MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 49312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005070	TCCAA	2	10	47230	47239	40 %	20 %	0 %	40 %	33864586
1002	NC_005070	GCA	2	6	47282	47287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864586
1003	NC_005070	CCG	2	6	47335	47340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864586
1004	NC_005070	CAC	2	6	47355	47360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864586
1005	NC_005070	CAT	2	6	47367	47372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864586
1006	NC_005070	CGG	2	6	47376	47381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864586
1007	NC_005070	CTT	2	6	47460	47465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864586
1008	NC_005070	GGC	2	6	47508	47513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864586
1009	NC_005070	AGA	2	6	47534	47539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864586
1010	NC_005070	GGA	2	6	47559	47564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864586
1011	NC_005070	TGG	2	6	47576	47581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864586
1012	NC_005070	TGA	2	6	47583	47588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864586
1013	NC_005070	CGG	2	6	47600	47605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864586
1014	NC_005070	CGC	2	6	47693	47698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864586
1015	NC_005070	CGG	2	6	47733	47738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864586
1016	NC_005070	ACC	2	6	47770	47775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864586
1017	NC_005070	CTGG	2	8	47778	47785	0 %	25 %	50 %	25 %	33864586
1018	NC_005070	CCG	2	6	47796	47801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864586
1019	NC_005070	GGT	2	6	47856	47861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864586
1020	NC_005070	CGG	2	6	47864	47869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864586
1021	NC_005070	CCA	2	6	47902	47907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864586
1022	NC_005070	CGG	2	6	47943	47948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864586
1023	NC_005070	TGGTT	2	10	47962	47971	0 %	60 %	40 %	0 %	33864586
1024	NC_005070	TTG	2	6	47999	48004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864586
1025	NC_005070	GAACC	2	10	48084	48093	40 %	0 %	20 %	40 %	33864586
1026	NC_005070	GCC	2	6	48113	48118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864587
1027	NC_005070	CCAGC	2	10	48176	48185	20 %	0 %	20 %	60 %	33864587
1028	NC_005070	GCGG	2	8	48205	48212	0 %	0 %	75 %	25 %	33864587
1029	NC_005070	CGG	2	6	48234	48239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864587
1030	NC_005070	CAG	2	6	48247	48252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864587
1031	NC_005070	TGGC	2	8	48257	48264	0 %	25 %	50 %	25 %	33864587
1032	NC_005070	GGC	2	6	48277	48282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864587
1033	NC_005070	ATG	2	6	48335	48340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864587
1034	NC_005070	CCG	2	6	48350	48355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864587
1035	NC_005070	CAC	2	6	48367	48372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864587
1036	NC_005070	CAG	2	6	48397	48402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864587
1037	NC_005070	CGC	2	6	48447	48452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864587
1038	NC_005070	TTC	2	6	48472	48477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864587
1039	NC_005070	GGT	2	6	48499	48504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864587
1040	NC_005070	CCA	2	6	48555	48560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864587
1041	NC_005070	CGGA	2	8	48595	48602	25 %	0 %	50 %	25 %	33864587
1042	NC_005070	ACA	3	9	48642	48650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864587
1043	NC_005070	GTC	2	6	48661	48666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864587
1044	NC_005070	C	6	6	48671	48676	0 %	0 %	0 %	100 %	33864587
1045	NC_005070	AGC	2	6	48815	48820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864587
1046	NC_005070	GGC	2	6	48832	48837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864587
1047	NC_005070	CAG	2	6	48853	48858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864587
1048	NC_005070	CATGCC	2	12	48868	48879	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33864587
1049	NC_005070	GGTG	2	8	48903	48910	0 %	25 %	75 %	0 %	33864587
1050	NC_005070	GCCA	2	8	48947	48954	25 %	0 %	25 %	50 %	33864587
1051	NC_005070	C	6	6	48959	48964	0 %	0 %	0 %	100 %	33864587
1052	NC_005070	CGG	2	6	48975	48980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864587
1053	NC_005070	GAC	2	6	48985	48990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864587
1054	NC_005070	TCA	2	6	49154	49159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864587
1055	NC_005070	CCA	2	6	49167	49172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864587
1056	NC_005070	GAA	2	6	49237	49242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864587
1057	NC_005070	AGG	2	6	49270	49275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864588
1058	NC_005070	TGCGGT	2	12	49327	49338	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	33864588
1059	NC_005070	CCA	2	6	49369	49374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864588
1060	NC_005070	CTTC	2	8	49375	49382	0 %	50 %	0 %	50 %	33864588
1061	NC_005070	GTG	2	6	49401	49406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864588
1062	NC_005070	AGC	2	6	49429	49434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1063	NC_005070	GTT	2	6	49487	49492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864588
1064	NC_005070	GGC	2	6	49511	49516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864588
1065	NC_005070	CTT	2	6	49520	49525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864588
1066	NC_005070	TGG	2	6	49542	49547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864588
1067	NC_005070	TGGG	2	8	49587	49594	0 %	25 %	75 %	0 %	33864588
1068	NC_005070	G	7	7	49592	49598	0 %	0 %	100 %	0 %	33864588
1069	NC_005070	CGCAC	2	10	49618	49627	20 %	0 %	20 %	60 %	33864588
1070	NC_005070	TGAA	2	8	49641	49648	50 %	25 %	25 %	0 %	33864588
1071	NC_005070	GCC	2	6	49661	49666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864588
1072	NC_005070	AAG	2	6	49710	49715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864588
1073	NC_005070	CGT	2	6	49741	49746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1074	NC_005070	TTG	2	6	49848	49853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864588
1075	NC_005070	TCC	2	6	49929	49934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864588
1076	NC_005070	TGG	2	6	49990	49995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864588
1077	NC_005070	AGCCGT	2	12	50008	50019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1078	NC_005070	CAC	2	6	50042	50047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864588
1079	NC_005070	GGC	2	6	50075	50080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864588
1080	NC_005070	CAG	2	6	50081	50086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1081	NC_005070	GTT	2	6	50105	50110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864588
1082	NC_005070	TGG	2	6	50128	50133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864588
1083	NC_005070	GCT	2	6	50135	50140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1084	NC_005070	TCC	2	6	50199	50204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864588
1085	NC_005070	AGC	2	6	50205	50210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1086	NC_005070	CAG	2	6	50216	50221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864588
1087	NC_005070	GCC	2	6	50270	50275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864588
1088	NC_005070	TCC	2	6	50280	50285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864588
1089	NC_005070	CCG	2	6	50442	50447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864588
1090	NC_005070	AGCC	2	8	50567	50574	25 %	0 %	25 %	50 %	33864589
1091	NC_005070	ACC	2	6	50586	50591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864589
1092	NC_005070	CAT	2	6	50595	50600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864589
1093	NC_005070	CGGCTG	2	12	50620	50631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33864589
1094	NC_005070	CCG	2	6	50686	50691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864589
1095	NC_005070	TCT	2	6	50692	50697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864589
1096	NC_005070	GTG	2	6	50698	50703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864589
1097	NC_005070	GCT	2	6	50810	50815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864590
1098	NC_005070	CCT	2	6	50848	50853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864590
1099	NC_005070	CGG	2	6	50856	50861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864590
1100	NC_005070	GCCG	2	8	50866	50873	0 %	0 %	50 %	50 %	33864590
1101	NC_005070	GGC	2	6	50927	50932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864590
1102	NC_005070	CGA	2	6	51031	51036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864590
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1105	NC_005070	GCA	2	6	51190	51195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864590
1106	NC_005070	GTT	2	6	51217	51222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864590
1107	NC_005070	GCA	2	6	51253	51258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864590
1108	NC_005070	TCC	2	6	51303	51308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864590
1109	NC_005070	CCAG	2	8	51312	51319	25 %	0 %	25 %	50 %	33864590
1110	NC_005070	CCT	2	6	51358	51363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864590
1111	NC_005070	GCA	2	6	51391	51396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864590
1112	NC_005070	GCAG	2	8	51488	51495	25 %	0 %	50 %	25 %	33864590
1113	NC_005070	GCG	2	6	51569	51574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864590
1114	NC_005070	GCC	2	6	51575	51580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864590
1115	NC_005070	TGGG	2	8	51613	51620	0 %	25 %	75 %	0 %	33864590
1116	NC_005070	CGA	2	6	51790	51795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864591
1117	NC_005070	CGA	2	6	51843	51848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864591
1118	NC_005070	GCA	2	6	51963	51968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864591
1119	NC_005070	TGG	2	6	52165	52170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864591
1120	NC_005070	AGC	2	6	52187	52192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864591
1121	NC_005070	AGC	2	6	52361	52366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864592
1122	NC_005070	TGCT	2	8	52439	52446	0 %	50 %	25 %	25 %	33864592
1123	NC_005070	TTC	2	6	52460	52465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864592
1124	NC_005070	AGC	2	6	52468	52473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864592
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1126	NC_005070	TCA	2	6	52523	52528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864592
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1378	NC_005070	TGC	2	6	63308	63313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864602
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1493	NC_005070	GCG	2	6	67933	67938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864606
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1496	NC_005070	CGG	2	6	68198	68203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864606
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1499	NC_005070	GCGG	2	8	68313	68320	0 %	0 %	75 %	25 %	33864606
1500	NC_005070	TGC	3	9	68360	68368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864606

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