MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	TAA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470533
2	NC_005004	ATT	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470533
3	NC_005004	TTC	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470533
4	NC_005004	TAA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470533
5	NC_005004	AGA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
6	NC_005004	TCA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470534
7	NC_005004	TAA	2	6	643	648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
8	NC_005004	GAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
9	NC_005004	ATA	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
10	NC_005004	AAG	2	6	1002	1007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
11	NC_005004	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470534
12	NC_005004	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470534
13	NC_005004	AGC	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470534
14	NC_005004	AAT	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
15	NC_005004	ATA	2	6	1581	1586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
16	NC_005004	CTT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470534
17	NC_005004	TAA	2	6	1684	1689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
18	NC_005004	ATT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
19	NC_005004	TGA	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470534
20	NC_005004	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
21	NC_005004	GTG	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470534
22	NC_005004	GGA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470534
23	NC_005004	TAC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470534
24	NC_005004	TAG	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470534
25	NC_005004	TTA	2	6	1973	1978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
26	NC_005004	TCT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470534
27	NC_005004	GTT	2	6	2132	2137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470534
28	NC_005004	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470534
29	NC_005004	AAT	2	6	2150	2155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470534
30	NC_005004	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470534
31	NC_005004	GTT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470535
32	NC_005004	ATA	2	6	2627	2632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
33	NC_005004	CTT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470535
34	NC_005004	TAA	3	9	2708	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
35	NC_005004	TAT	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
36	NC_005004	TAT	2	6	2760	2765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
37	NC_005004	ACA	2	6	2862	2867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470535
38	NC_005004	ATA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
39	NC_005004	TAA	2	6	2975	2980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
40	NC_005004	TTA	2	6	2999	3004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
41	NC_005004	TTG	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470535
42	NC_005004	TTA	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
43	NC_005004	ACA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470535
44	NC_005004	AGT	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470535
45	NC_005004	ATA	2	6	3638	3643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
46	NC_005004	ACA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470535
47	NC_005004	TTA	2	6	3712	3717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
48	NC_005004	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
49	NC_005004	TAT	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
50	NC_005004	AAT	2	6	3883	3888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470535
51	NC_005004	CTA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470535
52	NC_005004	TTA	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
53	NC_005004	GGC	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470535
54	NC_005004	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
55	NC_005004	TTA	2	6	4069	4074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
56	NC_005004	ATT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
57	NC_005004	AGA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470535
58	NC_005004	ATT	2	6	4206	4211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
59	NC_005004	ATT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470535
60	NC_005004	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470536
61	NC_005004	TTA	2	6	4427	4432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470536
62	NC_005004	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470536
63	NC_005004	TAC	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470536
64	NC_005004	AAC	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470536
65	NC_005004	AGA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470537
66	NC_005004	AAT	2	6	4724	4729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
67	NC_005004	AGA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470537
68	NC_005004	TTA	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
69	NC_005004	ATA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
70	NC_005004	GAT	2	6	4824	4829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470537
71	NC_005004	ATT	2	6	4836	4841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
72	NC_005004	GCA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470537
73	NC_005004	TAT	2	6	4952	4957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
74	NC_005004	TAA	3	9	4984	4992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
75	NC_005004	AAT	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
76	NC_005004	AAT	2	6	5072	5077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470537
77	NC_005004	ATT	2	6	5078	5083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
78	NC_005004	TTA	2	6	5140	5145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470537
79	NC_005004	TAA	2	6	6607	6612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470538
80	NC_005004	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470538
81	NC_005004	CTT	2	6	6666	6671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470538
82	NC_005004	AAT	2	6	6681	6686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470538
83	NC_005004	TCA	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470538
84	NC_005004	CTA	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470538
85	NC_005004	CTT	2	6	6777	6782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470538
86	NC_005004	TGA	2	6	6892	6897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470538
87	NC_005004	AAT	2	6	6913	6918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470538
88	NC_005004	TTA	2	6	8222	8227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
89	NC_005004	TTA	2	6	8267	8272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
90	NC_005004	CTT	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470539
91	NC_005004	TAA	2	6	8392	8397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
92	NC_005004	AAT	2	6	8402	8407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
93	NC_005004	ACC	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470539
94	NC_005004	ATA	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
95	NC_005004	TTA	2	6	8553	8558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
96	NC_005004	TTA	2	6	8585	8590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
97	NC_005004	TCT	2	6	8868	8873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470539
98	NC_005004	TAT	3	9	8875	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
99	NC_005004	TAA	2	6	8962	8967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
100	NC_005004	TAT	2	6	9004	9009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
101	NC_005004	AGA	2	6	9089	9094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470539
102	NC_005004	AAG	2	6	9108	9113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470539
103	NC_005004	GAA	2	6	9316	9321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470539
104	NC_005004	ATG	2	6	9429	9434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470539
105	NC_005004	TAA	2	6	9604	9609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
106	NC_005004	ATG	2	6	9692	9697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470539
107	NC_005004	TCT	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470539
108	NC_005004	ATT	2	6	9748	9753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
109	NC_005004	TAA	2	6	9820	9825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470539
110	NC_005004	GGT	2	6	9828	9833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470539
111	NC_005004	TAT	2	6	9866	9871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470539
112	NC_005004	AAG	2	6	10072	10077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470540
113	NC_005004	TCA	2	6	10167	10172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470540
114	NC_005004	AGA	2	6	10181	10186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470540
115	NC_005004	TAA	2	6	10220	10225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470540
116	NC_005004	GAA	2	6	10275	10280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470540
117	NC_005004	GAA	2	6	10299	10304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470540
118	NC_005004	TTG	2	6	10776	10781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470541
119	NC_005004	GGA	2	6	10813	10818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470541
120	NC_005004	AGA	2	6	10873	10878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470541
121	NC_005004	ATT	3	9	10915	10923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470541
122	NC_005004	GCA	2	6	10934	10939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470541
123	NC_005004	TTC	2	6	10975	10980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470541
124	NC_005004	GGA	2	6	11155	11160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470541
125	NC_005004	AAG	2	6	11218	11223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470542
126	NC_005004	ATA	2	6	11241	11246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470542
127	NC_005004	GAA	2	6	11343	11348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470542
128	NC_005004	ATA	2	6	11368	11373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470542
129	NC_005004	ATT	2	6	11488	11493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470542
130	NC_005004	AAT	2	6	11502	11507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470542
131	NC_005004	TAT	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470542
132	NC_005004	ATT	2	6	11730	11735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470542
133	NC_005004	AAT	2	6	12054	12059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470542
134	NC_005004	GAA	2	6	12096	12101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470542
135	NC_005004	AAC	2	6	12220	12225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470542
136	NC_005004	TAT	3	9	12232	12240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470542
137	NC_005004	GCT	2	6	12318	12323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470542
138	NC_005004	ATT	2	6	12433	12438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470542
139	NC_005004	ACA	2	6	12458	12463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470542
140	NC_005004	AGA	2	6	12477	12482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470542
141	NC_005004	CAC	2	6	12515	12520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470542
142	NC_005004	GAA	2	6	12534	12539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470542
143	NC_005004	TCT	2	6	12730	12735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470543
144	NC_005004	TGA	2	6	12813	12818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470543
145	NC_005004	TAT	2	6	12821	12826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470543
146	NC_005004	TAG	2	6	13001	13006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470543
147	NC_005004	ATG	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470543
148	NC_005004	CAT	2	6	13189	13194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470543
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154	NC_005004	TAT	2	6	13756	13761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470544
155	NC_005004	GAA	2	6	13767	13772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470544
156	NC_005004	TGA	2	6	13777	13782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470544
157	NC_005004	ATT	2	6	13868	13873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470544
158	NC_005004	ACG	2	6	13877	13882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470544
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161	NC_005004	GAA	2	6	14231	14236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470544
162	NC_005004	GAT	2	6	14246	14251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470544
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164	NC_005004	TGG	2	6	14569	14574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470544
165	NC_005004	TTA	2	6	14598	14603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470544
166	NC_005004	TTC	2	6	15099	15104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470545
167	NC_005004	TTA	2	6	15214	15219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470545
168	NC_005004	TTG	2	6	15273	15278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470545
169	NC_005004	ATC	2	6	15303	15308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470545
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171	NC_005004	CTT	2	6	15414	15419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470545
172	NC_005004	TAC	2	6	15471	15476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470545
173	NC_005004	TAA	2	6	15540	15545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470545
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177	NC_005004	CAT	2	6	15809	15814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470545
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179	NC_005004	ATA	2	6	15882	15887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470545
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249	NC_005004	ATT	2	6	23015	23020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470553
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251	NC_005004	TAT	2	6	23501	23506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470554
252	NC_005004	GAT	2	6	23583	23588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470554
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254	NC_005004	TGA	2	6	23675	23680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470554
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256	NC_005004	TGA	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470554
257	NC_005004	AAT	2	6	23901	23906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470554
258	NC_005004	TAA	2	6	23981	23986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470554
259	NC_005004	ATA	3	9	24040	24048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470554
260	NC_005004	TAA	2	6	24059	24064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470554
261	NC_005004	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470554
262	NC_005004	GAA	2	6	24132	24137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470554
263	NC_005004	ATT	2	6	24157	24162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470554
264	NC_005004	TAT	2	6	24191	24196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470554
265	NC_005004	TAA	2	6	24230	24235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470554
266	NC_005004	AGA	2	6	24260	24265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.