MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-03

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005006	TAA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470573
2	NC_005006	TCA	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
3	NC_005006	ACC	2	6	660	665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470573
4	NC_005006	TGA	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
5	NC_005006	TTA	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
6	NC_005006	CAA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
7	NC_005006	TGA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
8	NC_005006	TGT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
9	NC_005006	ACT	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
10	NC_005006	TGT	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
11	NC_005006	CAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
12	NC_005006	GGT	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470573
13	NC_005006	GTT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
14	NC_005006	CTC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470573
15	NC_005006	ATA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470573
16	NC_005006	ATC	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
17	NC_005006	ATC	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
18	NC_005006	TAT	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
19	NC_005006	ACA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
20	NC_005006	GGT	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470573
21	NC_005006	CAA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
22	NC_005006	CTA	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
23	NC_005006	GCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470573
24	NC_005006	TGA	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
25	NC_005006	TCA	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
26	NC_005006	AAG	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
27	NC_005006	CAA	3	9	2519	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
28	NC_005006	TGA	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
29	NC_005006	TTA	2	6	2693	2698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
30	NC_005006	TTC	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470573
31	NC_005006	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
32	NC_005006	TGT	2	6	2999	3004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
33	NC_005006	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
34	NC_005006	TGT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
35	NC_005006	GAA	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
36	NC_005006	GAT	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
37	NC_005006	AAC	2	6	3298	3303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
38	NC_005006	TGA	2	6	3348	3353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
39	NC_005006	TTG	2	6	3356	3361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
40	NC_005006	CAA	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
41	NC_005006	GAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
42	NC_005006	TTA	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
43	NC_005006	TAT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
44	NC_005006	GAA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
45	NC_005006	TTA	2	6	3651	3656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
46	NC_005006	TGT	2	6	3787	3792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470574
47	NC_005006	ATT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470574
48	NC_005006	ATG	3	9	3819	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470574
49	NC_005006	AAT	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470574
50	NC_005006	TAA	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470574
51	NC_005006	CAA	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470575
52	NC_005006	TTG	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470575
53	NC_005006	AAC	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470575
54	NC_005006	AAC	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470575
55	NC_005006	GAT	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470575
56	NC_005006	TAA	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470575
57	NC_005006	TTA	2	6	4569	4574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470575
58	NC_005006	AAG	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470575
59	NC_005006	TTG	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470575
60	NC_005006	GAG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470575
61	NC_005006	ATA	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470575
62	NC_005006	AGA	2	6	4860	4865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470576
63	NC_005006	ACA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470576
64	NC_005006	GTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470576
65	NC_005006	GAT	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470576
66	NC_005006	TCA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470576
67	NC_005006	CAT	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470576
68	NC_005006	CAT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470577
69	NC_005006	GAT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470577
70	NC_005006	CAA	2	6	5954	5959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470577
71	NC_005006	ATA	2	6	6143	6148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470578
72	NC_005006	AAG	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470578
73	NC_005006	ATT	2	6	6178	6183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470578
74	NC_005006	CAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
75	NC_005006	GAT	2	6	6610	6615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470578
76	NC_005006	GAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470578
77	NC_005006	CAA	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
78	NC_005006	AGA	2	6	6786	6791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470578
79	NC_005006	ACA	2	6	6876	6881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
80	NC_005006	CAA	3	9	6883	6891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
81	NC_005006	GAT	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470578
82	NC_005006	TGA	3	9	6948	6956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470578
83	NC_005006	GAG	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470578
84	NC_005006	ACA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
85	NC_005006	AAC	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
86	NC_005006	ACA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
87	NC_005006	AGG	2	6	7377	7382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470579
88	NC_005006	CAA	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470579
89	NC_005006	AAG	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470579
90	NC_005006	TGG	2	6	7461	7466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470579
91	NC_005006	TTG	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470579
92	NC_005006	TGT	2	6	7483	7488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470579
93	NC_005006	GTT	2	6	7489	7494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470579
94	NC_005006	CAA	2	6	7551	7556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470579
95	NC_005006	AAC	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470580
96	NC_005006	GTG	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470580
97	NC_005006	ACA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470580
98	NC_005006	GTT	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470580
99	NC_005006	GAA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470580
100	NC_005006	TTA	2	6	7984	7989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470580
101	NC_005006	CAA	3	9	7993	8001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470580

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.