38505647
64	NC_005229	GA	3	6	108098	108103	50 %	0 %	50 %	0 %	38505653
65	NC_005229	GA	3	6	108222	108227	50 %	0 %	50 %	0 %	38505653
66	NC_005229	CA	3	6	111670	111675	50 %	0 %	0 %	50 %	38505657
67	NC_005229	GA	3	6	112683	112688	50 %	0 %	50 %	0 %	38505659
68	NC_005229	TC	3	6	114296	114301	0 %	50 %	0 %	50 %	38505661
69	NC_005229	AT	3	6	114934	114939	50 %	50 %	0 %	0 %	38505662
70	NC_005229	AT	3	6	115122	115127	50 %	50 %	0 %	0 %	38505662
71	NC_005229	GA	3	6	116523	116528	50 %	0 %	50 %	0 %	38505663
72	NC_005229	CA	3	6	117392	117397	50 %	0 %	0 %	50 %	38505666
73	NC_005229	AT	3	6	118178	118183	50 %	50 %	0 %	0 %	38505666
74	NC_005229	TC	3	6	118190	118195	0 %	50 %	0 %	50 %	38505666

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.