MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 49312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005070	AACC	2	8	228145	228152	50 %	0 %	0 %	50 %	33864764
5002	NC_005070	CCT	2	6	228207	228212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864765
5003	NC_005070	CGG	2	6	228270	228275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864765
5004	NC_005070	AGC	2	6	228341	228346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5005	NC_005070	ATC	2	6	228365	228370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864765
5006	NC_005070	CAC	2	6	228418	228423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5007	NC_005070	GGC	3	9	228427	228435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864765
5008	NC_005070	CAC	2	6	228472	228477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5009	NC_005070	CCAGTT	2	12	228591	228602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33864765
5010	NC_005070	TGC	2	6	228687	228692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5011	NC_005070	AGA	2	6	228759	228764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864765
5012	NC_005070	TCCA	2	8	228768	228775	25 %	25 %	0 %	50 %	33864765
5013	NC_005070	GAA	2	6	228853	228858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864765
5014	NC_005070	CAGGC	2	10	228874	228883	20 %	0 %	40 %	40 %	33864765
5015	NC_005070	AGC	4	12	228887	228898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5016	NC_005070	GCC	2	6	228902	228907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864765
5017	NC_005070	AGC	2	6	228998	229003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5018	NC_005070	ACC	3	9	229004	229012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5019	NC_005070	CGG	2	6	229056	229061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864765
5020	NC_005070	GA	3	6	229079	229084	50 %	0 %	50 %	0 %	33864765
5021	NC_005070	ACC	2	6	229121	229126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5022	NC_005070	TCCA	2	8	229156	229163	25 %	25 %	0 %	50 %	33864765
5023	NC_005070	CAC	2	6	229177	229182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5024	NC_005070	CAG	2	6	229189	229194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5025	NC_005070	CCG	2	6	229219	229224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864765
5026	NC_005070	TGG	5	15	229245	229259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864765
5027	NC_005070	CCA	2	6	229260	229265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5028	NC_005070	GCC	2	6	229333	229338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864765
5029	NC_005070	CAG	2	6	229420	229425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5030	NC_005070	CAC	2	6	229482	229487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5031	NC_005070	CCAT	2	8	229551	229558	25 %	25 %	0 %	50 %	33864765
5032	NC_005070	ACC	2	6	229643	229648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5033	NC_005070	CAG	2	6	229657	229662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864765
5034	NC_005070	CCA	2	6	229696	229701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864765
5035	NC_005070	GGA	2	6	229714	229719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864765
5036	NC_005070	TGG	2	6	229757	229762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864766
5037	NC_005070	CAG	2	6	229766	229771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5038	NC_005070	CGG	2	6	229782	229787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864766
5039	NC_005070	GCT	2	6	229788	229793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5040	NC_005070	CGC	2	6	229794	229799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864766
5041	NC_005070	GCC	2	6	229858	229863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864766
5042	NC_005070	TCA	2	6	229935	229940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864766
5043	NC_005070	AGGA	2	8	229982	229989	50 %	0 %	50 %	0 %	33864766
5044	NC_005070	CAG	2	6	229993	229998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5045	NC_005070	CGG	2	6	230014	230019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864766
5046	NC_005070	GTA	2	6	230131	230136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864766
5047	NC_005070	CGT	2	6	230145	230150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5048	NC_005070	CAG	3	9	230272	230280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5049	NC_005070	CAC	2	6	230302	230307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864766
5050	NC_005070	CTG	2	6	230398	230403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5051	NC_005070	CGG	2	6	230463	230468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864766
5052	NC_005070	GC	3	6	230515	230520	0 %	0 %	50 %	50 %	33864766
5053	NC_005070	GGCATC	2	12	230527	230538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5054	NC_005070	GGCG	2	8	230577	230584	0 %	0 %	75 %	25 %	33864766
5055	NC_005070	CAG	2	6	230635	230640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5056	NC_005070	GCT	2	6	230658	230663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5057	NC_005070	TCC	3	9	230678	230686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864766
5058	NC_005070	CCT	2	6	230703	230708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864766
5059	NC_005070	GCT	2	6	230770	230775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5060	NC_005070	CAG	2	6	230806	230811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5061	NC_005070	CAC	2	6	230812	230817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864766
5062	NC_005070	GC	3	6	230833	230838	0 %	0 %	50 %	50 %	33864766
5063	NC_005070	GCG	2	6	230846	230851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864766
5064	NC_005070	GCCA	2	8	230860	230867	25 %	0 %	25 %	50 %	33864766
5065	NC_005070	GCC	2	6	230869	230874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864766
5066	NC_005070	CGA	2	6	230877	230882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
5067	NC_005070	GAC	2	6	230884	230889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864766
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5069	NC_005070	GCG	2	6	230926	230931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864767
5070	NC_005070	GGC	2	6	230967	230972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864767
5071	NC_005070	GCG	2	6	231042	231047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864767
5072	NC_005070	CACG	2	8	231056	231063	25 %	0 %	25 %	50 %	33864767
5073	NC_005070	CAC	2	6	231237	231242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864767
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5083	NC_005070	TCGC	2	8	231805	231812	0 %	25 %	25 %	50 %	33864768
5084	NC_005070	CAG	2	6	231847	231852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864768
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5088	NC_005070	CAT	2	6	231993	231998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864769
5089	NC_005070	TGG	2	6	232000	232005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864769
5090	NC_005070	CACT	2	8	232027	232034	25 %	25 %	0 %	50 %	33864769
5091	NC_005070	GCT	2	6	232052	232057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864769
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5093	NC_005070	TGG	2	6	232133	232138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864769
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5095	NC_005070	TCG	2	6	232222	232227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864769
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5102	NC_005070	GTGGGT	2	12	232581	232592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864769
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5105	NC_005070	CAGT	2	8	232910	232917	25 %	25 %	25 %	25 %	33864769
5106	NC_005070	GGC	2	6	232947	232952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864769
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5109	NC_005070	T	6	6	233164	233169	0 %	100 %	0 %	0 %	33864770
5110	NC_005070	GCC	2	6	233239	233244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864770
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5112	NC_005070	G	6	6	233253	233258	0 %	0 %	100 %	0 %	33864770
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5119	NC_005070	TGC	2	6	233606	233611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864770
5120	NC_005070	CAGCA	2	10	233703	233712	40 %	0 %	20 %	40 %	33864771
5121	NC_005070	GCA	2	6	233750	233755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864771
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5123	NC_005070	TGGC	2	8	233791	233798	0 %	25 %	50 %	25 %	33864771
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5240	NC_005070	TTC	2	6	238763	238768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864775
5241	NC_005070	CTGCGA	2	12	238790	238801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33864775
5242	NC_005070	GGA	2	6	238825	238830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864775
5243	NC_005070	GCA	2	6	238844	238849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864775
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5246	NC_005070	TGC	2	6	239022	239027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864775
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5368	NC_005070	GGC	2	6	244023	244028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864777
5369	NC_005070	AC	3	6	244055	244060	50 %	0 %	0 %	50 %	33864777
5370	NC_005070	GCA	2	6	244134	244139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864777
5371	NC_005070	CAC	2	6	244168	244173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864777
5372	NC_005070	ATCG	3	12	244181	244192	25 %	25 %	25 %	25 %	33864777
5373	NC_005070	GAT	2	6	244215	244220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864777
5374	NC_005070	CAC	2	6	244249	244254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864777
5375	NC_005070	CAC	3	9	244317	244325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864778
5376	NC_005070	CCG	2	6	244338	244343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864778
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5378	NC_005070	TCAG	2	8	244386	244393	25 %	25 %	25 %	25 %	33864778
5379	NC_005070	GTG	3	9	244415	244423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864778
5380	NC_005070	GATGAC	2	12	244449	244460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33864778
5381	NC_005070	GTG	2	6	244564	244569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864778
5382	NC_005070	CCG	2	6	244574	244579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864778
5383	NC_005070	CGC	2	6	244611	244616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864778
5384	NC_005070	CCAG	2	8	244734	244741	25 %	0 %	25 %	50 %	33864778
5385	NC_005070	GAGT	2	8	244841	244848	25 %	25 %	50 %	0 %	33864778
5386	NC_005070	CGG	2	6	244878	244883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864778
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5388	NC_005070	CTGC	2	8	245002	245009	0 %	25 %	25 %	50 %	33864778
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5396	NC_005070	CAG	2	6	245342	245347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864780
5397	NC_005070	ACG	2	6	245431	245436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864780
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5400	NC_005070	GCA	2	6	245629	245634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864780
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5404	NC_005070	GCCA	2	8	245829	245836	25 %	0 %	25 %	50 %	33864780
5405	NC_005070	GGCA	2	8	245851	245858	25 %	0 %	50 %	25 %	33864780
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5407	NC_005070	GCGTG	2	10	245944	245953	0 %	20 %	60 %	20 %	33864780
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5421	NC_005070	GCG	2	6	246592	246597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864781
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5432	NC_005070	TGC	2	6	246950	246955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864781
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5455	NC_005070	GCG	2	6	247997	248002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864782
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5471	NC_005070	TCG	2	6	248856	248861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864783
5472	NC_005070	TC	3	6	248899	248904	0 %	50 %	0 %	50 %	33864783
5473	NC_005070	CGA	2	6	248908	248913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864783
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5476	NC_005070	CGTT	2	8	248943	248950	0 %	50 %	25 %	25 %	33864783
5477	NC_005070	TCT	2	6	249007	249012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864784
5478	NC_005070	AGC	2	6	249256	249261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864784
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5482	NC_005070	CCA	2	6	249416	249421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864784
5483	NC_005070	GGC	2	6	249441	249446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864784
5484	NC_005070	ATC	2	6	249474	249479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864784
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5488	NC_005070	GGT	2	6	249762	249767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864785
5489	NC_005070	CGG	2	6	249797	249802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864785
5490	NC_005070	TGC	2	6	249824	249829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864785
5491	NC_005070	AGC	2	6	249847	249852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864785
5492	NC_005070	TGG	3	9	249874	249882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864785
5493	NC_005070	CTC	2	6	250034	250039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864785
5494	NC_005070	GGC	2	6	250046	250051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864785
5495	NC_005070	GCC	2	6	250090	250095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864785
5496	NC_005070	TGGC	2	8	250156	250163	0 %	25 %	50 %	25 %	33864785
5497	NC_005070	AGC	2	6	250179	250184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864785
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5499	NC_005070	CAA	2	6	250319	250324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864785
5500	NC_005070	GTG	3	9	250401	250409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864785

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