MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-06

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005003	CTT	2	6	69	74	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470521
2	NC_005003	AAC	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470521
3	NC_005003	ATC	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470522
4	NC_005003	TAA	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
5	NC_005003	ATT	2	6	438	443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
6	NC_005003	ATA	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
7	NC_005003	TAT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
8	NC_005003	CTA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470522
9	NC_005003	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
10	NC_005003	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
11	NC_005003	AAT	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
12	NC_005003	AGC	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470522
13	NC_005003	CGA	2	6	1506	1511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470523
14	NC_005003	ACA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470523
15	NC_005003	CAA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470524
16	NC_005003	ATC	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470525
17	NC_005003	AAT	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470525
18	NC_005003	ACG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
19	NC_005003	ACG	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
20	NC_005003	GAA	2	6	2593	2598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470525
21	NC_005003	AGG	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470525
22	NC_005003	ACG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
23	NC_005003	ACA	3	9	2766	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470525
24	NC_005003	TTG	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470525
25	NC_005003	ATT	2	6	3001	3006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470525
26	NC_005003	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470526
27	NC_005003	AGA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470526
28	NC_005003	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470526
29	NC_005003	AAT	3	9	3227	3235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470526
30	NC_005003	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470527
31	NC_005003	TAA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
32	NC_005003	TAA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
33	NC_005003	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
34	NC_005003	AGA	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
35	NC_005003	TTA	2	6	4651	4656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470528
36	NC_005003	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470528
37	NC_005003	TGA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470528
38	NC_005003	TAA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
39	NC_005003	AGA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
40	NC_005003	AAC	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470528
41	NC_005003	CCA	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470529
42	NC_005003	ATT	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
43	NC_005003	ATG	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470529
44	NC_005003	TTA	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
45	NC_005003	TGT	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470529
46	NC_005003	ATT	2	6	5685	5690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
47	NC_005003	TCC	3	9	5691	5699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470529
48	NC_005003	AGA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470529
49	NC_005003	ACT	2	6	5777	5782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470529
50	NC_005003	CTT	2	6	5785	5790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470529
51	NC_005003	TTG	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470530
52	NC_005003	CAA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470530

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.